Alors que la maladie à coronavirus 2019 (COVID-19), causée par le coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS-CoV-2), continue d’affecter gravement la santé publique et l’économie mondiale, il est crucial de développer des moyens plus rapides pour détecter les cas positifs.
La flambée actuelle des cas de COVID-19 dans de nombreux pays, en particulier aux États-Unis et en Inde, peut nécessiter de meilleures stratégies de dépistage. De cette façon, les personnes infectées seront isolées plus rapidement et empêchent toute propagation potentielle.
Les tests groupés pour la détection du SRAS-CoV-2 sont essentiels pour augmenter la capacité de test tout en diminuant le coût des tests. Une équipe de chercheurs de l’Université de Yale a déterminé les obstacles à la mise en œuvre de tests groupés dans les laboratoires américains.
L’étude, qui est apparue sur le serveur de pré-impression medRxiv *, ont montré que de nombreux laboratoires utilisent de nombreux instruments dans leurs procédures de test, variant dans le nombre d’échantillons que chacun peut traiter.
Qu’est-ce que le test groupé?
Les tests groupés se produisent lorsque des échantillons d’un groupe de personnes sont combinés et testés en un seul lot. Les laboratoires collectent des échantillons biologiques individuels, en combinant des parties égales de chacun pour créer un «pool».
Les laboratoires utilisent la mise en commun pour leur permettre de tester plus d’échantillons avec moins de matériel de test. Cela pourrait être utile dans des scénarios tels que le retour de groupes d’employés sur un lieu de travail. En outre, cela permet de réduire le coût des tests d’échantillons individuels.
Si un test groupé renvoie négatif, tous les échantillons peuvent être présumés négatifs avec un seul test. Si le résultat groupé est positif, chacun des échantillons du pool devra être testé individuellement pour voir quels échantillons sont positifs.
Les Centers for Disease Control and Prevention (CDC) des États-Unis soulignent que la mise en commun ne devrait être utilisée que dans les zones ou les situations où le nombre de résultats de tests positifs devrait être faible, comme dans les zones à faible prévalence de cas de COVID-19.
Obstacles aux tests groupés
Dans la présente étude, l’équipe a invité 362 laboratoires qui avaient contacté la Yale School of Public Health, exprimant leur intérêt pour la conduite du test SalivaDirect, à participer à une enquête visant à évaluer les barrières de test et les stratégies de mise en commun pour le test du SRAS-CoV-2.
Les chercheurs ont reçu 90 réponses de laboratoires certifiés CLIA (Clinical Laboratory Improvement Amendments) entre la période d’enquête du 9 décembre 2020 et le 21 janvier 2021.
Près de la moitié des laboratoires qui ont répondu étaient à but lucratif, tandis que la plupart ont effectué des tests de diagnostic et des tests pour la surveillance générale et le dépistage d’événements spécifiques.
Les participants ont répondu à une question ouverte sur les obstacles aux tests en piscine. Une réponse commune est le manque de méthodes acceptées par les régulateurs et les autorités comme la Food and Drug Administration (FDA), CLIA ou les directeurs de laboratoire.
De nombreux laboratoires ont déclaré que l’absence de protocoles clairs rendait difficile la réalisation de tests groupés. Cela signifie que la démonstration de l’efficacité de la mutualisation dans leur cadre fait défaut.
En outre, d’autres laboratoires ont signalé que les taux locaux de positivité des cas étaient trop élevés pour nécessiter une mise en commun, malgré des données de laboratoire récentes montrant les avantages de la mise en commun donnant des échantillons jusqu’à un taux positif de 30%.
Les laboratoires ont signalé que le réexamen des pools positifs individuellement est trop difficile à gérer et peut exiger des ressources. Les laboratoires ont également noté que de nouveaux tests d’échantillons de pools positifs pourraient perturber le flux de test standard et les pratiques de dotation en personnel.
La logistique supplémentaire nécessaire pour suivre les échantillons grâce à la méthode groupée et le manque de logiciel pouvant aider à suivre les échantillons sont également considérés comme des obstacles à la mise en œuvre complète de la mise en commun aux États-Unis.
Un débit de test plus élevé, des coûts par jeu inférieurs et des délais d’exécution plus courts sont autant de marges pour l’amélioration des tests. Une solution recommandée était d’augmenter le nombre d’échantillons par test.
«Le besoin de tests restera pour les années à venir. Les tests groupés offrent des mesures de surveillance durables qui soutiennent les programmes à long terme, essentiels pour la détection précoce de la résurgence du virus ou de l’émergence de variantes préoccupantes », a expliqué l’équipe dans l’étude.
Les tests groupés peuvent aider à lutter contre le COVID-19 pour isoler rapidement les cas positifs sans avoir besoin de tester individuellement. Ce test peut permettre d’économiser du temps, des efforts et de l’argent, tout en contribuant à lutter contre la pandémie actuelle.
À ce jour, 146,58 millions de cas ont été signalés depuis le début de la pandémie. Parmi ceux-ci, 3,1 millions de personnes sont décédées. Les États-Unis et l’Inde rapportent le plus grand nombre de cas, atteignant respectivement 32 millions et 16,96 millions.
*Avis important
medRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, orienter la pratique clinique / les comportements liés à la santé ou être traités comme des informations établies.
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