Un test génétique connu sous le nom d’analyse de puces à ADN chromosomiques (CMA) pourrait aider à identifier la cause du syndrome de mort subite du nourrisson (SMSN) ou de son homologue chez les enfants plus âgés, connu sous le nom de mort subite inexpliquée de l’enfance (SUDC), selon une étude menée par le Boston Children’s Hospital .
Les chercheurs, dirigés par Richard Goldstein, MD, Ingrid Holm, MD, MPH, et Catherine Brownstein, MPH, PhD, appellent à faire de la CMA une routine pour enquêter sur le PEID et le SUDC. Ils ont publié les résultats de leur étude en ligne le 7 novembre dans la revue Génétique avancée.
« Nous pensons que nous avons suffisamment d’informations pour dire que l’AMC vaut la peine d’être envisagée lorsqu’un enfant est décédé sans explication, et mérite d’être explorée plus avant comme moyen de mieux comprendre ces décès », déclare Goldstein, qui dirige le programme de Robert sur la mort subite inattendue en pédiatrie à Boston Children’s et était l’un des principaux auteurs de l’étude.
L’équipe a utilisé la CMA pour tester des échantillons de 116 nourrissons et enfants en bas âge décédés jusqu’à 28 mois dont les décès ont été classés comme SMSN ou SUDC. Chez 14 enfants (12 %), l’AMC a identifié des délétions ou des duplications de segments de l’ADN de l’enfant ou de petits réarrangements d’ADN qui étaient pathogènes ou « favorisant le pathogène ».
L’AMC est déjà couramment utilisée chez les enfants atteints d’affections telles que l’autisme, un retard de développement et de multiples anomalies congénitales, et chez les enfants atteints d’affections non diagnostiquées. »
Ingrid Holm, co-auteur principal de l’étude
Pour valider davantage leurs résultats, les chercheurs ont comparé les résultats de l’AMC chez les patients atteints du SMSN/SUDC avec ceux des groupes témoins d’enfants de la communauté et de deux cohortes d’enfants atteints d’un trouble du spectre autistique. Lorsqu’il a été noté pour la probabilité de changements chromosomiques potentiellement impactants sur la CMA, le groupe SIDS/SUDC a obtenu des scores significativement plus élevés que les témoins, mais avait des scores similaires à ceux des enfants atteints de troubles du spectre autistique (TSA).
Bon nombre des conclusions de la CMA n’avaient aucun lien évident avec les PEID/SUDC et appellent une enquête plus approfondie. Par exemple, deux enfants avaient un syndrome de Klinefelter non diagnostiqué, dans lequel les garçons naissent avec un chromosome X supplémentaire mais ont généralement une durée de vie normale. Plusieurs délétions/duplications chromosomiques identifiées ont également été associées à des troubles du développement neurologique, notamment des convulsions, des TSA, un retard de développement et la schizophrénie.
Ajout à l’arsenal de test
Dans des travaux antérieurs, les chercheurs de Boston Children’s ont utilisé le séquençage de l’exome entier (séquençage de 1 à 2 % du génome qui code les protéines) pour évaluer les enfants dont les décès ont été classés comme SMSN ou SUDC. Dans cette étude, 11 % des enfants présentaient des variantes génétiques (altérations) qui ont probablement joué un rôle dans leur décès. Il reste à voir dans quelle mesure la CMA ajouterait à ces résultats et dans quelle mesure il y a un chevauchement entre les gènes qui se sont avérés altérés lors du séquençage de l’exome et les gènes affectés par les délétions/duplications d’ADN.
L’équipe espère que leurs découvertes encourageront les médecins légistes enquêtant sur les décès dus au SMSN à les contacter pour obtenir de l’aide.
« Les médecins légistes s’intéressent aux investigations génétiques, mais ils manquent de ressources, surtout lorsqu’il s’agit d’interpréter les résultats », explique Goldstein. « Nous essayons de faire avancer cette balle et de fournir des informations utiles. »
En plus du séquençage de l’exome et des anomalies chromosomiques sur CMA, les chercheurs ont récemment obtenu une subvention de l’American SIDS Institute pour étudier des changements structurels plus complexes dans les chromosomes qui pourraient contribuer au SMSN et au SUDC, en utilisant une plate-forme de génomique avancée appelée Bionano Saphyr pour obtenir des images extrêmement longues brins d’ADN.
« Cette technique nous donne la possibilité de trouver des variations structurelles trop importantes pour être détectées par le séquençage traditionnel de l’ADN, mais trop petites pour être détectées par un microréseau chromosomique », déclare Brownstein, premier auteur de l’étude et directeur scientifique du Manton Center for Orphan Disease Research. Gene Discovery Core au Boston Children’s. « Nous pouvons également détecter des cas où un segment d’ADN » bascule « à un endroit différent sur le chromosome. »
À long terme, alors que les coûts de séquençage de l’ADN diminuent, les chercheurs souhaitent utiliser le séquençage du génome entier pour étudier le SMSN et le SUDC, un test unique qui pourrait réduire le besoin de CMA.
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