Dans une étude récente publiée dans le Nutriments Journal, les chercheurs ont analysé les données du génome entier d’échantillons fécaux de volontaires sains suivant l’un de ces trois régimes, végétarien ou végétalien (VV), omnivore (OV) et régime planétaire (PH).
L’étude visait à étudier les changements de composition du microbiote intestinal associés à ces régimes pendant une période de 12 semaines.
Étude: L’effet d’un régime de santé planétaire sur le microbiome intestinal humain : une analyse descriptive. Crédit d’image : AnatomyImage/Shutterstock.com
Sommaire
Arrière-plan
La Commission EAT-Lancet, un conglomérat de 37 scientifiques de premier plan de 16 pays, a développé le régime PH en 2019.
Jusqu’à présent, les études n’ont pas évalué l’effet d’un régime PH sur le microbiome intestinal humain, qui est un déterminant clé de la santé humaine.
À propos de l’étude
Dans la présente étude, les chercheurs ont divisé les participants en trois groupes, deux groupes témoins, qui ont suivi un régime VV ou OV pendant au moins un an et le groupe d’intervention suivant le régime PH.
Les adeptes du régime PH ont commencé à utiliser des recettes et des instructions conformément aux directives de la commission EAT-Lancet lorsqu’ils sont passés d’un régime OV à un régime PH. Ils ont suivi toute divergence par rapport aux aliments recommandés tout au long de l’étude.
L’équipe a demandé à tous les participants ce qu’ils avaient mangé deux jours avant la collecte des matières fécales et leur consommation d’alcool à tout moment pendant la durée de l’étude afin de réduire tout biais potentiel résultant de la consommation d’aliments différents peu de temps avant la collecte des échantillons.
Ils ont prélevé des échantillons fécaux à quatre moments différents : au début de l’étude et après deux, quatre et 12 semaines. Ils ont extrait l’acide désoxyribonucléique (ADN) de ces échantillons pour effectuer un séquençage complet du métagénome.
De plus, ils ont utilisé la spectrométrie de masse (MS) à désorption/ionisation laser assistée par matrice (MALDI-TOF) pour analyser les bactéries extraites de ces échantillons et cultivées sur des plaques de gélose.
Résultats
La population étudiée comprenait 41 adultes en bonne santé âgés de ≥ 18 ans qui ont accepté de participer volontairement à cette étude dans la région de la Sarre au sud-ouest de l’Allemagne entre janvier et avril 2022.
Sur 41 participants, entre 16, 9 et 16 ont respectivement adhéré à un régime OV, VV et PH. Notamment, le groupe VV comptait plus de femmes (8/9), bien que les sex-ratios variaient considérablement dans les trois groupes.
Les chercheurs ont noté une diversité α relativement stable pour tous les groupes de régimes au cours de la période d’étude de 12 semaines, bien qu’ils aient observé de légers changements chez certains participants à différents moments.
L’abondance relative de Bifidobactérie adolescentis augmenté de 3,79 % à 4,9 % après 12 semaines dans le groupe PH. Notamment, son abondance a augmenté le plus dans le groupe VV.
L’analyse de l’abondance différentielle du groupe PH a également mis en évidence un pic minimal chez certaines espèces probiotiques, telles que Paraprévotella xylaniphila et Bacteroides clarus.
Le profilage taxonomique a permis de visualiser les différences liées à la diversité α dans les trois groupes d’étude. Au niveau du genre, les chercheurs ont noté que les personnes du groupe VV, immédiatement après l’inclusion, avaient deux à trois fois la quantité relative de Bifidobactérie, Prevotellaet Gemmiger espèces dans leur intestin par rapport aux témoins des groupes OV et PH. L’abondance relative de Prévotelle était de 1,3 % dans le groupe OV.
Bien que non considéré comme significatif lors de l’analyse de l’abondance différentielle, dans les quatre semaines suivant le régime PH, Bifidobactérie adolescentis et Coprococcus eutactus les espèces bactériennes ont augmenté en abondance dans l’intestin par deux fois.
Une étude précédente a montré que la consommation d’inuline, un type de fibre alimentaire, augmente l’abondance de B. adolescentis dans l’intestin. Cette bactérie dégrade l’inuline en lactate et acétate, qui est ensuite utilisé par les bactéries synthétisant les acides gras à chaîne courte (SCFA), par exemple, Entérocoque rectalepour produire le butyrate SCFA.
En se concentrant sur les 10 % d’effets les plus importants, les chercheurs ont pu analyser l’abondance différentielle de certaines espèces potentiellement intéressantes entre les groupes OV et VV.
Par exemple, parmi les individus du groupe PH, ils ont observé une augmentation de trois, quatre et 18 fois Prevotella copri, Paraprevotella xylaniphilaet Bacteroides clarus espèces, respectivement.
Inversement, le groupe PH a montré une abondance six fois moindre de Bactérie Firmicutes CAG 94, suggérant que le régime PH a déplacé des parties de la composition du microbiome vers un microbiome VV. Cette bactérie est une autre cible intéressante pour les recherches futures visant le développement de nouveaux probiotiques qui pourraient compléter une alimentation saine.
Les participants du groupe PH contenaient principalement ces quatre espèces, Streptococcus parasanguinis, Bacteroides uniformis, Enterobacter cloacaeet Streptococcus salivarius.
conclusion
Selon les résultats de la présente étude, complétés par une évaluation basée sur le séquençage métagénomique, le régime PH n’a pas modifié la composition microbienne intestinale globale, mais a favorisé la croissance de nombreuses espèces bactériennes bénéfiques.
Le passage au régime PH a favorisé la croissance d’espèces bactériennes, telles que B. adolescentis et P.copri. Les bactéries productrices d’AGCC exercent de nombreux effets anti-inflammatoires et régulateurs bénéfiques sur l’hôte.
Cependant, ils pourraient inhiber la croissance d’autres microbiotes bénéfiques ou augmenter le risque de certaines maladies. par exemple, une récente découverte que P.copri l’abondance a favorisé le développement de la polyarthrite rhumatoïde, même si les preuves étaient insuffisantes.
Ainsi, des études transnationales, longitudinales et à grande échelle devraient analyser en profondeur l’effet du régime PH sur la santé, l’homéostasie et la fonctionnalité intestinale.
De plus, des recherches supplémentaires sont justifiées pour confirmer les résultats de l’étude actuelle selon lesquels le régime PH a légèrement augmenté les bactéries probiotiques dans l’intestin à ≥ quatre semaines.
