Dans une récente étude publiée dans la revue Cellule, les chercheurs ont évalué la reconnaissance croisée induite par la vaccination contre le coronavirus 2 (SRAS-CoV-2) du syndrome respiratoire aigu sévère des réponses des lymphocytes T parmi les variantes précoces et nouvelles du SRAS-CoV-2.
Étude : La vaccination contre le SRAS-CoV-2 induit une mémoire immunologique des cellules T capable de reconnaître les variantes d’Alpha à Omicron. Crédit d’image : BaLL LunLa/Shutterstock
Sommaire
Fond
Le monde a été témoin de l’émergence de plusieurs variantes préoccupantes (COV) du SRAS-CoV-2 pendant la pandémie de maladie à coronavirus 2019 (COVID-19). Une compréhension approfondie des caractéristiques immunologiques et virologiques des variantes du SRAS-CoV-2 est nécessaire pour développer des vaccins spécifiques aux variantes ou pan-coronavirus et programmer des campagnes de vaccination et de rappel pour atténuer le COVID-19.
Cependant, il existe un énorme manque de connaissances dans la compréhension des réponses des cellules T et B induites par le vaccin contre les variants du SRAS-CoV-2.
À propos de l’étude
Dans l’étude actuelle, les chercheurs ont évalué un large panel de variantes du SRAS-CoV-2 pour déterminer l’effet de variantes récentes telles que Delta et Omicron sur les cellules T et B mémoire induites par le vaccin COVID-19 par rapport aux premières variantes telles que Alpha, Bêta, Gamma et Epsilon. L’équipe a également évalué les réponses adaptatives induites par plusieurs plateformes vaccinales. Les vaccins évalués étaient BNT162b2, Ad26.COV2.S, NVX-CoV2373 et mRNA-1273.
Les associations de mutation d’épitope de classe I des variantes du SRAS-CoV-2 avec la liaison de l’antigène leucocytaire humain (HLA) ont été déterminées à l’aide d’outils bioinformatiques spécifiques à HLA.
La reconnaissance des lymphocytes T de plusieurs variants chez les donneurs vaccinés a été mesurée expérimentalement à différents moments. À 3,5 mois après la vaccination, la réponse des lymphocytes T a été mesurée à l’aide de la coloration intracellulaire des cytokines (ICS). En outre, les réponses des lymphocytes T ont été évaluées après près de six à sept mois de vaccination par des tests de marqueurs induits par l’activation (AIM) et des ICS. De plus, les réponses des lymphocytes B ont été déterminées à l’aide de méthodes de cytométrie en flux.
Résultats
Les résultats ont indiqué que la capacité de liaison HLA était significativement conservée parmi la majorité des mutations d’épitopes de classe I dans Omicron. Ainsi, la capacité obligatoire de HLA n’était pas différente pour des épitopes d’Omicron et d’autres variantes SARS-CoV-2.
Les réponses des lymphocytes T induites par les vaccinations NVX-CoV2373, Ad26.COV2.S, ARNm-1273 et BNT162b2 étaient présentes contre les variantes ancestrales du SRAS-CoV-2 et les variantes Delta et Omicron alors que la post-vaccination, les cellules B mémoire et les anticorps neutralisants contre les variants du SRAS-CoV-2 ont montré une réduction globale significative.
Une variabilité considérablement plus élevée de la réponse des lymphocytes T a été observée avec le vaccin Ad26.COV2.S, probablement parce qu’il cible la région S1 du pic (S), alors que les autres vaccins sont associés à une réponse plus large des lymphocytes T spécifiques au S.
Après 3,5 mois de vaccination, les effets protecteurs des lymphocytes T ont montré une diminution significative pour Delta lorsqu’ils ont été mesurés à l’aide de la méthode de production de cytokines. Cependant, cette différence n’était pas cohérente parmi les autres variantes du SRAS-CoV-2 étudiées.
Environ six à sept mois après la vaccination, près de 90 % des réponses CD4+ et 87 % CD8+ des lymphocytes T mémoire ont été préservées contre les variants du SRAS-CoV-2 chez les sujets en moyenne par test AIM. De plus, 84 % CD4+ et 85 % CD8+ des réponses des lymphocytes T mémoire ont été préservés contre la variante Omicron.
Une diminution de la réponse des lymphocytes T CD8+ contre les variants du SRAS-CoV-2 a été observée dans certains cas lorsqu’elle a été mesurée à l’aide d’interféron-γ (IFN-γ), de facteur de nécrose tumorale-α (TNF-α) et d’interleukine-2 (IL- 2) production après près de six mois de vaccination. Quelle que soit la méthode de dosage, les réponses des lymphocytes T CD4+ et CD8+ contre Omicron ont été largement préservées après la vaccination.
La reconnaissance des cellules B mémoire des variants S du SARS-CoV-2 était plus faible dans tous les cas. Ces réductions étaient modérées dans le cas des variantes bêta et delta, indiquant que la reconnaissance des cellules B des variantes du SRAS-CoV-2 a été conservée dans la plupart des cas. Cependant, la reconnaissance des cellules B mémoire spécifiques au domaine de liaison au récepteur (RBD) a été considérablement réduite à 42% dans Omicron par rapport aux autres variantes du SRAS-CoV-2. De plus, les cellules B mémoire contre Omicron RBD pourraient être éventuellement détectables à des affinités inadéquates pour la neutralisation du SARS-CoV-2 in vitro.
Généralement, les titres d’anticorps neutralisants contre le variant Omicron après deux doses de BNT162b2 ou d’ARNm-1273 étaient plus faibles. L’analyse du répertoire des épitopes des lymphocytes T a démontré que les lymphocytes T CD4+ et CD8+ reconnaissaient une médiane des épitopes 11 et 10 S des variants du SARS-CoV-2. En outre, une moyenne de 80 % ou plus des réponses des lymphocytes T CD4+ et CD8+ étaient associées à des épitopes conservés dans Omicron.
conclusion
Les découvertes d’étude ont indiqué que la plupart des cellules de T induites par des vaccinations sont restées capables d’identifier toutes les variantes SARS-CoV-2. De plus, l’étude souligne l’importance d’une surveillance continue pour identifier le risque posé par toute réduction supplémentaire des réponses des lymphocytes T induites par le vaccin associées à l’évolution continue des variants du SRAS-CoV-2.
Le développement de stratégies de vaccination via l’incorporation de méthodes supplémentaires présentant des réponses cellulaires T plus larges ciblées vers des régions plus conservées dans les variantes sera bénéfique pour augmenter l’efficacité des vaccins contre les futures variantes du SRAS-CoV-2.
