Des mutations au sein du coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS-CoV-2) ont entraîné différentes souches. Certains ont été classés par l’Organisation mondiale de la santé (OMS) comme des variantes préoccupantes. Ceux-ci incluent Alpha, Beta, Gamma et Delta, et des variantes d’intérêt qui incluent Lambda et Mu nouvellement classé. Il existe également deux variantes non classées, la variante C.1.2 et la variante Delta+N501S. En raison des variantes Mu et C.1.2 possédant des mutations situées dans le domaine de liaison au récepteur de la protéine de pointe, ces variantes peuvent contribuer à une transmissibilité accrue, à la résistance aux anticorps neutralisants et aux anticorps monoclonaux thérapeutiques.
Étude : Neutralisation des variants Mu et C.1.2 du SRAS-CoV-2 par des anticorps déclenchés par le vaccin chez des individus avec et sans antécédents d’infection. Crédit d’image: Fit Ztudio/Shutterstock
Une équipe de chercheurs de la Grossman School of Medicine, aux États-Unis, a mesuré l’infectiosité des variants du SRAS-CoV-2 C.1.2, Mu et Delta+501S et a déterminé la sensibilité aux anticorps neutralisants acquis lors d’une infection précédente ou par vaccination. De plus, les auteurs ont testé si ces variants étaient susceptibles d’être neutralisés par les anticorps monoclonaux.
Une version pré-imprimée de cette étude, qui doit encore faire l’objet d’un examen par les pairs, est disponible sur le site bioRxiv* serveur
L’étude
Les auteurs ont déterminé la sensibilité des virus avec des protéines de pointe variantes aux anticorps neutralisants en évaluant les titres neutralisants des anticorps sériques produits à partir des vaccins ARNm-1273 et BNT162b2 et du vaccin à base de vecteur adénoviral Ad26.COV2.S. Les anticorps acquis lors d’une infection antérieure ont neutralisé le pic D614G avec un titre moyen de 334. Dans le même temps, la neutralisation de Mu, Beta, Delta et Delta + 501S a diminué de 7 à 9 fois, et la variante C.1.2 semblait être plus résistant avec une diminution de 9 fois.
Par rapport aux anticorps d’une infection précédente, les anticorps du vaccin BNT162b2 ont neutralisé le virus avec le pic D614G avec un titre moyen de 862, soit une augmentation de 2,6 fois. Les titres neutralisants de BNT162b2 contre Beta, Delta et Delta+N501S ont diminué de 4,8, 3,4 et 3,4 fois. Plus de résistance a été affichée avec les variantes Mu et C.1.2, diminuant respectivement de 6,8 et 7,9 fois.
Le variant C.1.2 était également le plus résistant aux sérums vaccinés avec l’ARNm-1273 avec un titre diminué de 11,2 fois. Les sérums d’individus vaccinés avec Ad26.COV2.S ont produit des titres d’anticorps neutralisants qui ont neutralisé D614G avec un titre moyen de 245. Les titres de variante C.1.2 sont tombés dans une plage inférieure à 50, le minimum détectable par le test utilisé par les auteurs. Le titre neutralisant le plus élevé contre toutes les variantes provenait des sérums d’individus ayant déjà été infectés avant de recevoir le vaccin BNT162b2.
Les auteurs ont établi un test d’avidité ACE2 pour mesurer l’avidité de liaison ACE2 des pointes variantes. L’analyse des résultats du test a montré une augmentation de l’avidité de liaison à l’ACE2 pour les pointes bêta, delta, delta + 501S et Mu, indiquée par une diminution de la concentration requise pour atteindre 50 % de saturation des protéines de pointe. En revanche, l’affinité à laquelle C.1.2 lié ACE2 a diminué, cette variante a nécessité une augmentation de 1,4 fois la concentration d’ACE2 pour 50 % de liaison par rapport à D614G et une diminution de 2,4 fois par rapport à la variante bêta.
À l’aide d’un test de liaison aux virions, les auteurs ont confirmé ces résultats en incubant des virions pseudotypés avec des cellules sACE2 et ACE2.293T. Les résultats de ce test ont montré que les virions avec des pointes Beta, Delta, Delta+N501S, D614G et Mu se liaient de manière similaire à l’ACE2, tandis que la liaison C.1.2 était diminuée. À partir de ces résultats, il pourrait être suggéré que la protéine de pointe variante C.1.2 se lie à l’ACE2 avec une affinité inférieure par rapport aux autres protéines de pointe variantes
Les anticorps monoclonaux Regeneron utilisés dans cette étude ont maintenu leur capacité à neutraliser C.1.2, Delta, Delta+N501S et Mu. L’anticorps monoclonal REGN10933 a perdu un titre de 50 fois contre la protéine de pointe du variant bêta, mais contre les autres variants, il a maintenu ses activités neutralisantes. L’anticorps monoclonal REGN10987 a conservé ses capacités de neutralisation contre tous les variants, de même que la combinaison des deux anticorps monoclonaux.
Implications
Les variantes Mu et Delta sont presque identiques, on pourrait donc suggérer que cette variante présente un danger supplémentaire pour la société. La propagation du variant C.1.2 doit être étroitement surveillée en raison du grand nombre de mutations et de la résistance relative à la neutralisation. Cependant, en raison de l’emplacement où cette variante a été détectée, elle a un potentiel de distribution géographique restreint.
Les titres d’anticorps élevés affichés chez les patients expérimentés contre toutes les variantes sont prometteurs car ils montrent que les individus ont la capacité de produire une réponse largement neutralisante qui peut être vitale pour de futures variantes potentielles. On pourrait suggérer que ces résultats montrent que les vaccinations de rappel peuvent entraîner une réponse d’anticorps tout aussi large.
*Avis important
bioRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, orienter la pratique clinique/le comportement lié à la santé, ou traités comme des informations établies
