Dans une étude récente publiée sur le serveur de prétirage medRxiv*, les chercheurs ont surveillé les tendances de transmission de la maladie à coronavirus 2019 (COVID-19) à l’aide d’un nouveau cadre de surveillance sentinelle.
Étude : Suivi des changements dans la transmission du SRAS-CoV-2 avec un nouveau système de surveillance sentinelle ambulatoire à Chicago, aux États-Unis. Crédit d’image : GoodStudio/Shutterstock
Sommaire
Arrière-plan
La capacité des autorités de santé publique à suivre l’incidence des maladies et les schémas de transmission est devenue un élément essentiel de la réponse et de la préparation de la santé publique pendant la pandémie de COVID-19. Les décideurs politiques du monde entier ont appliqué des cadres d’atténuation régionaux par étapes, où l’avancement d’une région d’une phase de politique d’atténuation à la suivante dépend de certains indicateurs dépassant un seuil spécifique ou un taux de croissance comparatif. Cependant, les mesures de santé publique typiques pour la surveillance du coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS-CoV-2) pourraient être faussées ou prendre du retard sur les tendances changeantes de la transmission communautaire de la COVID-19.
Les populations sentinelles, qui ont déjà été utilisées ou suggérées pour surveiller la grippe pandémique et saisonnière, peuvent être utilisées pour détecter les changements dans la transmission de la COVID-19 dans la population générale. La surveillance du SRAS-CoV-2 sur la communauté sentinelle devrait être moins sensible au biais de sélection par rapport aux tests de diagnostic en général dans la population générale jusqu’à ce que les paramètres de test et les initiatives d’échantillonnage sur la population sentinelle restent établis et ne varient pas dans le temps.
À propos de l’étude
La présente étude visait à déterminer les schémas de transmission du COVID-19 avec un minimum de décalage et de biais dans la ville de Chicago aux États-Unis (États-Unis). Pour cela, l’équipe a utilisé les détails des personnes testées dans les services de test communautaires gérés par le Département de la santé publique de l’Illinois (IDPH) et le Département de la santé publique de Chicago (CDPH). Il convient de noter que ces centres de test ont été créés pour améliorer l’accès des populations sous-représentées au test du SRAS-CoV-2.
Schéma théorique du nombre effectif instantané de reproduction R
De plus, les auteurs ont réutilisé l’ensemble de données pour évaluer si la surveillance sentinelle des personnes nouvellement symptomatiques bénéficiant d’un test de diagnostic du SRAS-CoV-2 ambulatoire pouvait quantifier correctement le nombre reproductif instantané R
Les chercheurs ont déclaré que puisque l’initiation des symptômes survient plus tôt après le COVID-19 que l’hospitalisation, la technique de surveillance sentinelle basée sur les patients externes du SRAS-CoV-2 devrait fournir une récence opérationnelle supérieure aux mesures hospitalières, permettant de calculer R
Performance opérationnelle de la surveillance sentinelle. A) Nombre de cas sentinelles pour une date d’évaluation représentative du 27 février 2021. Points noirs : nombre de cas sentinelles entièrement accessible à la date d’évaluation. Points gris : nombre de cas sentinelles partiellement accessibles ou pas encore accessibles à la date de l’évaluation. Points rouges : nombre de cas sentinelles censurés à droite disponibles à la date de l’évaluation. Points bleus : calcule maintenant le nombre de cas sentinelles avec un modèle rétrospectif du mois précédent. Région ombrée en bleu : intervalle de confiance à 95 % pour les comptages immédiats. B) R
Résultats
Les résultats de l’étude ont montré que le volume quotidien d’échantillons sentinelles variait considérablement avec le temps et que la cohorte sentinelle n’était pas représentative de la population de Chicago. Cependant, le R
L’estimation naïve d’un délai rétrospectif des changements dans les cas sentinelles par rapport aux changements dans les hospitalisations était de cinq à six jours, car les symptômes devaient apparaître en moyenne 5,5 jours après l’infection et l’admission à l’hôpital se produit en moyenne 11,1 jours après l’infection. L’évaluation rétrospective de la corrélation croisée n’a indiqué aucun délai notable parmi les cas sentinelles et les paramètres hospitaliers.
Les visites aux urgences pour maladies de type COVID (CLI ED), les admissions à l’hôpital confirmées par COVID-19 (COVID admet), les admissions à l’hôpital CLI (CLI admet) et les visites aux urgences confirmées par COVID-19 (COVID ED) avaient le meilleur accord entre Estimations de R
Lors du déploiement à Chicago, l’avantage de la récence opérationnelle de la surveillance sentinelle était évident. Les données complètes des tests sentinelles étaient généralement disponibles après environ deux jours, tandis que celles des admissions à l’hôpital prenaient environ cinq jours. À une date d’évaluation régulière, les dernières estimations R
conclusion
Pour résumer, les résultats de l’étude ont illustré que le R
*Avis important
medRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, guider la pratique clinique/les comportements liés à la santé, ou traités comme des informations établies.
