Dans une récente étude publiée sur medRxiv* serveur de pré-impression, les chercheurs ont évalué si l’immunité neutralisante était induite contre la sous-variante BA.1 d’Omicron chez les individus non vaccinés et vaccinés adéquatement protégés contre l’infection par les sous-variantes d’Omicron, BA.4 et BA.5.
La sous-lignée BA.1 a été la première à émerger de la variante préoccupante (VOC) du coronavirus du syndrome respiratoire aigu sévère 2 (SARS-CoV-2) Omicron (B.1.1.529). Il avait un potentiel remarquable pour échapper à l’immunité neutralisante provoquée par l’infection précédente par d’autres variantes, vaccins ou les deux du SRAS-CoV-2.
Plus tard, les deux nouvelles sous-variantes d’Omicron, BA.4 et BA.5, sont apparues en Afrique du Sud, qui différaient de la sous-lignée BA.1 en raison des mutations F486V et L452R dans le domaine de liaison au récepteur (RBD) du Protéine de pointe (S) du SRAS-CoV-2.
À propos de l’étude
Dans la présente étude, les chercheurs ont recruté des personnes infectées par Omicron/BA.1 entre novembre et décembre 2021. Parmi celles-ci, 24 personnes n’étaient pas vaccinées contre la maladie à coronavirus 2019 (COVID-19) et 15 ont été vaccinées. Plus précisément, huit et sept participants avaient reçu respectivement les vaccins BNT162b2 et Ad26.CoV.2S COVID-19.
L’équipe a recueilli les échantillons de sang de tous les participants à l’étude à une médiane de 23 jours après l’apparition des symptômes, lorsque l’immunité neutralisante développée contre Omicron/BA.1 avait atteint un plateau. Le séquençage du génome entier a confirmé que la sous-variante Omicron/BA.1 infectait tous les participants à l’étude.
Toutes les expériences avec les virus vivants BA.4 et BA.5 ont été réalisées dans un confinement de niveau 3 de biosécurité, conformément aux protocoles approuvés par le Comité de biosécurité de l’Institut africain de recherche en santé. Les chercheurs ont utilisé la lignée cellulaire H1299-E3 pour l’expansion virale et l’infection des cellules Vero E6.
L’équipe a utilisé le surnageant viral de la co-culture de cellules H1299-E3 et Vero E6 exprimant l’enzyme de conversion de l’angiotensine 2 (ACE2) pour toutes les expériences de l’étude. Ils ont utilisé un in vitro, test de neutralisation par réduction de foyer de virus vivant (FRNT). Notamment, FRNT50 est la dilution réciproque de sérum qui neutralise 50 % du virus inoculé ou la dose infectante (ID50).
Les auteurs ont dilué les stocks de virus avec du plasma et ont atteint la dilution plasmatique la plus concentrée de 1:25, qui a été extrapolée au FRNT50 valeurs <25. De plus, ils ont transformé FRNT en journal50 ou changement de pli en FRNT50 par participant pour calculer les intervalles de confiance (IC). L’équipe a exponentiel les IC pour obtenir les IC supérieurs et inférieurs à 95 % sur la moyenne géométrique FRNT50.
Résultats et conclusion de l’étude
Chez les participants non vaccinés infectés par BA.1, FRNT50 diminué de 275 à 36 et 37 pour BA.1, BA.4 et BA.5, respectivement. A l’inverse, dans le groupe vacciné infecté par BA.1, FRNT50 diminué de 507 à 158 et 198 pour BA.1, BA.4 et BA.5, respectivement.
Les niveaux globaux de neutralisation de BA.4 et BA.5 étaient environ cinq fois plus élevés dans le groupe vacciné par rapport au groupe non vacciné. Ainsi, ils semblaient être plus protégés, bien qu’une immunité décroissante puisse à nouveau diminuer la protection conférée parmi la population vaccinée.
L’immunité neutralisante obtenue en réponse à l’infection par Omicron/BA.1 chez les participants non vaccinés était faible. Par conséquent, les baisses de pli BA.4 et BA.5 ont conduit à de faibles niveaux de neutralisation résiduelle. Vraisemblablement, la faible immunité à BA.1 reflétait la plus faible immunogénicité de cette variante.
Étant donné que les différences de séquence entre les sous-variants BA.4 et BA.5 nichaient à l’extérieur du SRAS-CoV-2 S, ils ont tous deux montré des capacités d’évasion immunitaire similaires. Cependant, la fuite d’immunité observée était étonnamment plus élevée que la fuite non substantielle détectée pour BA.2.
La vaccination a augmenté la capacité de neutralisation contre les sous-variantes émergentes d’Omicron et offrirait probablement une bonne protection contre le COVID-19 sévère. Cependant, il est possible qu’une vague d’infection BA.4/BA.5 frappe la population non vaccinée, car les résultats ont montré une faible neutralisation virale résiduelle et une évasion immunitaire plus élevée.
*Avis important
medRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, guider la pratique clinique/les comportements liés à la santé, ou traités comme des informations établies.
