L’émergence continue de nouvelles mutations du SRAS-CoV-2 permet au virus de se propager plus efficacement et d’échapper aux anticorps. Cependant, il n’est pas clair si les nouvelles souches sont capables d’échapper à l’immunité des lymphocytes T ; l’une des principales lignes de défense de l’organisme contre le COVID-19.
Le développement d’une réponse immunitaire des lymphocytes T est largement gouverné par des facteurs génétiques, notamment des variations dans les gènes du complexe majeur d’histocompatibilité (également appelé HLA). Chaque variante du gène HLA a une molécule correspondante qui identifie un ensemble spécifique de peptides (protéines) d’un virus. Il existe un grand nombre de ces variations génétiques, et chaque personne en possède un ensemble unique.
L’efficacité du développement de l’immunité des lymphocytes T contre les souches COVID-19 varie d’une personne à l’autre. Selon l’ensemble des molécules HLA, le système immunitaire de certaines personnes identifiera et détruira un virus muté avec la même efficacité que la forme de base du virus. Dans d’autres, la réponse est moins efficace.
La recherche a été menée par un groupe de scientifiques de la Faculté de biologie et de biotechnologie de l’Université HSE et de l’Institut de chimie bioorganique de l’Académie des sciences de Russie, notamment Stépan Nersisyan, Anton Jiyanov, Maxim Shkurnikov et Alexandre Tonevitski. Ils ont évalué les caractéristiques génétiques du développement de l’immunité des lymphocytes T contre 11 variantes principales du SRAS-CoV-2 en analysant les variantes du gène HLA les plus courantes. Les chercheurs ont utilisé leurs résultats pour développer le portail T-cell COVID-19 Atlas (T-CoV, https://t-cov.hse.ru).
Les chercheurs ont utilisé la bioinformatique pour évaluer les affinités de liaison de centaines de variations de molécules HLA et de dizaines de milliers de peptides viraux des principales variantes du SRAS-CoV-2 (Alpha, Beta, Gamma, Delta, Epsilon, Zeta, Eta, Theta, Iota, Kappa et Lambda). L’équipe a identifié les allèles HLA qui présentaient l’ensemble de peptides viraux identifiés le plus significativement modifié. Selon les scientifiques, les variantes mutées peuvent présenter un risque plus élevé pour les personnes atteintes de ces allèles.
L’immunité des cellules T fonctionne de telle sorte que la variation des molécules HLA et des récepteurs des cellules T empêche les virus d’échapper à la réponse immunitaire. Notre recherche n’a pas trouvé une seule variante de génotype HLA qui soit affectée négativement par des mutations virales de manière significative. Cela signifie que même dans des conditions d’efficacité réduite des anticorps, l’immunité des lymphocytes T continue de fonctionner efficacement. »
Aleksander Tonevitsky, doyen, Faculté de biologie et de biotechnologie, Université HSE
