Des chercheurs du Francis Crick Institute, de l’Université de Cambridge, de l’Imperial College de Londres, de l’Université de Liverpool, de l’Université du Cap et de l’UKHSA ont découvert un lien entre un médicament antiviral contre les infections au COVID-19 appelé molnupiravir et un schéma de mutations dans le Virus SRAS-CoV-2.
Le molnupiravir agit en induisant des mutations dans l’information génétique du virus, ou génome, lors de la réplication. Beaucoup de ces mutations endommageront ou tueront le virus, réduisant ainsi la charge virale dans le corps. Il s’agit de l’un des premiers antiviraux disponibles sur le marché pendant la pandémie de COVID-19 et il a été largement adopté par de nombreux pays.
Dans une recherche publiée dans Nature aujourd’hui, les scientifiques ont utilisé des bases de données mondiales de séquençage pour cartographier les mutations du virus SARS-CoV-2 au fil du temps. Ils ont analysé un arbre généalogique de 15 millions de séquences du SRAS-CoV-2 afin qu’à chaque étape de l’histoire évolutive de chaque virus, ils puissent voir quelles mutations s’étaient produites.
Bien que les virus mutent tout le temps, les chercheurs ont identifié des événements mutationnels dans la base de données mondiale de séquençage qui semblaient très différents des modèles typiques de mutations du COVID-19, et qu’ils étaient fortement associés à des individus ayant pris du molnupiravir.
Ces mutations ont augmenté en 2022, coïncidant avec l’introduction du molnupiravir. Ils étaient également plus susceptibles d’être observés dans les groupes d’âge plus âgés, ce qui est cohérent avec l’utilisation d’antiviraux pour traiter les personnes plus à risque, et dans les pays connus pour avoir une forte utilisation du molnupiravir. En Angleterre, les chercheurs ont analysé les données de traitement et ont découvert qu’au moins 30 % des événements impliquaient l’utilisation de molnupiravir.
Les causes des événements mutationnels peuvent être retracées en examinant leur « signature mutationnelle » : une préférence pour que des mutations se produisent sur des séquences particulières du génome. Les chercheurs ont découvert une correspondance étroite entre la signature observée dans ces événements mutationnels et la signature lors des essais cliniques sur le molnupiravir.
Les chercheurs ont également observé de petits groupes de mutations suggérant une transmission ultérieure d’une personne à une autre, bien qu’aucune variante préoccupante établie ne soit actuellement liée à cette signature.
Il est difficile de comprendre l’impact du traitement par le molnupiravir sur les risques de nouveaux variants et leur impact éventuel sur la santé publique. Il est également important de considérer que les infections chroniques au COVID-19, pour lesquelles le molnupiravir est utilisé, peuvent elles-mêmes entraîner de nouvelles mutations.
Le COVID-19 a toujours un effet majeur sur la santé humaine et certaines personnes ont des difficultés à éliminer le virus. Il est donc important que nous développions des médicaments visant à réduire la durée de l’infection. Mais nos preuves montrent qu’un médicament antiviral spécifique, le molnupiravir, entraîne également de nouvelles mutations, augmentant ainsi la diversité génétique de la population virale survivante.
Nos résultats sont utiles pour l’évaluation continue des risques et des bénéfices du traitement par le molnupiravir. La possibilité de mutations persistantes induites par les antiviraux doit être prise en compte pour le développement de nouveaux médicaments fonctionnant de manière similaire. Nos travaux montrent que la taille sans précédent des ensembles de données sur les séquences post-pandémiques, construits en collaboration par des milliers de chercheurs et de professionnels de la santé du monde entier, crée un pouvoir énorme pour révéler des informations sur l’évolution du virus qui ne seraient pas possibles à partir de l’analyse des données d’un pays donné. ‘ »
Theo Sanderson, auteur principal et chercheur postdoctoral, Francis Crick Institute
Christopher Ruis, du département de médecine de l’Université de Cambridge, a déclaré : « Le molnupiravir est l’un des nombreux médicaments utilisés pour lutter contre le COVID-19. Il appartient à une classe de médicaments qui peuvent provoquer une telle mutation du virus qu’il est mortellement affaibli. Mais ce que nous avons découvert, c’est que chez certains patients, ce processus ne tue pas tous les virus et que certains virus mutés peuvent se propager. Il est important d’en tenir compte lors de l’évaluation des bénéfices et des risques globaux du molnupiravir et médicaments similaires. »
