Bien que les chercheurs aient constaté que les rats étaient testés négatifs pour le virus, ils disent qu’il est important de continuer à surveiller les animaux pour le virus au fur et à mesure qu’il mute, ce qui rend les espèces auparavant résistantes sensibles à l’infection.
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La plupart des études sur les maladies infectieuses émergentes se sont concentrées sur les animaux en tant que réservoirs de virus et sur la manière dont ces virus sont transmis aux humains. Cependant, de nombreuses études au cours de la pandémie de COVID-19 ont signalé la transmission du coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS-CoV-2) des humains aux animaux.
Des chiens et des chats domestiques, dont les propriétaires ont été testés positifs pour le virus, ont également été vus infectés. Les rapports montrent également que les visons d’élevage et d’autres animaux de zoo ont également contracté le virus des humains.
La susceptibilité des animaux à être infectés par le SRAS-CoV-2 d’origine humaine dépend de leur écologie et de leur génétique. Supposons que le fonctionnement cellulaire de l’animal permette au virus d’entrer et de se lier aux récepteurs de la cellule hôte. Dans ce cas, la poursuite de la transmission dépend de la durée pendant laquelle les animaux infectés excrètent le virus et de la proximité et de la fréquence des contacts avec d’autres animaux.
Par exemple, chez les visons d’élevage, une espèce très sensible au virus, la transmission a été rapide car ils étaient logés à l’intérieur à des densités élevées.
D’autres animaux sauvages, comme les rats, vivent également dans de telles conditions et vivent souvent à proximité des humains. En Europe, les rats de Norvège (Rattus norvegicus) prospèrent dans les zones urbaines, vivant souvent dans les réseaux d’égouts urbains. Étant donné que plusieurs rapports ont détecté le SRAS-CoV-2 dans les eaux usées, ces rats peuvent avoir été exposés au virus.
Cependant, des études antérieures ont montré que cette espèce de rongeur n’est pas sensible à la souche Wuhan du virus. Mais, après avoir traversé plusieurs souris de laboratoire, le virus a développé la capacité d’infecter cet hôte en raison d’une mutation N501Y dans le domaine de liaison au récepteur de protéine de pointe (RBD). Cette variante a également été observée dans les lignées virales circulant chez l’homme. Cela suggère que le virus a la capacité d’infecter potentiellement des hôtes qui y étaient auparavant résistants, y compris les rongeurs.
Test des rats d’égout pour le SRAS-CoV-2
Les chercheurs ont testé des rats norvégiens vivant dans les égouts d’Anvers, en Belgique, pour le SRAS-CoV-2 en novembre et décembre 2020 après un pic des cas là-bas. Ils ont rapporté les résultats de leur étude dans un article de recherche publié sur le bioRxiv* serveur de pré-impression.
Les auteurs ont piégé et testé plusieurs rats pour la présence de SRAS-CoV-2. Ils ont d’abord testé la présence d’anticorps contre le virus dans le sérum sanguin des rats. Ils ont également testé l’ARN viral des écouvillons oraux et des matières fécales. Enfin, ils ont testé le virus dans les eaux usées à l’endroit où les rats ont été piégés.
Sur les huit échantillons d’eaux usées analysés, l’équipe a trouvé le SRAS-CoV-2 dans quatre échantillons. Les sérums de trois rats sur 35 étaient positifs pour la nucléocapside et les anticorps IgG, mais les quantités étaient inférieures à celles des rats témoins qui étaient positifs pour le virus. D’autres tests de ces sérums pour les anticorps neutralisants se sont révélés négatifs, suggérant que les rats n’avaient pas été exposés au SRAS-CoV-2. Tous les échantillons d’écouvillons, de tissus et de matières fécales de 39 rats étaient négatifs pour le virus.
Les résultats suggèrent que les rats étudiés dans les égouts d’Anvers n’avaient jamais été infectés par le SRAS-CoV-2 bien qu’ils aient été exposés au virus dans les eaux usées.
Surveillance des animaux pour le virus important
Il y avait une divergence dans les résultats obtenus par fluorescence et par les tests de neutralisation. Les auteurs suggèrent que des précautions doivent être prises lors de l’utilisation d’échantillons différents de ceux pour lesquels les tests ont été validés. Bien que le test de fluorescence ait différencié les rats témoins de laboratoire positifs et négatifs, il a donné des valeurs faussement positives pour les rats sauvages. Cela pourrait être dû au fait que les rats sauvages sont exposés à de nombreux autres agents pathogènes et qu’ils présentent des valeurs de fluorescence globale plus élevées en raison d’une liaison plus élevée aux anticorps. Ainsi, pour confirmer le SRAS-CoV-2 chez les animaux, les tests de neutralisation virale peuvent être meilleurs.
Les auteurs n’ont probablement pas détecté le virus chez les rats d’égout parce que les tests ont été effectués avant la dominance de la mutation N501Y dans les lignées humaines. Les variantes émergentes du Royaume-Uni, d’Afrique du Sud et du Brésil ont toutes la mutation N501Y, et des espèces auparavant résistantes comme les rongeurs peuvent être infectées.
Les rongeurs vivent à proximité des humains et en fortes densités, créant les conditions idéales pour la propagation de nouvelles épidémies. Ainsi, bien que les résultats de l’étude actuelle montrent que les rats ont été testés négatifs pour le virus, il est nécessaire de continuer à surveiller les rats et autres animaux exposés à l’homme pour détecter une future transmission d’humain à animal.
*Avis important
bioRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, orienter la pratique clinique / les comportements liés à la santé ou être traités comme des informations établies.
