Dans une étude récente publiée dans le Journal des maladies infectieusesles chercheurs ont réalisé une vaste étude sur la transmission dans les ménages pour décrire les résultats cliniques des infections endémiques à coronavirus humain (hCoV) et le risque de probabilités de transmission au niveau des ménages et de la communauté dans le comté d’Allegheny, en Pennsylvanie, aux États-Unis d’Amérique (États-Unis).
Étude: Dynamique de transmission domestique des coronavirus humains saisonniers. Crédit d’image : MariaSbytova/Shutterstock.com
Sommaire
Arrière-plan
Les chercheurs ont décrit et caractérisé quantitativement les taux d’attaque du CoV stratifiés selon l’âge, la fréquence des symptômes et les probabilités de transmission du CoV dans la communauté et les ménages.
Pour ce faire, ils ont utilisé un modèle binomial en chaîne dans un cadre bayésien qui a corrigé les données manquantes des ménages non testés.
Les hCoV endémiques provoquent des maladies respiratoires, en moyenne, au moins une fois chez les enfants de moins de cinq ans. Les quatre souches de hCoV, HCoV-229E, HCoV-HKU1, HCoV-OC43 et HCoV-NL63, auront infecté des personnes à l’âge adulte. Des études sérologiques et virologiques ont montré qu’ils réinfectent les gens tout au long de leur vie.
Des études de recherche des contacts ont précédemment démontré que les contacts familiaux courent un risque plus élevé d’acquisition du coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS-CoV-2) que leurs homologues non domestiques.
En raison de l’évolution continue du SRAS-CoV-2 et de l’immunité généralisée au niveau de la population contre l’infection et la vaccination, la surveillance des personnes asymptomatiques est devenue encore plus cruciale pour comprendre la transmission du SRAS-CoV-2 dans les ménages.
À cet égard, la compréhension de l’épidémiologie des HCoV endémiques, leur caractérisation par des études de transmission dans les ménages et leur comparaison avec l’épidémiologie du SRAS-CoV-2 pourraient aider à déterminer la transmission et les facteurs de risque changent pour le changement du SRAS-CoV-2 à mesure que la maladie à coronavirus 2019 ( COVID-19) la pandémie progresse.
De plus, cela pourrait aider à identifier un autre agent pathogène endémique qui pourrait infecter les humains.
À propos de l’étude
Dans la présente étude, les chercheurs ont utilisé les données d’une étude en milieu scolaire, la surveillance de l’absentéisme et de la transmission respiratoire (SMART). L’étude a été menée auprès d’enfants scolarisés âgés de cinq à 19 ans et des membres de leur famille dans le comté d’Allegheny, en Pennsylvanie, pour estimer la probabilité de transmission d’infections par hCoV confirmées par la réaction en chaîne de la polymérase par transcriptase inverse (RT-PCR) chez des personnes infectées. aux contacts familiaux.
La population à l’étude a connu 121 infections saisonnières au hCoV confirmées par RT-PCR, évaluées par la surveillance hebdomadaire de la maladie sur deux saisons de virus respiratoires, de décembre 2015 à avril 2016 et de janvier 2017 à mai 2017.
L’équipe a suivi de manière prospective 164 et 163 ménages pour un syndrome grippal (SG) pendant 22 et 16 semaines au cours des première et deuxième années, respectivement. Dans l’ensemble, ils ont recruté et suivi 947 personnes de 223 ménages.
Ensuite, les chercheurs ont envoyé des kits d’écouvillonnage nasal auto-administrés à tous les ménages signalant un événement de SG. Ensuite, ils ont testé ces échantillons d’écouvillonnage à l’aide d’un panel RT-PCR multiplex pour identifier les échantillons positifs pour les HCoV respiratoires.
Le modèle de l’étude supposait qu’une seule génération de transmission au sein du ménage par semaine du ménage, ce qui signifie qu’il n’y avait pas de cas index. En outre, il a fonctionné sur l’hypothèse que les personnes infectées par un HCoV transmettaient cette souche à d’autres personnes sujettes au sein du ménage. Plus tard, ils ont maximisé la somme des quatre log-vraisemblances spécifiques à la souche.
L’étude s’est concentrée principalement sur quatre hCoV, à savoir, HCoV-229E, HcoV-HKU1, HcoV-NL63 et HcoV-OC43, et cinq groupes d’âge, les enfants de moins de cinq ans, les enfants de cinq à neuf ans, les adolescents âgés de 10 à 19 ans, adultes âgés de 20 à 49 ans et adultes ≥ 50 ans.
L’équipe a rapporté la proportion d’infections par le HCoV selon les caractéristiques démographiques et cliniques et les variables continues et catégorielles sous forme de médiane et de pourcentages (%), respectivement, et le taux d’attaque secondaire (SAR) des ménages pour les ménages ayant au moins un cas de HCoV.
Ils ont calculé le SAR en tant qu’infections par le HCoV moins un divisé par la taille du ménage moins un. Ils ont également rapporté des intervalles de confiance (IC) binomiaux exacts à 95 % pour les proportions.
Résultats
Les auteurs ont noté que la transmission entre les membres du ménage représentait 21 % de toutes les infections par le HCoV, et que la plupart des infections étaient dues au sous-type HCoV-OC43. Cependant, contrairement aux études précédentes, les auteurs n’ont observé aucune différence dans l’acquisition communautaire entre les adultes et les enfants.
Comparativement aux adultes infectés par le hCoV, une proportion plus élevée d’enfants (<19 ans) ont développé des symptômes de SG (risque relatif 3, IC à 95 %), indiqués par de la fièvre et de la toux/des maux de gorge, et la probabilité d'acquisition communautaire hebdomadaire était de 7 %. Bien que la transmission domestique se produise probablement à partir d'individus symptomatiques et asymptomatiques, les individus asymptomatiques ont contribué de 20 % à 40 % à la transmission domestique des CoV endémiques dans différents modèles.
Tous les enfants, en particulier les plus jeunes, ont plus fréquemment présenté une infection symptomatique, ce qui suggère qu’ils avaient moins d’immunité préexistante que les personnes plus âgées signalant moins de symptômes et des proportions plus élevées d’infections asymptomatiques.
Généralement, les adultes sont sujets à l’infection par le hCoV, mais ont une certaine immunité. Pourtant, les probabilités de transmission de la communauté ou du ménage ne variaient pas selon l’âge ou l’état des symptômes. De plus, des simulations ont suggéré que cette étude n’était pas suffisamment puissante pour détecter de telles différences.
conclusion
Cette étude a combiné la surveillance symptomatique avec l’écouvillonnage domestique pour capturer les infections symptomatiques et asymptomatiques et étudier la contribution relative de chacune à la transmission domestique des hCoV endémiques communs.
Cependant, des études avec des ensembles d’échantillons plus importants sont justifiées pour obtenir des résultats robustes sur les variations liées à la transmissibilité par caractéristiques individuelles.
Néanmoins, l’étude a fourni des informations indispensables sur l’étendue de la transmission domestique et les facteurs associés au SAR dans les ménages pour éclairer les plans d’étude pour la transmission domestique du SRAS-CoV-2.
