Depuis l’émergence du coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS-CoV-2) à Wuhan, en Chine, fin décembre 2019, plus de 240 millions d’infections enregistrées et plus de 4,89 millions de décès ont été attribués à ce nouveau bêtacoronavirus. À l’échelle mondiale, l’économie a été gravement perturbée, les systèmes de santé de nombreux pays étant sur le point de s’effondrer. Heureusement, avant la fin de 2020, plusieurs vaccins affichant une efficacité élevée ont été approuvés, notamment les vaccins à base d’ARN messager (ARNm) Moderna et Pfizer/BioNTech, qui offrent une protection à 90 % contre la maladie.
La variante D614G du SRAS-CoV-2 a été la première variante à avoir un avantage de survie, c’est-à-dire qu’elle était plus transmissible que la souche d’origine. Ce variant n’échappait pas à l’immunité et semblait plus sensible aux anticorps neutralisants. Cependant, l’émergence de variantes à propagation rapide vers la fin de 2020, notamment B.1.351, P.1, B.1.1.7 et B.1.427/B.1.429, était plus inquiétante.
Pour combler les lacunes dans les connaissances, une équipe de chercheurs de l’Université de Californie et du Gladstone Institute of Virology a effectué un phénotypage de 39 paramètres par cytométrie par temps de vol (CyTOF) sur 33 échantillons longitudinaux de 11 individus vaccinés par l’ARNm, dont six avaient déjà été infectés et guéris du COVID-19.
Cette étude est disponible sous forme de manuscrit accepté sur le site Web elifesciences.org.
Les cellules T spécifiques du SRAS-CoV-2 induites par la vaccination peuvent-elles reconnaître les variantes B.1.351 et B.1.1.7 ?
Chez les participants naïfs d’infection, une réponse des lymphocytes T CD4+ spécifique au pic a été amorcée après la première vaccination, qui a été renforcée avec la deuxième dose. L’exposition aux pointes ancestrales et variantes a stimulé un nombre similaire de cellules pour chaque participant, ce qui suggère que les pointes ancestrales et variantes sont reconnues de manière égale par les cellules T CD4+ spécifiques aux pointes provoquées par le vaccin.
Une réponse plus faible a été observée dans les cellules T CD8+ déclenchées par le vaccin, mais de légères améliorations ont été observées après la deuxième dose.
En comparaison avec les participants naïfs d’infection qui présentaient des cellules T CD4+ spécifiques aux pointes dont les cellules T CD4+ ont été stimulées après la deuxième dose, les individus précédemment infectés n’ont pas montré de tendance à la hausse constante. Un participant précédemment infecté avait une fréquence significative de cellules T CD4+ spécifiques au SRAS-CoV-2 avant la vaccination qui n’augmentaient qu’à plus de 1 % de la fréquence totale des cellules CD4+ T après la première dose, puis s’amortissaient après la deuxième dose.
Les résultats des niveaux de réponse des lymphocytes T spécifiques aux pointes suggèrent ensemble que la deuxième dose de vaccin stimule la réponse des lymphocytes T CD4+ chez les individus naïfs d’infection, les individus ayant déjà été infectés présentent une réponse différente qui est principalement plus faible que chez les individus naïfs d’infection, et Les cellules T CD4+ présentent une réponse plus robuste par rapport aux cellules T CD8+.
Une stimulation de six heures avec des peptides de pointe n’induit pas d’expression significative d’IL4, d’IL17 ou de marqueurs d’activation dans les cellules T spécifiques du SRAS-CoV-2. (A, B) Les cellules T CD4+ ont été évaluées pour l’expression de la cytokine Th2 IL4 (A) ou de la cytokine Th17 IL17 (B) après 6 heures de stimulation avec des peptides de pointe ancestraux à l’aide d’échantillons de PBMC provenant d’un individu représentatif naïf d’infection (PID4197) avant la vaccination (Pré-vac), ou deux semaines après la dose 1 ou la dose 2 de la vaccination. (C) Les cellules T CD4 + ont été évaluées pour la co-expression des marqueurs induits par l’activation (AIM) Ox40 et 4-1BB après 6 heures de stimulation, en utilisant les mêmes échantillons que le panneau A. (D) Les cellules T CD8 + ont été évaluées pour co831 expression de l’AIM CD69 et 4-1BB après 6 heures de stimulation, en utilisant les mêmes échantillons que le panel A. Les échantillons de base non traités avec le peptide sont présentés comme contrôle de comparaison. Les nombres correspondent aux pourcentages de cellules dans les portes. Notez que les cellules activées (AIM+) qui apparaissent dans les échantillons stimulés ne reflètent probablement pas la stimulation spécifique au peptide, car les cellules AIM+ sont également détectées dans les échantillons de base.
Les lymphocytes T CD4+ spécifiques aux pics induits par la vaccination provenant d’individus précédemment infectés présentent 257 caractéristiques phénotypiques uniques d’une longévité accrue et d’un homing tissulaire
Lorsque les résultats d’un individu précédemment infecté qui était une valeur aberrante ont été supprimés, l’ampleur de la réponse des lymphocytes T CD4+ spécifique au pic semblait être plus faible chez les individus précédemment infectés par rapport aux participants naïfs d’infection après une vaccination complète. Cependant, aucune différence significative n’a été détectée lorsque tous les participants ont été inclus. Cependant, des différences phénotypiques ont été observées dans les cellules T CD4+ spécifiques aux pointes des cellules précédemment infectées et naïves d’infection.
Les différences dans les lymphocytes T CD4+ étaient beaucoup plus prononcées après la deuxième dose de vaccination. Les individus complètement vaccinés précédemment infectés semblaient avoir plus de cellules Tcm et Tn spécifiques des pointes et moins de cellules Ttm spécifiques des pointes. En revanche, aucune différence n’a été observée chez les individus naïfs d’infection et précédemment infectés en ce qui concerne la fréquence des cellules Tfh et Treg.
Les auteurs ont ensuite évalué la longévité potentielle des cellules T CD4+ spécifiques aux pointes en déterminant le pourcentage de cellules CD127+ qui expriment de faibles niveaux du marqueur de différenciation terminal CD57. Par rapport aux individus naïfs d’infection, les individus précédemment infectés avaient plus de cellules T CD4+ spécifiques du pic CD127+CD57 à longue durée de vie.
Le marqueur CXCR4 était le deuxième plus exprimé parmi les cellules T CD4+ spécifiques aux pointes d’individus précédemment infectés et il a été récemment rapporté qu’il dirigeait les cellules T témoins vers les poumons lors d’une infection active par le SRAS-CoV-2 et s’est avéré co-exprimé. avec la mémoire résidente T/marqueur d’activation CD69. De plus, les cellules T CD4+ spécifiques aux pointes d’individus précédemment infectés présentaient des cellules CXCR4+CD69+ très élevées, suggérant une capacité accrue à pénétrer dans le tissu pulmonaire.
Implications
Les cellules T sont des orchestrateurs et effecteurs extrêmement essentiels pour une réponse immunitaire efficace. En raison de la longévité des cellules T, ces cellules peuvent détenir la clé d’une immunité à long terme contre des virus tels que le SRAS-CoV-2. Les auteurs de cette étude ont conçu une étude longitudinale qui a évalué la fréquence et les caractéristiques phénotypiques des cellules T spécifiques du SRAS-CoV-2.
Si les stratégies actuelles de vaccination n’aboutissent pas à des réponses cellulaires et humorales robustes, alors les stratégies qui provoquent des cellules B et T spécifiques du SRAS-CoV-2 à domicile muqueux peuvent fonctionner mieux pour atteindre l’immunité souhaitée. Par conséquent, étant donné que les réponses cellulaires et humorales sont probablement la clé du contrôle de la réplication virale, les études futures devraient examiner dans quelle mesure l’étendue, les isotypes et les caractéristiques fonctionnelles des anticorps spécifiques aux pointes induits par la vaccination sont associés aux caractéristiques phénotypiques du vaccin. a suscité des cellules T spécifiques au SRAS-CoV-2.
