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La pandémie de COVID-19 repousse des années de progrès réalisés dans la lutte contre la résistance aux antimicrobiens

par Ma Clinique
14 juillet 2022
dans Actualités médicales
Temps de lecture : 5 min
Des doses plus élevées d'antibiotiques sont nécessaires pour éliminer l'infection dans un environnement polymicrobien

La pandémie de COVID-19 a repoussé des années de progrès réalisés dans la lutte contre la résistance aux antimicrobiens (AR) aux États-Unis. Le rapport des Centers for Disease Control and Prevention (CDC), COVID-19 : US Impact on Antimicrobial Resistance, Special Report 2022, conclut que la menace d’infections résistantes aux antimicrobiens est non seulement toujours présente, mais s’est aggravée ; les infections et les décès d’origine hospitalière augmentent d’au moins 15 % au cours de la première année de la pandémie.

Ce revers peut et doit être temporaire. La pandémie de COVID-19 nous a clairement montré que la résistance aux antimicrobiens ne s’arrêtera pas si nous baissons la garde ; il n’y a pas de temps a perdre. La meilleure façon d’éviter une pandémie causée par un agent pathogène résistant aux antimicrobiens est d’identifier les lacunes et d’investir dans la prévention pour assurer la sécurité de notre pays. »

Michael Craig, député provincial, directeur de l’unité de coordination et de stratégie sur la résistance aux antibiotiques du CDC

Dans le rapport, le CDC a analysé l’état de la résistance aux antimicrobiens aux États-Unis immédiatement après les pics de 2020 de la pandémie de COVID-19. Les données montrent une augmentation alarmante des infections résistantes commençant pendant l’hospitalisation, augmentant globalement de 15% de 2019 à 2020 parmi sept agents pathogènes. Les augmentations d’agents pathogènes spécifiques comprenaient :

  • résistant aux carbapénèmes Acinetobacter – augmentation de 78% des infections,
  • multirésistant Pseudomonas aeruginosa – 32% d’augmentation des infections,
  • résistant à la vancomycine Entérocoque (ERV) – augmentation de 14 % des infections, et
  • résistant à la méthicilline Staphylococcus aureus (SARM) – Augmentation de 13 % des infections.

Les menaces résistantes aux antifongiques ont également augmenté en 2020, notamment Candida auris-;qui a augmenté globalement de 60 %- ;et Candidose espèces (hors Candida auris), avec une augmentation de 26% des infections dans les hôpitaux. En comparaison, dans un rapport de 2019, des réductions nationales importantes dans les hôpitaux ont été célébrées, où les infections résistantes aux antimicrobiens ont chuté de 27 % de 2012 à 2017 ; les données montrent que ces réductions se sont poursuivies dans les hôpitaux jusqu’au début de la pandémie. Clostridioides difficile est le seul agent pathogène associé aux soins de santé à s’améliorer en 2020, probablement en partie à cause des changements dans les comportements de recherche de soins de santé.

Dans les hôpitaux américains, les données du CDC montrent des augmentations importantes de l’utilisation d’antibiotiques et des difficultés à suivre les directives de prévention et de contrôle des infections, qui sont essentielles pour prévenir les infections résistantes aux antimicrobiens et leur propagation. Pendant la pandémie, les hôpitaux ont connu des problèmes d’approvisionnement en équipements de protection individuelle, des pénuries de personnel et des séjours plus longs pour les patients. Les hôpitaux traitaient également des patients plus malades qui nécessitaient une utilisation plus fréquente et plus longue de dispositifs médicaux tels que des cathéters et des ventilateurs. L’impact de la pandémie a probablement entraîné une augmentation des infections nosocomiales résistantes aux antimicrobiens.

Au cours de la première année de la pandémie, plus de 29 400 personnes sont décédées d’infections résistantes aux antimicrobiens couramment associées aux soins de santé. Parmi ceux-ci, près de 40% ont contracté l’infection alors qu’ils étaient à l’hôpital. Le fardeau national total des décès dus à la RA peut être beaucoup plus élevé, mais les lacunes dans les données causées par la pandémie entravent cette analyse. Le CDC dispose de données limitées sur la propagation des infections résistantes aux antimicrobiens dans la communauté ; de nombreuses cliniques et établissements de santé avaient des services limités, desservaient moins de patients ou fermaient complètement leurs portes face aux défis de la COVID-19. Les données ne sont pas disponibles ou retardées pour neuf des 18 agents pathogènes répertoriés dans les rapports 2019 des CDC sur les menaces liées à la résistance aux antibiotiques.

Dans le rapport de 2019, les données complètes sur les soins de santé et la communauté de l’année dernière étaient disponibles pour le calcul, le CDC a estimé que plus de 2,8 millions d’infections résistantes aux antimicrobiens se produisent aux États-Unis chaque année, entraînant la mort de plus de 35 000 personnes.

Les progrès historiques réalisés dans la prescription d’antibiotiques ont également été inversés pendant la pandémie. Les antibiotiques étaient souvent la première option donnée pour traiter ceux qui présentaient des symptômes de fièvre et d’essoufflement de type pneumonie, même si cela représentait souvent la maladie virale du COVID-19, pour laquelle les antibiotiques ne sont pas efficaces. De mars 2020 à octobre 2020, près de 80 % des patients hospitalisés avec le COVID-19 ont reçu un antibiotique. Bien que certaines de ces prescriptions puissent être appropriées lorsque les risques d’infections bactériennes ou fongiques associées sont inconnus, ce niveau élevé de prescription peut également exposer les patients à un risque d’effets secondaires et créer une voie de développement et de propagation de la résistance.

Malgré la pandémie, en 2020, plus de 90 % des hôpitaux américains disposaient d’un programme de gestion des antibiotiques aligné sur les éléments essentiels de la gestion des antibiotiques hospitaliers du CDC ; ce qui peut avoir contribué à la réduction de Clostridioides difficile infections.

Pendant la pandémie, de nombreux programmes de résistance aux antimicrobiens ont contribué à stopper la propagation de la COVID-19. Par exemple, l’initiative AR Solutions du CDC a fourni une expertise en matière de contrôle des infections aux établissements de santé, dont beaucoup sont des maisons de retraite, pour effectuer plus de 14 000 consultations en cas d’épidémie ; Le réseau AR Lab Network du CDC a séquencé plus de 4 700 génomes SAR-CoV-2 ; et le NHSN du CDC, qui pilote les programmes de sécurité des patients en suivant les infections résistantes aux antimicrobiens et l’utilisation d’antibiotiques dans les soins de santé, a fourni des capacités supplémentaires pour prendre en charge la collecte de données COVID-19 dans les hôpitaux et les maisons de retraite.

« Nous devons mettre l’accent sur et étendre la mise en œuvre des stratégies de prévention efficaces qui sont déjà dans la boîte à outils du CDC à tous les établissements de santé », a déclaré Denise Cardo, MD, directrice de la division de la promotion de la qualité des soins de santé du CDC. « Le lancement en 2021 du Global AR Lab and Response Network et du Global Action in Healthcare Network est un exemple de l’agressivité avec laquelle les CDC agissent pour lutter contre la résistance aux antimicrobiens, non seulement aux États-Unis, mais dans près de 50 pays à travers le monde. Nous avons fait des progrès significatifs. avant la pandémie, et je suis convaincu que nous ferons des progrès significatifs à l’avenir. »

Avec la prévention et la préparation comme objectif principal, le CDC reste attaché au Plan d’action national américain pour la lutte contre les bactéries résistantes aux antibiotiques (CARB) et ira de l’avant en comblant les lacunes du système de santé publique et en explorant les investissements dans l’infrastructure de santé américaine dans les domaines clés suivants domaines :

  • Améliorer les systèmes de données et le partage : Étendre l’automatisation des données électroniques dans le cadre du NHSN pour permettre aux établissements et aux systèmes de santé de disposer des informations dont ils ont besoin sur l’utilisation des antibiotiques et la résistance aux antimicrobiens. De plus, cela inclut le partage de réseaux établis comme le réseau de laboratoires AR du CDC pendant les urgences, l’utilisation de la télésanté pour la recherche des contacts et le travail pour soutenir les fournitures et équipements de laboratoire ininterrompus pour les soins aux patients et le contrôle des infections.
  • Contrôle d’infection: Continuer à offrir une formation de haute qualité sur la prévention et le contrôle des infections comme Project Firstline à tous les professionnels de la santé et aux établissements de santé au-delà des hôpitaux, tels que les maisons de soins infirmiers et autres établissements de soins de longue durée. Cela signifie également éduquer le public sur la manière dont il peut arrêter la propagation des germes et pratiquer la prévention des infections dans les communautés où il vit et travaille.
  • Utilisation et accès aux antibiotiques/antifongiques: Optimisation de l’utilisation des antibiotiques dans tous les établissements de santé et mise en œuvre des éléments de base du CDC dans tous les établissements de santé. De plus, travailler à promouvoir l’utilisation et le suivi optimaux des antibiotiques et des antifongiques pour les animaux de compagnie et l’agriculture.
  • Environnement et Assainissement : Étendre la capacité du système national de surveillance des eaux usées à collecter des données sur la résistance aux antimicrobiens dans les usines de traitement des eaux usées et les établissements de santé, en étudiant la résistance dans les eaux usées communautaires et de soins de santé au niveau national et mondial. Cela comprend également l’expansion des capacités mondiales pour lutter contre la résistance aux antimicrobiens dans l’environnement et surveiller la résistance aux antimicrobiens dans One Health.
  • Vaccins, thérapeutiques et diagnostics : Améliorer la collaboration interagences pour accélérer la recherche pour le développement de nouveaux antibiotiques, antifongiques et thérapeutiques. Par exemple, travailler avec la Food and Drug Administration pour identifier les moyens de soutenir la disponibilité des produits de décolonisation. Cela comprend également le soutien à l’utilisation de vaccins pour prévenir les infections, ralentir la propagation de la résistance et réduire l’utilisation d’antibiotiques, et créer une plateforme de données sur les vaccins pour éclairer le développement de nouveaux vaccins.

Le CDC est et restera à l’avant-garde de la lutte contre la résistance aux antimicrobiens. Bien que la pandémie ait annulé une grande partie des progrès de la dernière décennie en matière de prévention et de contrôle des infections, la lutte va maintenant prendre un regain de ferveur dans les actions de santé publique axées sur la prévention pour assurer la sécurité du pays.

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