Dans une récente étude publiée sur medRxiv* serveur de prétirage, les chercheurs ont étudié les différences dans les immunités induites par la vaccination et les infections antérieures contre les sous-variantes Omicron BA.2 et BA.4/5 du coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SARS-CoV-2).
Sommaire
Arrière plan
Depuis novembre 2021, les sous-variantes SARS-CoV-2 Omicron ont augmenté le nombre de cas de maladie à coronavirus 2019 (COVID-19) en raison de leur transmissibilité accrue et de leurs capacités d’évasion immunitaire. Les Pays-Bas ont connu une augmentation du nombre de cas pendant la domination de la sous-variante BA.1 Omicron à la fin de 2021, suivie de périodes de dominance BA.2, BA.4 et BA.5 ultérieures du début à la mi-2022.
Les sous-variantes d’Omicron présentent des mutations dans les résidus de protéines de pointe, ce qui entraîne une évasion accrue de l’immunité humorale. Des études ont montré que les sous-variantes BA.4 et BA.5 présentent le plus haut degré d’échappement à la neutralisation, ce qui soulève des inquiétudes quant à la récurrence des résultats graves du COVID-19.
À propos de l’étude
La présente étude a examiné l’effet du statut immunitaire induit par la vaccination et l’infection antérieure sur la survenue de BA.2 et BA.4/5 entre mai et juillet 2022 – la phase de transition entre la prédominance de BA.2 et BA.4/5.
Les chercheurs ont utilisé les résultats des tests positifs pour le SRAS-CoV-2 des tests communautaires nationaux effectués entre le 2 mai et le 24 juillet 2022 et ont effectué un échec de la cible du gène de pointe (S) (SGTF). Les informations pseudonymisées sur la démographie et le statut vaccinal ont également été obtenues auprès du registre national des tests communautaires.
Le test SGTF a été réalisé à l’aide de la réaction en chaîne par polymérase en temps réel TaqPath COVID-19 (RT-PCR). Combiné à des cycles de quantification inférieurs ou égaux à 30 pour amplifier les gènes du cadre de lecture ouvert 1 a et b (ORF1ab) et de la nucléocapside (N), l’incapacité à détecter le gène S est un proxy pour les variants contenant la délétion S 69/70, comme les sous-variantes Omicron BA.4 et BA.5. Les échantillons qui n’étaient pas SGTF étaient considérés comme BA.2 positifs, tandis que les échantillons SGTF étaient BA.4/5 puisque SGTF ne peut pas faire la distinction entre BA.4 et BA.5.
Le séquençage du génome entier (WGS) d’échantillons aléatoires de SGTF a également été effectué pour voir la proportion d’échantillons BA.4 à BA.5. Une combinaison des résultats de WGS et de SGTF des infections précédentes a été employée pour déterminer les variantes des infections SARS-CoV-2 précédentes. Les groupes de statut immunitaire ont été définis en fonction des antécédents de vaccination et des infections antérieures. Les infections BA.2 et BA.4/5 ont été corrélées à ces groupes de statut immunitaire à l’aide de diverses analyses statistiques.
Résultats
Les résultats ont révélé que, quel que soit le statut vaccinal, la fréquence des cas de BA.4/5 était plus élevée que celle des cas de BA.2 chez les personnes ayant déjà eu des infections, ce qui suggère une évasion immunitaire plus élevée par BA.4/5. BA.2 et BA.4/5 n’ont montré aucune association avec le statut vaccinal, ce qui implique que les vaccins confèrent une protection égale contre les trois sous-variantes.
Une infection antérieure avec le sous-variant BA.1 a présenté des effets protecteurs plus faibles et plus courts contre BA.4/5 que BA.2. Les auteurs ont noté qu’une étude similaire menée au Danemark et dans d’autres in vitro des études ont corroboré leurs résultats sur l’immunité induite par l’infection BA.1 étant inefficace contre BA.4/5. Ils ont également discuté d’études menées au Royaume-Uni et au Portugal, qui étayent leurs conclusions sur une immunité induite par la vaccination similaire contre BA.2 et BA.4/5.
Cependant, les auteurs pensent que l’évasion présentée par BA.2 et BA.4/5 de l’immunité induite par une infection antérieure est plus faible que celle observée pour BA.1 ou la variante Delta, ce qui indique une forte évasion d’anticorps entre les variantes antérieures préoccupantes. qu’entre les sous-variantes d’Omicron.
L’étude avait quelques limites. Sur la base du manque de confiance dans les informations sur l’infection précédente, les auteurs pensent que certaines personnes pourraient avoir été classées à tort comme non infectées auparavant. De plus, les infections BA.4 et BA.5 n’ont pas pu être séparées pour l’ensemble de données en raison d’un manque de données WGS. De plus, le seuil de 90 % utilisé pour les tests TaqPath RT-PCR aurait pu entraîner une mauvaise classification des sous-variantes. Les auteurs estiment toutefois que ces limitations ne sont pas susceptibles de modifier les résultats de manière significative.
Conclusion
Pour résumer, l’étude a révélé que BA.4/5 présente une fuite d’anticorps plus élevée que BA.2 contre l’immunité induite par des infections antérieures d’autres sous-variants tels que BA.1, quel que soit le statut vaccinal. La vaccination a été considérée comme accordant une protection uniforme contre les infections BA.2 et BA.4/5.
Les résultats sont significatifs car ils suggèrent que la vaccination offre une meilleure immunité contre les sous-variantes d’Omicron que l’immunité humorale contre les infections antérieures. Par conséquent, les mises à jour des vaccins et l’investigation de l’évasion immunitaire par les sous-variants émergents doivent être prioritaires.
*Avis important
medRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, guider la pratique clinique/les comportements liés à la santé, ou traités comme des informations établies.
