Des chercheurs du Quadram Institute et de l’Université d’East Anglia ont identifié ce qui rend certaines souches de bactéries intestinales potentiellement mortelles chez les bébés prématurés.
Les résultats aideront à identifier et à suivre les souches dangereuses et à protéger les nouveau-nés vulnérables.
L’entérocolite nécrosante (ENC) est une menace majeure pour les nouveau-nés de poids extrêmement faible à la naissance.
Rare chez les bébés nés à terme, cette infection microbienne exploite les vulnérabilités en détruisant les tissus intestinaux, entraînant de graves complications. Deux cas sur cinq sont mortels.
Une espèce bactérienne qui provoque une maladie particulièrement soudaine et grave est Clostridium perfringens. Celles-ci sont courantes dans l’environnement et des souches non pathogènes vivent dans des intestins humains sains.
Alors, qu’est-ce qui rend certaines souches si dangereuses chez les bébés prématurés ?
Le professeur Lindsay Hall et le Dr Raymond Kiu du Quadram Institute et de l’UEA ont mené la première grande étude sur C.perfringens génomes de bébés prématurés, y compris certains bébés atteints d’entérocolite nécrosante.
L’équipe de recherche a analysé C.perfringens génomes des échantillons fécaux de 70 bébés admis dans cinq unités néonatales de soins intensifs (NICU) du Royaume-Uni.
Sur la base des similitudes génomiques, ils ont découvert qu’un ensemble avait une capacité inférieure à provoquer des maladies. Cela a permis une comparaison avec les souches les plus virulentes.
Le groupe le moins virulent manquait de gènes responsables de la production d’une toxine appelée PFO et d’autres facteurs nécessaires à la colonisation et à la survie.
Cette étude a commencé à construire des signatures génomiques pour C.perfringens associés aux bébés prématurés en bonne santé et à ceux atteints d’entérocolite nécrosante.
Explorer les signatures génomiques de centaines de Clostridium perfringens nous a permis de faire la distinction entre les « bonnes » souches bactériennes qui vivent sans danger dans l’intestin des prématurés et les « mauvaises » associées à la maladie dévastatrice et mortelle de l’entérocolite nécrosante.
Nous espérons que les résultats aideront à « suivre » les décès C.perfringens souches chez un groupe de patients très vulnérables – les bébés prématurés. »
Prof Lindsay Hall, Norwich Medical School de l’UEA et Quadram Institute
Des études plus importantes, sur plus de sites et avec plus d’échantillons peuvent être nécessaires, mais cette recherche pourrait aider à identifier de meilleurs moyens de contrôler l’entérocolite nécrosante.
L’équipe a précédemment travaillé aux côtés du professeur Paul Clarke et de ses collègues cliniques à l’USIN de l’hôpital universitaire de Norfolk et de Norwich. Et ils ont démontré les avantages de fournir aux nouveau-nés des suppléments probiotiques.
Le microbiote intestinal de l’entérocolite des nouveau-nés est considérablement perturbé, ce qui le rend sensible à C.perfringens surcroissance.
Le professeur Hall a déclaré: « Notre étude génomique nous donne plus de données que nous pouvons utiliser dans la lutte contre les bactéries qui causent des maladies chez les bébés – où nous exploitons les avantages d’un autre résident microbien, Bifidobactériepour offrir aux bébés à risque le meilleur départ possible dans la vie. »
Le Dr Raymond Kiu, de l’Institut Quadram, a déclaré : « Il est important de noter que cette étude met en évidence le séquençage du génome entier comme un outil puissant pour identifier de nouvelles lignées bactériennes et déterminer les facteurs de virulence bactérienne au niveau de la souche, ce qui nous permet de mieux comprendre la maladie.
Cette recherche a été soutenue par le Conseil de recherche en biotechnologie et en sciences biologiques, qui fait partie de l’UKRI, et le Wellcome Trust.
L’étude a été menée par des chercheurs du Quadram Institute et de l’Université d’East Anglia, en collaboration avec des collègues de l’Imperial College de Londres, de l’Université de Glasgow, de l’Université de Cambridge, de l’Université de Newcastle et de l’Université de Northumbria.
«Traits génomiques et de virulence particuliers associés à la toxigénicité dérivée du nourrisson prématuré Clostridium perfringens souches » est publié dans Microbiologie naturelle.
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