Des chercheurs aux États-Unis et au Canada ont mené une étude montrant que la variante sud-africaine du coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SARS-CoV-2) – l’agent responsable de la maladie à coronavirus 2019 (COVID-19) – est peu susceptible de devenir le souche dominante aux États-Unis.
En utilisant un modèle de transmission dynamique, les chercheurs ont montré que la domination de la lignée B.1.351 est peu probable, même une fois complètement vaccinés, les individus retournent à leur comportement prépandémique.
Cependant, si la variante acquiert un avantage de sélection suffisamment élevé grâce à une transmission accrue et à une fuite immunitaire, elle pourrait devenir dominante dès juillet 2021, entraînant une résurgence des infections et des hospitalisations.
«Notre étude souligne l’urgence de continuer à déployer la génération actuelle de vaccins malgré l’émergence de variantes de fuite immunitaire», écrit l’équipe de la Yale School of Public Health de New Haven, Connecticut, de l’Université York à Toronto, en Ontario et de la University of Maryland School. de médecine à Baltimore.
L’adhésion aux mesures d’atténuation non pharmaceutiques devrait également être poursuivie jusqu’à ce que la circulation virale soit amenée à de faibles niveaux, ajoute Alison Galvani et ses collègues.
Une version pré-imprimée du document de recherche est disponible sur le medRxiv* serveur, tandis que l’article est soumis à un examen par les pairs.
Sommaire
Les variantes émergentes menacent l’efficacité de la vaccination
Au 13 maieEn 2021, plus de 265 millions de doses de vaccins COVID-19 avaient été administrées aux États-Unis et 35,8% de la population avait été entièrement vaccinée.
Alors que le nombre de cas quotidiens a considérablement diminué depuis le pic de la pandémie, de nouvelles variantes avec un avantage de sélection en raison d’une transmissibilité accrue et d’une évasion immunitaire sont de plus en plus fréquentes.
La lignée B1.1.7 qui a émergé pour la première fois au Royaume-Uni est maintenant la variante prédominante aux États-Unis et d’autres variantes, y compris B.1.351 (Afrique du Sud), P.1 (Brésil) et B.1427 / 1429 (Californie) sont également à la hausse.
Les trois vaccins (de Pfizer-BioNTech, Moderna et Johnson & Johnson) qui sont en cours de déploiement aux États-Unis ont tous montré une grande efficacité dans la prévention du COVID-19 symptomatique causé par la souche originale de Wuhan-1 qui a été identifiée tôt dans le pandémie.
Cependant, des études ont récemment montré que le variant B.1.351 présente une évasion partielle des anticorps neutralisants générés après la vaccination.
L’effet de cette activité neutralisante réduite sur la protection offerte par les vaccins reste à déterminer.
Bien que la prévalence du B.1.351 aux États-Unis soit actuellement relativement faible – à environ 0,7% – les preuves croissantes d’évasion immunitaire et de fuite des vaccins ont fait craindre que l’administration de vaccins de première génération ne suffise pas à mettre fin à la pandémie.
Pendant ce temps, les directives provisoires des Centers for Disease Control and Prevention (CDC) des États-Unis ont permis à des personnes entièrement vaccinées de reprendre certaines activités pré-pandémiques à partir du 3 avril.
Cependant, «un assouplissement prématuré des mesures de distanciation sociale pourrait renforcer l’avantage sélectif des variantes de fuite immunitaire, entravant la capacité de la vaccination à contrôler la pandémie», ont déclaré Galvani et ses collègues.
Qu’ont fait les chercheurs?
Les chercheurs ont utilisé un modèle de transmission dynamique pour évaluer si les pressions de sélection induites par le vaccin et l’immunité pourraient aider à conduire la domination de B.1.351 en présence de la souche Wuhan-1 originale et de la variante B.1.1.7 selon les directives provisoires du CDC.
Une campagne de vaccination à deux doses du vaccin Moderna a été mise en œuvre, la vaccination commençant le 12 décembree, 2020. La transmissibilité de la souche d’origine a été calibrée en ajustant le modèle au nombre de cas signalés aux États-Unis pour 100 000 habitants à partir du 1er octobre.st, 2020 au 16 avrile, 2021.
La variante B.1.1.7 a été introduite le 1er décembrest, 2020, avec une transmissibilité 50% plus élevée que la souche d’origine, et la variante B.1.351 a été introduite le 28 janviere, 2021.
Les données disponibles sur l’avantage sélectif de B.1.135 étant limitées, les chercheurs ont fait varier sa transmissibilité de l’égale à celle de la souche d’origine à 50% plus transmissible. Ils ont également réduit l’efficacité du vaccin de 20 à 80%.
Le modèle a projeté l’incidence des cas et des hospitalisations causés par les variants et la souche d’origine entre le 3 avrilrd et 31 décembrest, 2021
Qu’a trouvé l’étude?
L’analyse a prédit que le nombre d’infections et d’hospitalisations causées par B.1.135 resterait faible à moins que son avantage de sélection ne commence à dépasser une courbe de seuil.
Par exemple, avec une transmissibilité similaire à la souche d’origine, B.1.135 représenterait moins de 28% des hospitalisations, même si l’efficacité du vaccin était réduite jusqu’à 80%.
Cependant, si B.1.135 était 20% plus transmissible que la souche d’origine et que l’efficacité du vaccin contre elle était réduite de 60%, l’incidence quotidienne maximale de l’infection serait de 19,2 pour 100000 habitants, avec un total de 96 hospitalisations pour 100000 habitants période d’évaluation de neuf mois. Cela correspond à 316 535 hospitalisations dans l’ensemble des États-Unis.
Si le variant était 50% plus transmissible et que l’efficacité du vaccin diminuait de 60%, l’incidence quotidienne maximale serait de 93 cas pour 100 000 habitants, entraînant un total de 1 228 763 hospitalisations au cours des neuf mois.
Quelles sont les implications des résultats?
L’équipe affirme que les résultats indiquent que le variant B.1.351 nécessiterait un avantage de sélection relativement élevé pour échapper à l’immunité acquise naturellement ou induite par le vaccin et devenir dominant.
Alors que les preuves suggèrent que les sérums de convalescence et de vaccin présentent une protection réduite contre le variant B.1.351, son avantage de sélection peut ne pas être suffisamment élevé pour entrer en compétition avec le variant B.1.1.7.
«Cependant, un avantage de sélection amélioré de B.1.351 résultant d’une combinaison d’une transmission accrue et d’une fuite immunitaire pourrait conduire cette variante à la domination dès juillet 2021 et alimenter une résurgence des cas et des hospitalisations», préviennent Galvani et ses collègues.
Les chercheurs conseillent que, bien que le taux de vaccination augmente, le respect des mesures d’atténuation non pharmaceutiques devrait se poursuivre jusqu’à ce que la circulation virale soit amenée à de faibles niveaux.
«Nos résultats montrent en outre qu’en dépit des preuves d’évasion immunitaire, le déploiement de la génération actuelle de vaccins reste une stratégie efficace pour lutter contre la pandémie», concluent-ils.
*Avis important
medRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, guider la pratique clinique / les comportements liés à la santé, ou traités comme des informations établies.
