*Avis important: medRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, guider la pratique clinique/les comportements liés à la santé, ou traités comme des informations établies.
Une étude récente publiée sur medRxiv* Le serveur de préimpression a révélé que le microbiome intestinal prédit les résultats atopiques chez les nourrissons avec une exposition bactérienne réduite.
Étude : Le microbiome intestinal prédit les maladies atopiques dans une cohorte de nourrissons avec une exposition bactérienne réduite en raison de la distanciation sociale. Crédit d’image : Design_Cells / Shutterstock
Arrière-plan
Les cavités corporelles et les surfaces muqueuses chez l’homme abritent diverses communautés microbiennes, qui régulent le métabolisme de l’hôte, l’immunité et la fonction de barrière épithéliale. Les changements dans la transmission microbienne par l’industrialisation et les facteurs de mode de vie associés à l’alimentation occidentale peuvent entraîner une augmentation des maladies non transmissibles dans les sociétés riches.
L’étude et ses résultats
Dans la présente étude, les chercheurs ont évalué les interactions de l’exposition microbienne et de la composition du microbiome fécal avec les résultats atopiques dans la cohorte de nourrissons nés/élevés pendant la distanciation sociale liée à la maladie à coronavirus 2019 (COVID-19) (CORAL). Dans cette cohorte, la plupart des nourrissons étaient de sexe masculin (55 %), de race blanche (96 %) et nés par voie vaginale (65 %).
L’équipe a effectué le séquençage de l’ARN ribosomique 16S (ARNr) sur des échantillons fécaux de nourrissons. Ils ont observé une forte association de la composition du microbiote avec le mode de naissance et l’âge. L’âge était associé à 33 % des familles bactériennes détectées.
Au niveau de l’ordre, les Veillonellales, les Enterobacteriales, les Lactobacillales et les Bifidobacteriales ont diminué de six mois à un an, tandis que les Bacteroidales, les Erysipelotrichales, les Coriobacteriales, les Verrucomicrobiales et les Clostridiales ont augmenté.
L’accouchement par césarienne (CS) ou l’exposition intrapartum aux antibiotiques pendant l’accouchement vaginal étaient associés à une abondance relative plus élevée de Flavonifractor, d’Erysipelatoclostridium et de Sarcina et à une abondance relative plus faible de Collinsella à six mois. L’administration de CS était également associée à une abondance plus élevée de Blautia, Amedibacterium, Roseburia et Enterobacter et à une abondance réduite de Parabacteroides et Bacteroides.
La plupart des différences liées au mode de naissance n’étaient pas significatives à l’âge de 12 mois. Ensuite, l’équipe a comparé la composition microbienne entre CORAL et les cohortes historiques. L’abondance en fonction du temps de Bacteroidia, Proteobacteria et Bacilli était similaire entre CORAL et les cohortes historiques, bien que les Clostridia aient été significativement plus faibles chez les nourrissons CORAL à six mois et un an.
Par rapport à une cohorte de nourrissons irlandais pré-pandémique, les niveaux de Clostridia étaient plus faibles à six et 12 mois, mais les bifidobactéries étaient plus abondantes à un an chez les nourrissons CORAL. Les nourrissons CORAL avaient également une richesse microbienne plus élevée à six mois. Le régime alimentaire a été identifié comme le principal déterminant de la composition du microbiote intestinal à six mois et un an.
Les effets de l’accouchement par césarienne, des antibiotiques intrapartum et des interventions médicales étaient plus élevés à six mois, tandis que l’impact des facteurs environnementaux et de l’exposition aux contacts humains augmentait à un an. De plus, la fréquence de consommation de haricots, de céréales, de graines de sésame et d’huile végétale était significativement associée à la composition du microbiote à six mois.
De plus, l’ingestion de noix, de soja, de lait de vache et de noix de pécan a contribué de manière significative à 12 mois. L’effet des haricots, des noix et de l’huile était similaire à celui de l’accouchement vaginal et de l’allaitement, avec des abondances relatives plus élevées de Bifidobacterium, Collinsella, Bacteroides et Lactobacillus à chaque moment. Cependant, la consommation de lait maternisé de vache a eu l’effet inverse à 12 mois, la composition du microbiote s’éloignant de celle dominée par les Bacteroides/Bifidobacterium.
L’impact des facteurs liés à l’exposition humaine a augmenté d’un an, déplaçant la composition microbienne de type infantile vers une composition plus mature avec des abondances plus élevées de Lachnospiraceae et de Ruminococcaceae.
Étant donné que les facteurs environnementaux (alimentation, allaitement, etc.) ont été décrits comme des facteurs épidémiologiques influençant la sensibilisation aux allergènes alimentaires et la dermatite atopique, les auteurs ont ensuite étudié dans quelle mesure le microbiote médiait les effets des facteurs épidémiologiques.
À cette fin, ils ont comparé l’impact de l’exposition sur les résultats de la maladie à l’aide de modèles de régression logistique. La composition du microbiote intestinal aux deux moments prédisait de manière significative la dermatite atopique à 12 mois. La dermatite atopique a montré une association positive avec le tabagisme et la fréquentation d’une garderie. Il y avait une association négative avec la vie dans les zones rurales et l’utilisation d’antibiotiques de six à 12 mois de vie.
Le microbiote a médié les effets des antibiotiques et de la garderie, alors que le tabagisme était principalement un effet direct. La dermatite atopique était également positivement associée à la consommation infantile de poisson, de pistaches, de féculents et d’arachides et négativement à la consommation de kimchi, de céréales et de pignons de pin. Plusieurs aliments ont eu des effets directs et médiés par le microbiote.
La composition du microbiote intestinal à six mois prédisait fortement la sensibilisation aux allergènes alimentaires à 12 mois. La naissance de CS ou le fait d’avoir des frères et sœurs était associé à une abondance réduite de microbes associés à la sensibilisation alimentaire. L’œuf a montré une association négative directe avec la sensibilisation alimentaire, tandis que le tempeh avait une association positive directe.
conclusion
En résumé, les chercheurs ont démontré que les mesures d’isolement social liées au COVID-19 altéraient l’assemblage du microbiote intestinal des nourrissons au début de la vie, ce qui était lié au risque de maladies atopiques.
De plus, ils ont établi que le microbiome médie en partie les associations épidémiologiques entre le risque d’atopie et les antibiotiques, l’alimentation et l’allaitement. Que ces différences soient de courte ou de longue durée nécessite une enquête plus approfondie.
*Avis important: medRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, guider la pratique clinique/les comportements liés à la santé, ou traités comme des informations établies.
