Les chercheurs ont démontré la faisabilité d'une approche morphologique pour interpréter les données transcriptomiques spatiales (ST), contribuant à améliorer la compréhension des lésions qui se produisent dans la maladie rénale chronique (CKD), à la fois aux niveaux cellulaire et moléculaire. Une étude récente dans L'American Journal of Pathologypublié par Elsevier, détaille comment cette nouvelle méthode pourrait conduire à l'identification de nouveaux biomarqueurs et stratégies thérapeutiques pour les patients.
Les technologies ST sont un nouvel outil en développement rapide pour mesurer l'ARN dans leur contexte spatial d'origine, donnant une dimension mécaniste moléculaire à la morphologie tissulaire. L'application des technologies ST a déjà donné des informations importantes sur de nombreux tissus et modèles de maladies différents. En combinant le profilage des modèles d'expression génique avec les informations spatiales des cellules dans les tissus, ST fournit une compréhension plus complète de l'organisation moléculaire et cellulaire des tissus et des lésions.
L'enquêteur principal Benjamin D. Humphreys, MD, PhD, Division of Nephrology, Department of Medicine, and the Department of Developmental Biology, Washington University à St. Louis,«Pendant l'analyse des données ST, les grappes en calcul sont souvent superposées à une image histologique. Cependant, la morphologie tissulaire par évaluation pathologique standard microscopique n'est pas prise en compte. Cela peut empêcher l'assimilation d'informations importantes qui peuvent aider à interpréter les données ST. Le rein. est un organe particulièrement hétérogène en termes morphologiques, avec un degré élevé de variabilité des lésions spatiales et temporelles souvent présentes dans les situations pathologiques. Une analyse basée sur l'histopathologique de la transcriptomique spatiale sur quatre échantillons de rein humains avec l'IRC, correspondant aussi étroitement que possible à la façon dont une biopsie rénale est interprétée dans la pratique clinique. «
L'étude démontre comment:
- L'analyse transversale morphologique et ST peut aider à identifier les lésions dans les tissus tels que les organes lymphoïdes tertiaires dans le rein.
- La composition cellulaire d'une lésion spécifique peut être déterminée, parfois au-delà de son apparence morphologique, comme dans le cas de la tumeur papillaire identifiée.
- Les mécanismes moléculaires des processus de lésion peuvent être identifiés en comparant les lésions à différents stades, comme dans le cas de la fibrose glomérulaire ou de l'atrophie tubulaire.
- Pour identifier de nouveaux gènes potentiels tels que CXCL12 ou Fxyd5 Cela peut être impliqué dans la fibrose glomérulaire.
- Cette méthode combinant l'histopathologie traditionnelle avec les données ST peut ouvrir la voie à l'avenir de la microscopie moléculaire et de la pathologie de précision.
L'auteur principal Pierre Isnard, MD, PhD, Division of Nephrology, Department of Medicine, and the Department of Developmental Biology, Washington University à St. Louis, conclut, «Les technologies ST sont nouvelles et de plus en plus utilisées dans les sciences de la vie, mais il y a un manque d'études montrant leurs avantages et leurs applications. Ici, nous démontrons la nature complémentaire de ces technologies à l'analyse morphologique standard des tissus pour identifier, classer et comprendre les lésions . La valeur de ces technologies dans les soins de santé reste à démontrer. Biomarqueurs et / ou stratégies thérapeutiques pour les patients. «
