Dans une étude récente publiée dans la revue Emerging Infectious Diseases du CDC, des chercheurs ont caractérisé la physiopathologie de l’infection par l’organisme viral hautement pathogène de la grippe aviaire (IAHP) A (H5N1) appartenant à la lignée eurasienne et au clade 2.3.4.4b dans des organismes terrestres non domestiqués. animaux à travers les États-Unis (US) entre le 1er avril et le 21 juillet 2022.
L’IAHP A (H5N1) s’est répandue en Europe et aux États-Unis à partir d’octobre 2021. Le virus, comparable à ceux trouvés dans les souches eurasiennes, a été identifié aux États-Unis en décembre 2021 et s’est propagé aux animaux domestiques et aux oiseaux non domestiques. Le virus continue d’être actif dans les réservoirs d’oiseaux non domestiques, et des cas de débordement et de maladies cliniques chez de nombreuses espèces animales se produisent dans les pays européens en 2021.
Étude : Infections hautement pathogènes du clade 2.3.4.4b du virus de la grippe aviaire A(H5N1) chez des mammifères terrestres sauvages, États-Unis, 2022. Crédit d’image : RT Images/Shutterstock
À propos de l’étude
Dans la présente étude, les chercheurs ont présenté une série de cas mettant en évidence la physiopathologie des infections spontanées par l’IAHP H5N1 chez les animaux sauvages terrestres aux États-Unis, qui ont coïncidé avec des niveaux élevés de virus de la grippe aviaire hautement pathogènes en circulation parmi les espèces aviaires non domestiquées au cours de l’été et printemps 2022.
Les cas comprenaient des spécimens opportunistes d’animaux sauvages malades ou morts envoyés aux autorités nationales chargées de la faune ou à des laboratoires vétérinaires pour diagnostic. Les professionnels de la faune et les vétérinaires, les citoyens et les rééducateurs ont rapporté des observations cliniques. Tous les animaux ont subi des examens post mortem effectués par des pathologistes ou des vétérinaires, à l’exception de deux renards roux, qui n’ont fourni que des échantillons ante mortem.
Photographies macroscopiques de lésions post-mortem de renards roux naturellement infectés par le virus de la grippe aviaire hautement pathogène, États-Unis. A) Les poumons ne se sont pas effondrés et sont œdémateux de manière diffuse et marbrés de rose à rouge foncé. B) Coupe transversale du ventricule gauche du cœur montrant une région focale de pâleur myocardique dans le muscle papillaire (flèches). C) Contenu de l’estomac avec plumes.
Les échantillons post-mortem comprenaient des écouvillons dans des milieux de transfert viral, des échantillons de tissus congelés ou réfrigérés et des tissus conservés dans du formol à 10 %. En plus de l’extraction totale de l’acide nucléique et de la séparation de l’acide ribonucléique (ARN), les chercheurs ont utilisé la réaction en chaîne par polymérase-transcription inverse (RT-PCR) pour cibler le site conservé des gènes matriciels du virus de la grippe A (IAV). L’équipe a effectué deux tests pour le sous-typage H5 du virus de la grippe A : RT-PCR ciblée sur le gène de l’hémagglutinine des sous-types IAV et H5 et RT-PCR ciblée sur le clade 2.3.4.4b du sous-type H5 pour les lignées nord-américaines, eurasiennes et mexicaines du virus. .
Des tests de pathotypage du clade H5 2.3.4.4 et des tests ciblés sur la neuraminidase 1 (N1) pour le pathotypage rapide et le sous-typage N1 ont été effectués pour évaluer les échantillons positifs à l’IAV. L’équipe a construit des arbres d’interprétation phylogénétique et des tableaux de polymorphisme mononucléotidique (SNP) en utilisant une référence comprenant six segments du virus H5N1 clade 2.3.4.4b et deux de virus aviaires non domestiqués des régions du nord de l’Amérique. Les pathologistes vétérinaires des instituts ont traité des échantillons fixés au formol pour un examen histopathologique. De plus, un examen d’immunohistochimie monoclonale (IHC) pour détecter l’antigène de la grippe A et du virus de la maladie de Carré (CDV) a été réalisé.
Résultats
L’IAHP a été identifiée chez 67 animaux non domestiqués dans 10 États américains entre avril et juillet 2022, dont 50 renards de couleur rouge, six mouffettes rayées, quatre ratons laveurs, deux lynx roux, deux opossums de Virginie, un coyote, un pêcheur et un renard gris. . Les pathologies les plus répandues chez les animaux infectés étaient la méningo-encéphalite nécrosante, la pneumonie interstitielle et la nécrose cardiaque. L’examen des séquences de 48 animaux révèle que ces cas sont le résultat de maladies d’oiseaux sauvages.
Le coyote, les mouffettes rayées, les renards roux, les opossums et trois (sur quatre) ratons laveurs étaient des juvéniles, tandis que les lynx roux, les renards gris et les pêcheurs étaient des adultes. Il n’y avait aucune préférence sexuelle au sein de l’espèce biologique. Les mouffettes numérotées de 1 à 5 faisaient partie de deux portées de camélidés dans des centres de réhabilitation, et deux opossums et 12 renards roux étaient fortement soupçonnés ou connus d’être des compagnons de portée. Un vétérinaire ou un rééducateur de la faune a soigné 44 animaux ; neuf animaux sont morts et 13 ont été euthanasiés sur le terrain. La léthargie, la fièvre, la diarrhée, la perte de conscience, le décubitus, la paralysie et les vomissements étaient moins fréquents.
La dyspnée est survenue chez deux mouffettes, un renard roux et un lynx roux. Un examen post mortem de 58 animaux a indiqué que la plupart avaient une alimentation passable ou bonne. Les anomalies pulmonaires étaient constantes, l’hémorragie et la congestion étant les lésions cérébrales les plus répandues. D’autres comprenaient la pâleur, la congestion, l’hypertrophie, l’hémorragie hépatique et la congestion rénale avec hémorragie corticale. L’équipe a rarement observé un épanchement péricardique, une pâleur et des pétéchies dans les tissus myocardiques.
Les nématodes étaient répandus dans les tissus gastro-intestinaux, tandis que d’autres anomalies rares comprenaient la congestion, les saignements et les selles molles. L’examen histopathologique de 55 animaux a montré que le lobe frontal était le site cérébral le plus systématiquement touché. Le dépistage immunohistochimique de l’antigène de la grippe aviaire sur plusieurs organes parmi 29 animaux a identifié neuf génotypes H5N1 distincts sur la base des combinaisons uniques de segments génétiques eurasiens et nord-américains. Le virus non réassorti provenant d’un renard roux d’Alaska constituait une introduction distincte du H5N1 2.3.4.4b dans les Amériques sur la base de recherches phylogénétiques et d’une similarité de séquence avec les virus H5N1 d’origine asiatique dans les huit segments.
Sur la base de cette série de cas, le virus IAHP, une sorte de clade 2.3.4.4b de la lignée eurasienne H5, a été découvert chez des animaux terrestres sauvages aux États-Unis, élargissant ainsi la gamme d’espèces vulnérables au virus à l’échelle mondiale. De nombreux animaux nord-américains sont vulnérables à l’infection par le virus HPAI H5N1 via la consommation d’oiseaux sauvages infectés. La présentation clinique prédominante est constituée de symptômes neurologiques, et l’infection par le virus IAHP doit être considérée comme un diagnostic différentiel avec d’autres causes prévalentes de maladie neurologique chez les animaux sauvages.
