La découverte d’une variante génétique relativement courante chez les personnes d’ascendance polynésienne, mais incroyablement rare dans la plupart des autres populations, donne des indices sur les fondements génétiques de l’hypercholestérolémie chez tous les individus, selon une nouvelle recherche menée par la University of Pittsburgh School of Public Des généticiens de la santé en partenariat avec plusieurs autres groupes, dont l’Université d’Otago et la communauté samoane de la recherche en santé.
La découverte surprenante, publiée cette semaine dans la revue Progrès de la génétique humaine et de la génomiquedémontre l’importance d’assurer la diversité dans les bases de données génétiques.
« Si nous n’avions recherché que des populations d’ascendance européenne, nous aurions peut-être complètement manqué cette découverte », a déclaré l’auteur principal Jenna Carlson, Ph.D., professeur adjoint de génétique humaine et de biostatistique à Pitt Public Health. « C’est grâce à la générosité de milliers de Polynésiens que nous avons pu trouver cette variante, qui est une preuve irréfutable qui déclenchera de nouvelles recherches sur la biologie sous-jacente au cholestérol. »
L’hypercholestérolémie est une cause majeure de charge de morbidité dans les pays de tous les niveaux de revenu, est un facteur de risque de maladies cardiaques et d’accidents vasculaires cérébraux et est estimée à 2,6 millions de décès par an dans le monde, selon l’Organisation mondiale de la santé.
Carlson et son équipe ont construit leur étude pour explorer un signal qui est apparu dans une vaste enquête à l’échelle du génome à la recherche de gènes associés aux lipides, ou graisses, dans le corps. Il a suggéré qu’une variante du gène sur le chromosome 5 pourrait être associée au cholestérol. L’équipe a entrepris de « cartographier finement » la région en utilisant les données génétiques de 2 851 adultes samoans du groupe d’étude sur l’obésité, le mode de vie et les adaptations génétiques (OLAGA, qui signifie « la vie » en samoan) qui avaient également fourni des informations sur la santé, y compris des panneaux lipidiques . Pour revérifier la découverte, l’équipe a recherché l’association chez 3 276 autres Polynésiens des Samoa, des Samoa américaines et d’Aotearoa en Nouvelle-Zélande, et le même lien entre la variante et le cholestérol a été observé chez eux.
En utilisant les données des participants samoans polynésiens occidentaux, l’équipe a pu compléter les informations manquantes autour de la région qui les intéressait sur le chromosome 5. Cela les a conduits à BTNL9 – un gène qui dirige la production de la protéine BTNL9. Les protéines signalent généralement aux cellules d’effectuer des actions, bien que les scientifiques n’aient toujours pas caractérisé le rôle précis de la protéine BTNL9.
Il s’est avéré que les Polynésiens avec de faibles niveaux de «bon» cholestérol HDL et des niveaux élevés de triglycérides avaient une variante «stop-gain» dans BTNL9, ce qui signifie que le gène était dirigé pour cesser de faire son travail de production de protéines, un indice fort que la protéine BTNL9 aide les cellules à maintenir un taux de cholestérol sain.
« Nous ne savons pas grand-chose sur cette variante car elle n’apparaît pas dans les références génomiques publiées, qui surreprésentent les individus d’ascendance européenne – elle est pratiquement inexistante dans les populations d’ascendance européenne, a une très faible fréquence chez les Sud-Asiatiques et n’est même pas particulièrement courante dans l’Est. les Polynésiens, comme les Maoris vivant à Aotearoa en Nouvelle-Zélande », a déclaré Carlson. « Mais la façon dont il est lié aux panneaux lipidiques chez les Samoans nous dit que ce gène est important pour le cholestérol, quelque chose que nous ne savions pas auparavant. En explorant davantage BTNL9, nous pourrions un jour découvrir de nouvelles façons d’aider tout le monde à maintenir un taux de cholestérol sain. »