Deux équipes multi-institutionnelles dirigées par des scientifiques de Weill Cornell Medicine ont reçu une subvention du Starr Cancer Consortium. Les deux subventions financeront des travaux appliquant de nouvelles technologies pour développer des connaissances plus détaillées sur la biologie des tumeurs, une équipe se concentrant sur le lymphome de Hodgkin et l’autre sur la pureté des échantillons de tumeurs sur des lames de pathologie.
Le Starr Cancer Consortium, créé en 2006, est une collaboration entre cinq instituts de recherche de premier plan : le Broad Institute du MIT et de Harvard, le Cold Spring Harbor Laboratory, le Memorial Sloan Kettering Cancer Center, l’Université Rockefeller et Weill Cornell Medicine.
Chaque année, les chercheurs de ces institutions proposent des projets pour améliorer la prévention, le diagnostic, le traitement et la compréhension fondamentale du cancer. Un comité d’examen composé de scientifiques extérieurs au consortium sélectionne les propositions à financer, en mettant l’accent sur des projets collaboratifs ambitieux ayant le potentiel de transformer la compréhension et le traitement du cancer. Les lauréats de cette année comprennent des projets dirigés par les Drs. Lisa Giulino Roth et Iman Hajirasouliha de Weill Cornell Medicine.
Nous sommes fiers de ces chercheurs de Weill Cornell Medicine, dont les efforts se sont démarqués parmi un groupe de certains des meilleurs scientifiques du cancer au monde lors du concours annuel de la Fondation Starr. »
Dr Hugh Hemmings, doyen associé principal pour la recherche et directeur du Département d’anesthésiologie
Il ajoute que « grâce au généreux soutien de la fondation, ces chercheurs talentueux pourront continuer à faire progresser notre compréhension de la biologie du cancer et à développer de nouvelles façons de le traiter ».
Dr Lisa Giulino Roth
directeur de l’oncologie pédiatrique et professeur agrégé de pédiatrie ; Professeur agrégé de pathologie et de médecine de laboratoire
Définir l’évolution et les interactions du microenvironnement tumoral du lymphome hodgkinien classique à l’aide de modèles de souris unicellulaires multi-omiques et génétiquement modifiées
Les traitements actuels du lymphome de Hodgkin classique provoquent souvent des effets secondaires à long terme, mais le manque de bons modèles de laboratoire pour la maladie a paralysé les efforts pour développer de meilleures thérapies. Un problème majeur est qu’une petite minorité de cellules dans le microenvironnement tumoral de Hodgkin est à l’origine de la maladie, et les activités de ces cellules sont difficiles à détecter avec les méthodes de séquençage de gènes en masse. L’équipe du Dr Roth a précédemment développé de nouvelles techniques de tri cellulaire pour isoler les cellules responsables de la tumeur, en analysant leurs génomes uniques et leurs profils d’expression génique. Ce travail a révélé une tumeur complexe, avec des interactions étendues entre les cellules de Hodgkin Reed Sternberg et les cellules non malignes du microenvironnement tumoral. Avec le soutien du Starr Consortium, les chercheurs envisagent désormais de retracer les lignées de ces différents types de cellules pour déterminer leur apparition dans la tumeur et construire de nouveaux modèles murins de la maladie. Les travaux s’appuieront fortement sur de nouvelles techniques de séquençage de gènes et de profilage cellulaire pour caractériser le microenvironnement tumoral avec des détails sans précédent.
Les co-chercheurs principaux du projet sont le Dr Anna (Seung Ha) Nam de Weill Cornell Medicine et le Dr Mikhail Roshal du Memorial Sloan Kettering Cancer Center.
Dr Iman Hajirasouliha
Professeur adjoint de physiologie et biophysique ; Professeur adjoint de génomique computationnelle en biomédecine computationnelle à l’Institut SAR Prince Alwaleed Bin Talal Bin Abdulaziz Alsaud pour la biomédecine computationnelle
Prédiction de la pureté tumorale faiblement supervisée à partir de lames colorées H&E
Les efforts visant à séquencer les génomes du cancer au cours des dernières années ont fourni une mine de données pour la recherche fondamentale et le séquençage d’échantillons cliniques peut également fournir des informations pronostiques importantes pour les patients. Dans le séquençage clinique et de recherche, l’utilité des données dépend de la pureté de l’échantillon de tissu tumoral. Si de nombreuses cellules non tumorales contaminent l’échantillon, leurs séquences d’ADN peuvent fausser les résultats, masquant d’importantes mutations impliquées dans le développement de la tumeur. De plus, la pureté de la tumeur est associée à des résultats différents dans certains types de cancer. L’équipe du Dr Hajirasouliha utilisera sa subvention Starr Consortium pour extraire des diapositives de pathologie numérique et des données de séquençage du programme Cancer Genome Atlas (TCGA) et du Caryl and Englander Institute for Precision Medicine de Weill Cornell Medicine afin de développer et de tester des algorithmes pour déterminer la pureté de la tumeur sur une lame de microscope. Les chercheurs utiliseront des repères rigoureux pour comparer leurs résultats aux modèles précédents, aux scores de pathologie et aux analyses moléculaires, en mettant l’accent sur l’identification des sous-sections d’échantillons qui contiennent les populations les plus pures de cellules tumorales. Une fois formé et validé, l’algorithme pourrait être utilisé pour améliorer le séquençage sur les futurs échantillons.
Le Dr Victoria Popic du Broad Institute du MIT et de Harvard est la co-chercheuse principale.
