Une nouvelle méthode permettant de déterminer rapidement si un virus est infectieux ou non infectieux pourrait révolutionner la réponse aux futures pandémies.
Appelé FÉE (Ffluorescence UNdire pour vIRl'intégritéY), le test peut détecter les virus par rapport aux antiviraux virucides en quelques minutes, ce qui permet de déterminer rapidement l'efficacité des mesures antivirales, telles que les désinfectants qui brisent la chaîne d'infection.
Le Dr Samuel Jones, de l'École de chimie de Birmingham, a dirigé l'équipe de recherche qui a développé le test FAIRY. Il a déclaré : « En moyenne, tous les quatre ans, un nouveau virus potentiellement pandémique est découvert, et il existe de nombreux autres virus déjà connus qui pourraient franchir la barrière des espèces. Pourtant, à notre connaissance, il n'existe actuellement aucun test capable de déterminer si un échantillon contient des virus intacts ou non intacts, et donc de montrer s'il est infectieux ou non, sans une culture cellulaire qui pourrait prendre des semaines. »
La méthode de référence actuelle pour déterminer l'infectiosité virale utilise des cellules en culture, ce qui prend plusieurs jours pour donner des résultats, nécessite du personnel spécialisé pour effectuer les tests et nécessite également une lignée cellulaire cultivable, qui n'est pas disponible pour tous les virus. La nécessité d'utiliser des cellules en culture limite également les techniques actuelles aux antiviraux qui ne sont pas nocifs pour les cellules, ce qui rend la découverte de nouvelles solutions désinfectantes un défi supplémentaire.
La nouvelle méthode utilise un colorant qui peut normalement pénétrer les virus à travers les pores de la capside (enveloppe protéique) qui entoure son matériel génétique (ADN ou ARN). Ce colorant est conjugué à une molécule plus grosse, ce qui l'empêche de pénétrer les pores de la capside. Lorsque le colorant se lie à l'ADN ou à l'ARN viral, il fournit un signal fluorescent.
Le test obtenu montre si le virus est intact, et donc infectieux, ou non.
Les chercheurs ont évalué l'efficacité du test en utilisant le virus de l'herpès simplex (HSV-2), le virus respiratoire syncytial (RSV), le cytomégalovirus (CMV), le rhinovirus humain-8 (HRV-8), le coronavirus humain OC43 (OC43), le virus chikungunya (CHIKV), le virus de la dengue 1 et le virus de la dengue 2, le virus Zika et l'entérovirus 71 (EV71).
Ces virus couvrent le spectre des virus enveloppés et non enveloppés ainsi que des virus à ADN et à ARN, démontrant véritablement le potentiel du test FAIRY. Les virus ont été traités avec une large gamme de produits chimiques ayant une activité virucide à large spectre, notamment le peroxyde d'hydrogène, l'éthanol, l'isopropanol et d'autres antiviraux, et ces tests ont confirmé que le test FAIRY a le potentiel d'étudier rapidement les virucides qui détruisent les capsides virales.
Ce test simple et peu coûteux utilise des consommables prêts à l'emploi et permet de tester rapidement plusieurs désinfectants et virus, dans un seul test sur microplaque, pour déterminer leur capacité à neutraliser l'infectiosité virale. Il aurait pu tester l'activité antivirale de chaque désinfectant pendant la pandémie de SARS-CoV-2 et ainsi apporter une réponse plus rapide lors de la prochaine pandémie.
Dr Samuel Jones, École de chimie de Birmingham
La méthode FAIRY est détaillée dans un article publié aujourd'hui dans Biomacromolécules ACS.
Le test FAIRY est basé sur des recherches qui ont été initialement lancées à l'Université de Manchester. University of Birmingham Enterprise a déposé une demande de brevet couvrant les composés, leurs méthodes et leur utilisation pour déterminer l'intégrité virale des échantillons de virus. La société recherche désormais des partenaires commerciaux pour des licences ou des collaborations et s'attend à un niveau d'intérêt élevé de la part des entreprises utilisant des tests virucides conformes à la norme ISO, des sociétés de test/dépistage et des organismes de recherche sous contrat.
