Des chercheurs de l’Université de l’Alabama à Birmingham ont démontré une nouvelle façon de fixer les cellules et de préserver leurs biomolécules avant la dissociation d’une seule cellule sans avoir besoin d’approches enzymatiques/mécaniques sévères.
Le séquençage d’ARN unicellulaire a la possibilité de déconstruire les réseaux cellulaires, mais était auparavant limité par la perte d’informations biologiques causée par les méthodes de dissociation traditionnelles. vivoPHIX™, un solvant eutectique profond (DES) est un réactif non réticulant qui fixe rapidement les cellules bactériennes, végétales et animales, permettant la stabilisation à long terme des biomolécules et facilitant la dissociation des cellules individuelles, comme le démontre cette récente publication bioRxiv.
Fig 1. Flux de travail démontrant la fixation des cellules/tissus à l’aide d’un DES (vivoPHIX™) pour CITE-Seq et scRNA-Seq.
La recherche dans cet article démontre :
- Stabilisation à long terme des tissus biobanqués, résultant en des données scRNA-seq de haute qualité sans aucun artefact d’activation à l’aide vivoPHIX™.
- Les morphologies cellulaires complexes sont conservées avec une dissociation ultrasonore, comme les neurones de la rétine humaine
- Les modifications post-traductionnelles sont préservées, fournissant une perméabilisation suffisante de la membrane pour sonder les épitopes intracellulaires.
Nous prévoyons que les fixateurs à base de DES permettront la reconstruction de réseaux cellulaires in vivo et découvriront la coopérativité b/w des voies intracellulaires. Nous pensons que le DES pourrait vraiment changer le domaine de l’analyse unicellulaire ».
Seth Fortmann, auteur principal
Andrew Goldsborough, PDG de RNAssist Ltd qui a développé vivoPHIX™ et soutenu le projet est d’accord. « Il s’agit d’un effort herculéen de la part de Seth et de l’équipe de l’UAB, avec tant de données produites qu’il pourrait justifier trois publications distinctes. » C’est un véritable témoignage du travail acharné de Seth au cours des 3 dernières années et met en évidence l’énorme potentiel vivoPHIX™ a dans le monde unicellulaire.’
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