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L'écouvillonnage du sol offre de nouvelles perspectives pour la surveillance du COVID-19

par Ma Clinique
23 octobre 2024
dans Actualités médicales
Temps de lecture : 3 min
SARS-CoV-2 BA.2.86 montre un ciblage accru des poumons malgré l’efficacité du vaccin

Le COVID-19 est là pour rester. Alors que les restrictions et les tests sur les humains ont diminué, de nouvelles recherches s’attaquent au défi de savoir comment surveiller, prédire et prévenir les cas et les épidémies de COVID-19, en particulier parmi les groupes vulnérables comme les patients hospitalisés.

Une approche est la surveillance environnementale. L’incarnation la plus connue est la surveillance des eaux usées, qui a pris de l’importance après l’avènement de la pandémie de COVID-19. Mais l’équipe de recherche sur le coronavirus dans l’environnement bâti urbain, également connue sous le nom de CUBE, explore une alternative : nettoyer les sols.

Dans une étude récente menée dans deux hôpitaux de l'Ontario, les chercheurs du CUBE ont nettoyé les sols des zones réservées aux travailleurs de la santé, comme les vestiaires, les salles de réunion et les toilettes du personnel, et ont observé une forte association entre la quantité de matière virale du SRAS-CoV-2 trouvée sur le sol. étage et le nombre de cas et d’épidémies de COVID-19 à l’hôpital.

« L'association entre les prélèvements au sol et les cas humains et les éclosions était quelque chose que nous avions déjà observé dans les foyers de soins de longue durée, et nous voulions tester cette hypothèse en milieu hospitalier », explique la Dre Caroline Nott, médecin spécialiste des maladies infectieuses à L'Hôpital d'Ottawa. , professeur adjoint au Département de médecine de l'Université d'Ottawa et l'un des chercheurs principaux du CUBE.

Pour chaque multiplication par 10 de la quantité de virus détectée sur le sol, les chercheurs ont observé une multiplication correspondante par 15 du nombre de cas de patients et un risque 22 fois plus élevé d’épidémie de COVID-19. Ces résultats s’ajoutent aux preuves croissantes selon lesquelles l’écouvillonnage des sols peut fournir un niveau supplémentaire de surveillance pour aider à éclairer les mesures de prévention et de contrôle des infections dans les hôpitaux et autres contextes.

« Pour être clair, le COVID-19 ne se propage pas par le sol », rassure Nott. « Il est extrêmement rare d'attraper le COVID-19 sur n'importe quelle surface. Ce que nous constatons dans nos prélèvements au sol est plutôt le reflet du fardeau de l'infection chez les humains occupant l'environnement où nous effectuons le prélèvement. Donc, si nous commençons à constater une augmentation Dans la quantité de virus que nous trouvons sur le sol, cela pourrait être le signe que de nouveaux cas et potentiellement des épidémies sont en route. Ce type d'alerte précoce peut aider l'hôpital à se préparer et à prendre des mesures préventives.

Mais pourquoi la quantité de virus sur le sol dans les zones réservées aux travailleurs de la santé refléterait-elle le fardeau du COVID-19 parmi la population de patients de l’hôpital ?

« Excellente question », déclare le Dr Michael Fralick, clinicien-chercheur à Sinai Health, professeur agrégé à l'Université de Toronto et chercheur principal du CUBE. « Le COVID-19 est une maladie respiratoire. Il se propage via des gouttelettes et des aérosols, qui peuvent parcourir une distance relativement longue avant de tomber au sol. »

Fralick poursuit : « Nous nous sommes concentrés sur les zones réservées aux travailleurs de la santé principalement pour des raisons pragmatiques : ces zones sont plus faciles d'accès et ne perturbent pas les soins directs aux patients, ce qui est des considérations importantes si une approche comme celle-ci devait être mise en œuvre.

L’étude a été menée sur 39 semaines entre juillet 2022 et mars 2023, avec un total de 760 écouvillons au sol collectés. Les écouvillons ont été traités pour le SRAS-CoV-2 à l’aide d’une réaction en chaîne par polymérase quantitative à transcriptase inverse. Une validation croisée groupée quintuple a été utilisée pour évaluer la discrimination des épidémies modèles. L'article a été publié le mois dernier dans la revue Cambridge University Press. Contrôle des infections et épidémiologie hospitalière.

Alors que la COVID-19 a disparu de la conscience publique, il est primordial de renforcer la capacité de nos systèmes de santé à prévenir les maladies et les décès en cas de résurgence saisonnière et de futurs variants, déclare Nott. « Nous n'étions pas préparés à faire face au COVID-19 et, par conséquent, de nombreuses personnes sont décédées ou ont subi des séquelles à long terme, en particulier les personnes vulnérables comme celles traitées dans les hôpitaux ou vivant dans des établissements de soins de longue durée. Nous sommes déterminés à développer des méthodes pour éviter des souffrances similaires à l’avenir, qu’il s’agisse d’une nouvelle variante du COVID-19 ou d’un agent pathogène complètement différent. »

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