Obtenez des informations sur l’approche innovante de Bruker en matière de spectrométrie de masse des sciences de la vie de la part de Rohan Thakur, président de la spectrométrie de masse des sciences de la vie, dans le premier épisode de la série de podcasts omg OMx. Découvrez comment Bruker exploite son élan et saisit de nouvelles opportunités dans le domaine, et explorez les solutions révolutionnaires qui révolutionnent l’avenir de la spectrométrie de masse. Revisitez les principaux moments forts de l’épisode et visionnez l’épisode complet à la demande.
Sommaire
En tant qu’acteur dominant dans le domaine de la spectrométrie de masse par résonance magnétique (MRMS), comment l’introduction de la technologie de spectrométrie de mobilité des ions piégés (TIMS) a-t-elle changé la position de Bruker sur le marché de la spectrométrie de masse ?
Tout a commencé avec ce que nous pensions être une technologie perturbatrice qui, selon nous, pourrait bouleverser le marché de la protéomique et concurrencer les technologies en place.
Notre équipe a vu le potentiel de la technologie de spectrométrie de mobilité des ions piégés (TIMS). Nous savions que cela pourrait bouleverser le marché de la protéomique et concurrencer les technologies en place déjà existantes. Je veux dire, la plupart des cycles LC dans le domaine de la protéomique prennent une éternité – nous parlons d’environ 2 heures en moyenne. Mais avec le timsTOF et sa fonction d’accumulation parallèle-fragmentation série (PASEF®), nous pouvons obtenir la même quantité d’informations en seulement 20 minutes ! C’est un changeur de jeu absolu.
Une fois que nous avons su que nous avions cette vitesse où nous pouvions parcourir de nombreux échantillons par jour, nous avons obtenu le logiciel pour aider à convertir ces fichiers de données en connaissances exploitables. C’est alors que PaSER a été introduit. Maintenant, pour la première fois, nous avons eu une innovation matérielle et nous avons pu donner des informations à nos utilisateurs juste après la fermeture du dossier.
Ces deux éléments réunis, l’augmentation rapide du nombre d’échantillons analysés par jour et les données qui pouvaient être analysées dès la fin de la campagne, constituaient une véritable innovation de rupture dans un domaine qui stagnait depuis une quinzaine d’années.
Rohan Thakur | Omg OMx Podcast | Ép. 1
Comment Bruker a-t-il contribué aux percées récentes en protéomique plasmatique ?
Nous sommes attirés par [plasma proteomics] parce que les produits de fuite des tumeurs peuvent se retrouver dans le plasma. C’est pourquoi nous avons acquis PreOmics, une société de préparation d’échantillons, et nous avons maintenant un produit qui nous permet de parcourir rapidement les échantillons. Dans certaines applications de la protéomique plasmatique, nous pouvons observer 200 à 300 protéines en seulement 5 minutes. C’est assez impressionnant, surtout si l’on considère que dans un environnement de recherche ou clinique, vous voulez que les données soient traitées et analysées rapidement. Vous ne pouvez pas attendre des semaines pour que les données soient retournées.
La vitesse de PASEF, la technologie TIMS, combinée à notre package PaSER, nous permet de parcourir de nombreux échantillons par jour et d’en tirer des informations qui peuvent être utilisées pour prendre une décision ou fournir des conseils en tant que test secondaire. Nous avons également des utilisateurs vraiment impressionnants – le Dr Roman Fisher à Oxford, Matthias Mann à Copenhague et Alain Van Gool au Radboud ne sont que quelques-unes des personnes qui utilisent nos systèmes. C’est excitant de voir l’impact de nos systèmes sur le terrain, et nous sommes fiers d’en faire partie.
Quelle est l’importance de collaborer lorsque vous êtes à la pointe des avancées scientifiques dans le domaine, et qu’est-ce que cela fait de faire partie de telles percées ?
Notre objectif est d’écouter et de travailler en étroite collaboration avec les experts du domaine. C’est un travail d’équipe. Ces adopteurs précoces nous guident sur où prendre la technologie. Nous avons la technologie qui pourrait aider, maintenant la question devient : quelle est la pertinence biologique de la technologie ?
Nous considérons ces adopteurs précoces et leaders d’opinion clés (KOL) comme les véritables pionniers à la pointe de l’industrie. Et nous sommes là pour les soutenir dans leur travail pour résoudre des problèmes complexes en oncologie et en biologie. Leurs commentaires nous aident à concevoir des instruments et des fonctionnalités qui répondent à leurs besoins spécifiques. En fin de compte, notre objectif est d’améliorer le travail qu’ils font et d’avoir un impact significatif sur le terrain.
Crédit image : Bruker Life Sciences Spectrométrie de masse
Avez-vous personnellement vécu des moments impressionnants en découvrant les applications potentielles de cette technologie ?
L’un des moments les plus cool pour moi a été lorsqu’un bon ami à moi, Roman Fisher, m’a envoyé une photo de 96 plaques à puits empilées jusqu’au sommet du timsTOF et m’a dit : « Regardez Rohan, c’est l’impact de votre produit a fait dans notre vie quotidienne. »
C’était un de ces moments où j’ai pensé, « Wow, nous l’avons fait! » Pour la première fois, il pouvait découper 5 000 à 6 000 échantillons sans avoir à nettoyer son spectromètre de masse. C’était une grande réussite pour nous.
Voir cette image et savoir que nous avions conçu un spectromètre de masse robuste capable de gérer ce type de charge de travail était vraiment excitant. C’était définitivement un moment « omg » pour moi.
Crédit image : Bruker Life Sciences Spectrométrie de masse
Que pensez-vous de la croissance rapide et du succès de la protéomique spatiale et de l’omique en général chez Bruker ?
Cela vient encore de l’écoute de l’un de nos KOL, Matthias Mann, qui nous a aidés à faire une percée. Matthias et son équipe utilisent des techniques visuelles profondes pour évaluer les tumeurs et identifier les protéines qu’elles contiennent. Ils utilisent une technique appelée microdissection par capture laser pour examiner de plus près les cellules individuelles dans le microenvironnement tumoral.
Nous avons eu un débat en interne sur l’opportunité de ne pas utiliser d’étiquettes ou d’utiliser des étiquettes dans nos techniques d’imagerie MALDI, et notre collaboration avec AmberGen nous a aidés à décider. Nous avons maintenant une technique puissante, et la seule question qui reste est de savoir si nous pouvons atteindre la sensibilité requise pour suivre les protéines avec des approches LCMS très sensibles aux approches MALDI.
Je suis ravi que nous soyons en mesure d’offrir à nos clients le meilleur des deux mondes. Nous pouvons examiner les protéines d’une seule cellule et relier les deux techniques au profit de nos utilisateurs. Nos clients nous ont demandé de le faire, et je pense que nous vivons à une époque merveilleuse où nous pouvons y arriver. J’ai hâte de voir les résultats qui découleront de cette collaboration !
Y a-t-il des scientifiques ou des chercheurs dans le domaine que vous admirez mais que vous n’avez pas encore eu l’occasion de rencontrer ? Qui est votre « béguin pour la science », si vous voulez, quelqu’un que vous admirez et que vous pensez pouvoir avoir un grand impact sur l’avenir de la science ?
Eh bien, je suis un ancien dans ce domaine, j’ai donc eu le plaisir de rencontrer et d’apprendre de certains des plus grands noms comme John Yates, Matthias Mann et Albert Heck. C’est une carrière bien remplie jusqu’à maintenant. Mais tu sais ce qui m’excite vraiment ces temps-ci ? C’est l’idée de combler le fossé entre la spectrométrie de masse et la pratique clinique. Je veux entendre les oncologues et vraiment comprendre comment nous pouvons faire de la spectrométrie de masse un outil de routine en clinique, tout comme la génomique. Si nous pouvions y arriver, cela changerait la donne.
Crédit image : Bruker Life Sciences Spectrométrie de masse
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À propos de l’orateur
Rohan Thakur, Ph.D., président Spectrométrie de masse des sciences de la vie chez Bruker
Rohan Thakur, Ph.D., président de la spectrométrie de masse des sciences de la vie chez Bruker, a rejoint Bruker en 2010 en tant que directeur général de l’équipe CAM MS à Fremont, en Californie, et a été promu par conséquent vice-président Quadripôle Business et vice-président principal au cours de ses cinq premiers ans avant de prendre ses nouvelles fonctions. Il a plus de 20 ans d’expérience en spectrométrie de masse, dont 14 ans dans les applications et le développement MS, et est également propriétaire de plusieurs brevets dans le domaine de la spectrométrie de masse. Au cours de sa carrière, il a occupé des postes de directeur du marketing mondial pour les solutions de spectrométrie de masse chez Thermo Scientific. Il a été directeur de la découverte de médicaments dans une CRO pharmaceutique pendant 2 ans avant de rejoindre Bruker. Il a obtenu son doctorat. en chimie de l’Université d’État du Kansas. Il a fait des études postdoctorales à l’Université Rutgers, où son travail impliquait l’utilisation d’une analyse MS à haute résolution pour prouver la formation de métabolites benzéniques à cycle ouvert-ADN et d’adduits protéiques.
omg Hôte OMx : Kate Stumpo, Senior Market Manager chez Bruker
Ces informations ont été extraites, révisées et adaptées à partir de documents fournis par Bruker Daltonics.
Pour plus d’informations sur cette source, veuillez consulter Bruker Life Sciences Mass Spectrometry.
