Dans une étude récente publiée dans la revue Nutrimentsdes chercheurs ont étudié l’association causale entre la composition du microbiome intestinal (GM), la goutte et les valeurs d’urate sérologique (SUA) à l’aide de la randomisation mendélienne (MR).
La goutte, une maladie inflammatoire répandue caractérisée par des taux élevés de SUA, a été associée à la goutte. Les OGM peuvent avoir un impact sur le métabolisme de l’acide urique en influençant le métabolisme des acides gras à chaîne courte et des purines. Cependant, le lien entre la dysbiose génétiquement modifiée et le développement de la goutte reste inconnu. Le GM pourrait être une cible thérapeutique pour réduire les processus d’hyperuricémie, ce qui implique une relation possible entre le microbiome intestinal et les taux sérologiques d’urate. Cependant, le manque de données montre un lien de causalité entre les deux.
Étude : Relation causale entre le microbiote intestinal et la goutte : une étude de randomisation mendélienne à deux échantillons. Crédit d’image : étoiles/Shutterstock
À propos de l’étude
Dans la présente étude, les chercheurs ont évalué l’impact du microbiome intestinal sur le développement de la goutte.
L’IRM a été réalisée en utilisant des variantes génétiques comme variables instrumentales (IV) pour évaluer la relation causale entre le microbiote intestinal et les taux sérologiques d’urate. En outre, une analyse de randomisation mendélienne inverse a été réalisée avec des SNP sérologiques associés à l’urate et des polymorphismes mononucléotidiques (SNP) associés à la goutte comme variables instrumentales, les niveaux de SUA et la goutte comme expositions à l’étude, et le microbiome intestinal comme résultat de l’étude, pour évaluer l’influence causale potentielle des niveaux de goutte et de SUA sur GM.
Les chercheurs ont utilisé les données de l’étude d’association à l’échelle du génome GM (GWAS) de la collaboration MiBioGen, y compris les informations de séquençage et de génotypage de l’acide ribonucléique (ARN) ribosomal 16s de 18 340 personnes. L’étude comprenait 211 taxons microbiens, répartis respectivement en 131, 35, 20, 16 et neuf genres, familles, ordres, classes et phylums. Les données GWAS sur les taux sérologiques d’urate ont été obtenues à partir d’une méta-analyse accessible au public, qui comprenait des données fournies par 457 690 personnes ayant participé à 74 études.
Une méta-analyse portant sur 763 813 personnes et 13 179 cas de goutte a fourni des données GWAS sur la goutte. Les SNP liés aux taxons microbiens intestinaux respectaient le seuil de signification à l’échelle du génome (valeur p inférieure à 5 x 10).-8) pour garantir la robustesse des données et l’exactitude des résultats. De plus, conformément à des recherches antérieures, les SNP étaient liés aux taxons microbiens intestinaux à un seuil relativement large (valeur p inférieure à 1,0 x 10).-5) ont été sélectionnés comme IV potentiels. Les chercheurs ont également effectué une évaluation du déséquilibre de liaison (LD) sur les SNP regroupés en utilisant les données du projet européen 1 000 Genomes comme référence pour déterminer le LD.
Les SNP dupliqués, palindromiques ou ambigus ont été éliminés de l’analyse. La force IV a été utilisée pour calculer les valeurs statistiques F. Pour les taxons microbiens avec un seul polymorphisme mononucléotidique comme variable instrumentale, les ratios de Wald ont été utilisés pour les estimations MR. D’autres approches, telles que la pondération par variance inverse (IVW), le mode pondéré et la médiane pondérée (WM), ont été utilisées pour les taxons comportant plusieurs IV. Des corrections à plusieurs tests ont été réalisées à l’aide de la procédure Bonferroni. Des études de sensibilité ont été réalisées, notamment une évaluation sans intervention et une régression de type MR-Egger.
Résultats
Après avoir éliminé 15 taxons microbiens intestinaux inconnus des données MiBioGen, 196 taxons microbiens intestinaux provenant de cinq niveaux étaient disponibles pour analyse. Au total, 2 410 et 2 412 IV ont été associées aux 196 taxons microbiens intestinaux pour les niveaux sérologiques d’urate et la goutte, respectivement. Pour les variables instrumentales, les valeurs de la statistique F variaient de 11 à 207, confirmant l’absence de léger biais instrumental.
Une fois les SNP harmonisés et regroupés, 28 polymorphismes mononucléotidiques de la goutte étaient liés à 20 taxons, tandis que 29 SNP du SUA étaient connectés à 21 taxons. Douze SNP liés au GM complet ont été choisis comme IV parmi les 196 taxons GM. Avec des valeurs statistiques F supérieures à 10, chaque SNP s’est avéré une validité acceptable. Il y avait cinq taxons liés aux niveaux de SUA et dix à la goutte.
L’analyse de randomisation mendélienne inverse a montré six polymorphismes mononucléotidiques liés à la goutte pour cinq taxons de microbes intestinaux et 35 polymorphismes mononucléotidiques liés aux taux sérologiques d’urate pour 31 taxons microbiens, indiquant que la goutte affectait la composition de cinq taxons génétiquement modifiés tandis que les niveaux de SUA influençaient la composition de 30 taxons GM. Les niveaux de SUA ont montré des corrélations négatives avec Lachnospiracées Souches FCS020 et NC2004. En combinant des recherches antérieures, les chercheurs ont proposé une boucle de rétroaction négative potentielle entre le phylum des Actinobacteria et les niveaux de SUA.
En revanche, Escherichia était positivement associée aux taux sérologiques d’urate. De plus, la goutte était positivement corrélée à mélainabactéries et bêtaprotéobactéries, avec des valeurs de rapport de cotes (OR) de 1,1 et 1,2, respectivement. De plus, l’analyse a indiqué que des microbes tels que Actinomycétales, Gastranaérophiles, Burkholderiales, Actinomycétacéeset Porphyromonadacées risques accrus de goutte, avec des valeurs OR de 1,2, 1,1, 1,3, 1,2 et 1,2, respectivement.
De plus, des associations positives ont été observées entre Ruminococcacées UCG011 (OR, 1.1) et goutte. Au contraire, Anaérotronque les espèces (OR, 0,8) présentaient des associations négatives avec la goutte. Les analyses du rapport de Wald pour la goutte ont également montré des corrélations négatives avec le Oxalobactériacées famille (OR, 0,6), Romboutsia genre (OR, 0,7), Ruminocoque genre (OR, 0,7), et Tyzzerella genre (OR, 0,8).
L’équipe a proposé deux nouvelles relations reliant les taxons GM (Prévotelle genre et Faecalibactérie genre), les niveaux de SUA et la goutte. Alors que Prévotelle était positivement associée aux taux sérologiques d’urate et à la goutte, une corrélation négative a été observée pour Faecalibactérie. Les analyses de sensibilité n’ont montré aucune pléiotropie horizontale, hétérogénéité ou valeurs aberrantes potentielles. Les corrections de Bonferroni ont montré des résultats significatifs uniquement pour Bêtaprotéobactéries et Burkholderiales par rapport à la goutte.
Dans l’ensemble, les résultats de l’étude ont montré que l’abondance de taxons GM génétiquement prédits a une influence clé sur les niveaux de SUA et le développement de la goutte. De plus, la composition des GM est influencée par les niveaux de goutte et de SUA. Les résultats fournissent des informations importantes pour le traitement de la goutte. Une étude plus approfondie est toutefois nécessaire pour établir des liens de causalité spécifiques. L’exploration des processus moléculaires à l’origine des interactions réciproques entre les niveaux de GM et de goutte ou de SUA nécessite des expériences supplémentaires sur les animaux et des enquêtes sur la population.
