*Avis important: medRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, guider la pratique clinique/les comportements liés à la santé, ou traités comme des informations établies.
Dans une récente étude publiée sur medRxiv* serveur de préimpression, des chercheurs australiens rapportent la durabilité et la dynamique de l’immunité médiée par les anticorps ciblée par les protéines du coronavirus 2 (SRAS-CoV-2) de la pointe (S) du syndrome respiratoire aigu sévère rappelée au moins huit mois après une infection percée (BTI) avec le SRAS- Sous-variantes CoV-2 Omicron BA.1 et BA.2.
Étude: Reprogrammation durable des réponses d’anticorps neutralisants suite à une infection percée d’Omicron. Crédit d’image : Nemes Laszlo / Shutterstock.com
Sommaire
Arrière-plan
L’émergence continue de sous-variantes d’Omicron hautement transmissibles et immuno-évasives, associée à la diminution de l’immunité induite par le vaccin contre la maladie à coronavirus 2019 (COVID-19), a augmenté la fréquence des BTI chez les vaccinés COVID-19. Des études antérieures sur les réponses médiées par les lymphocytes B mémoire et les anticorps post-SARS-CoV-2 Delta ou BA.1 BTI ont montré un rappel rapide de la réponse humorale anti-S, une réactivation des lymphocytes B mémoire ciblée par S et une différenciation des cellules sécrétant des anticorps.
De plus, les Omicron BTI parmi les individus entièrement vaccinés améliorent l’étendue de la neutralisation, peut-être en raison de nouveaux anticorps ciblant les épitopes Omicron S ou de la réexpansion sélective des lymphocytes B à mémoire de protection croisée pendant la vaccination.
L’évaluation de l’influence des BTI avec de nouvelles sous-variantes d’Omicron sur l’étendue et la durabilité de l’immunité médiée par les lymphocytes B humoraux et mémoires pourrait éclairer le développement de vaccins optimisés pour une protection maximale contre les infections émergentes par le SRAS-CoV-2.
À propos de l’étude
Dans la présente étude, les chercheurs évaluent la cinétique initiale de la réponse immunitaire rappelée après les BTI BA.1 ou BA.2 et les altérations profilées de la neutralisation du SRAS-CoV-2 après la récupération.
Vingt-six personnes vaccinées contre la COVID-19, composées de trois personnes entièrement vaccinées et de 21 personnes ayant reçu une vaccination de rappel et de deux personnes ayant déjà été infectées par la souche ancestrale du SRAS-CoV-2 qui ont ensuite été vaccinées, ont été recrutées à la suite de BTI Omicron survenus après une médiane de 95 jours de recevoir la vaccination la plus récente.
Parmi les participants à l’étude, 19 des 21 personnes n’avaient aucun antécédent d’infection par le SRAS-CoV-2 et ont été vaccinées avec des vaccins COVID-19 codant pour la protéine S tels que ChAdOx1 nCoV-19, BNT162b2, NVX-CoV2373 et ARN messager (ARNm) -1273.
Les infections à BA.1 ont été confirmées par séquençage du génome entier (WGS). De plus, la cavité nasale et le sang des participants ont été prélevés pendant au moins 247 jours de suivi.
Les niveaux d’acide ribonucléique (ARN) du SARS-CoV-2 ont été déterminés à l’aide d’un test quantitatif de réaction en chaîne par polymérase (qPCR) pour le gène de la nucléocapside (N) du SARS-CoV-2. La neutralisation anti-Omicron a été modélisée pour estimer la durabilité de la protection immunitaire contre les réinfections symptomatiques avec des variantes préoccupantes (COV) du SRAS-CoV-2 à évasion immunitaire équivalente ou supérieure chez les personnes présentant une immunité hybride.
Une modélisation linéaire des effets mixtes a été réalisée pour estimer le taux de décroissance moyen. Les BTI ont été diagnostiqués à l’aide de tests antigéniques rapides et de PCR, tandis que les titres anti-N ont été déterminés à l’aide de tests immuno-enzymatiques (ELISA).
La souche SARS-CoV-2 ancestrale a été cultivée sur des cellules Vero, tandis que les sous-variantes BA.1, BA.2 et BA.4 ont été cultivées sur des cellules Calu3. L’infectivité du SRAS-CoV-2 a été évaluée à l’aide de cellules HAT-24 exprimant l’enzyme de conversion de l’angiotensine humaine 2 (ACE-2) et la sérine protéase transmembranaire 2 (TMPRSS2).
Le pourcentage de viabilité et de neutralisation a été déterminé sur la base des valeurs d’unités fluorescentes relatives (RFU) et de l’ID moyen50 valeurs et CI50 valeurs ont été déterminées. Une cytométrie en flux a été réalisée pour détecter les lymphocytes B ciblés SARS-CoV-2, avec un rappel d’anticorps modélisé et une cinétique de désintégration. L’efficacité du vaccin contre différents COV après BTI a été estimée.
Résultats
Tous les participants à l’étude ont développé des BTI BA.1 ou BA.2 symptomatiques mais légers. Ces infections ont fortement amélioré leur portée de neutralisation contre les COV responsables, élargissant ainsi la portée de neutralisation contre le BA.4 plus évasif du système immunitaire.
Les lymphocytes B mémoire à réaction croisée contre les protéines ancestrales et Omicron S ont été principalement développés par l’infection par le SRAS-CoV-2, avec des lymphocytes B ciblés Omicron ou des anticorps anti-SRAS-CoV-2 recrutés de manière limitée de novo.
Les estimations de modélisation ont indiqué que la protection immunitaire contre les réinfections symptomatiques avec des COV étroitement apparentés aurait une durabilité considérable, mais serait minée par des COV nouveaux et de plus en plus immunisés. Des analyses de suivi ont indiqué des réponses neutralisantes anti-Omicron durables.
Les BTI BA.1 et BA.2 ont montré une cinétique SARS-CoV-2 comparable, la plupart des individus infectés présentant des charges virales maximales à l’inscription et jusqu’à trois jours après l’apparition des symptômes. Le SRAS-CoV-2 s’est répliqué de manière robuste pendant les BTI Omicron, malgré les vaccinations précédentes.
Les titres sérologiques d’immunoglobuline G (IgG) anti-N étaient négligeables aux points de temps initiaux ; cependant, les titres ont constamment augmenté à partir d’une semaine après l’apparition des symptômes des BTI BA.1 et BA.2. La protection immunitaire a été estimée à plus de 70 % et a duré 705 jours et 1 607 jours après les BTI BA.1 et BA.2, respectivement.
Cinétique de la charge virale et séroconversion à N suite à une percée d’infection par Omicron BA.1 et BA.2. (A) Schéma de la collecte longitudinale d’échantillons après une infection percée d’individus vaccinés avec Omicron BA.1 (n = 10) ou BA.2 (n = 16). Chaque ligne représente un seul sujet et chaque point représente une collection d’échantillons (bleu, écouvillon nasal ; rouge, sang ; violet, écouvillon nasal et sang). (B) Cinétique de la charge virale du SRAS-CoV-2 dans les écouvillons nasaux mesurée par qPCR du gène de la nucléocapside (N). (C) Cinétique des titres plasmatiques d’IgG contre la nucléocapside du SRAS-CoV-2 (N) après une infection percée avec BA.1 (rouge) ou BA.2 (bleu). Les sujets ayant déjà été infectés par le SRAS-CoV-2 sont représentés dans des cercles fermés. Les lignes épaisses représentent l’estimation moyenne du modèle de régression linéaire par morceaux utilisant les paramètres estimés.
Même pendant la neutralisation maximale du SRAS-CoV-2, environ un mois après l’apparition des symptômes, les nouveaux COV avec une neutralisation trois et dix fois plus faible pourraient réduire l’efficacité de la protection immunitaire de 90,0 % à 74,0 % et 47,0 %, respectivement. Parmi les individus présentant une immunité hybride contre les BTI BA.1 et BA.2, l’efficacité protectrice passerait de 95,0 % à 86,0 % et 63,0 %, respectivement.
La récupération des BTI d’Omicron a conféré une protection immunitaire nettement durable contre des souches antigéniquement similaires ; cependant, la protection pourrait être renversée rapidement par l’émergence de COV plus évasifs au système immunitaire.
L’infection percée d’Omicron BA.1 et BA.2 rappelle rapidement les anticorps neutralisants qui sont larges et durables. (A) Cinétique de l’activité de neutralisation du plasma suite à une infection percée contre VIC01 ancestral ou des souches Omicron BA.1 et BA.2 infectantes correspondantes. Les lignes épaisses représentent l’estimation moyenne du modèle de régression linéaire par morceaux utilisant les paramètres estimés. L’activité de neutralisation du plasma a été mesurée à l’aide d’un test de neutralisation du virus vivant contre des isolats cliniques du SRAS-CoV-2 dans des cellules HEK293T transduites avec ACE2 et TMPRSS2. (B) Neutralisation médiée par le plasma de percée BA.1 et BA.2 contre les souches ancestrales VIC01, Omicron BA.1, BA.2 et BA.4 à une médiane de 34 jours après l’apparition des symptômes. Les données sont présentées sous forme de médiane ± IQR. ( C ) Cinétique de décroissance longitudinale de l’activité de neutralisation du plasma après une infection percée contre VIC01 ancestral ou des souches Omicron BA.1 ou BA.2 infectantes appariées jusqu’à 4 à 7 mois après l’apparition des symptômes. Les pentes de décroissance les mieux ajustées (lignes épaisses) sont représentées. (D) Titres d’anticorps IgG contre le pic BA.1 pour les sujets percés BA.1 (rouge) et contre le pic BA.2 pour les sujets percés BA.2 (bleu) après la pré-incubation avec le contrôle BSA (cercles fermés) ou le Wuhan ancestral -hu-1 pointe (cercles ouverts).
L’équipe a estimé qu’une efficacité protectrice de 70 % pour la souche homologue du SRAS-CoV-2 pourrait être maintenue pendant près de 4,5 et sept ans pour les BTI BA.1 et BA.2, respectivement. De même, on a estimé que la protection immunitaire durable pour la souche ancestrale du SRAS-CoV-2 persistait pendant plus de 8,5 ans et 10 ans pour les BTI BA.1 et BA.2, respectivement.
conclusion
Il a été constaté que les BTI d’Omicron induisaient des réponses immunitaires neutralisantes durables en rappelant les lymphocytes B mémoire à réaction croisée et induits par le vaccin.
*Avis important: medRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, guider la pratique clinique/les comportements liés à la santé, ou traités comme des informations établies.
