Dans une récente étude publiée sur medRxiv* serveur de prétirage, les chercheurs ont caractérisé et prédit les séquelles post-aiguës de l’infection par le coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS-CoV-2) (PASC).
Sommaire
Arrière plan
Le nombre croissant de personnes guéries de la maladie à coronavirus 2019 (COVID-19) souffrant de séquelles post-aiguës d’une infection par le SRAS-CoV-2 (PACS) est devenue une préoccupation mondiale. Cependant, le développement de traitements efficaces a été entravé par la nouveauté de cette maladie et le peu d’informations disponibles sur les mécanismes pathogéniques sous-jacents.
À propos de l’étude
Dans la présente étude, les chercheurs ont décrit les diagnostics associés au PASC et développé des modèles d’évaluation des risques.
L’étude a impliqué des personnes éligibles qui étaient des patients de Michigan Medicine (MM) et qui ont reçu un diagnostic de COVID-19 ou ont été testées positives pour la réaction en chaîne par polymérase de la transcriptase inverse en temps réel (RT-PCR) pour l’infection par le SRAS-CoV-2 entre le 10 mars 2020 et 31 août 2022. Les données des tests RT-PCR ont été recueillies pour le dépistage des employés, le dépistage standard à l’admission à l’hôpital et le dépistage de routine avant les traitements. Des sujets symptomatiques et asymptomatiques ont participé à l’étude. La date d’index pour chaque participant était soit son diagnostic initial de COVID-19, soit son test RT-PCR positif, selon la première éventualité.
Les patients COVID-19-positifs restants ont ensuite été divisés en groupes : (1) patients « sans PASC » qui n’avaient pas de diagnostic PASC enregistré et (2) patients ayant un diagnostic enregistré de PASC. Les diagnostics de PASC ont été déterminés en utilisant soit l’observation des codes ICD10-CM B94.8, qui indiquaient des séquelles liées à d’autres troubles infectieux et parasitaires spécifiés, soit U09.9, qui indiquait un PASC non spécifié ou des entrées pour PASC dans la composante diagnostic du Résumé du problème. Liste (PSL) de la base de données des dossiers de santé électroniques (DSE).
Par la suite, l’équipe a mené des études d’association à l’échelle du phénome (PheWAS) pour identifier les phénotypes enrichis associés à l’ère post-COVID-19 et les phénotypes putatifs prédisposant au PASC liés aux périodes pré- et aiguë-COVID-19.
De plus, l’équipe a divisé les patients PASC en groupes selon les diagnostics ICD10 qui correspondaient à 29 concepts phénotypiques qui avaient été précédemment signalés comme des symptômes PASC typiques et qui ont été enregistrés simultanément avec leurs diagnostics PASC initiaux. De plus, les caractéristiques des patients ont été évaluées et ajustées en fonction du statut socio-économique et d’autres facteurs, notamment l’âge, le sexe, la race/l’origine ethnique, la densité de population par mile carré et l’indice de désavantage du quartier (NDI) sans la proportion de la communauté noire.
Résultats
Un diagnostic PASC a été signalé par 1 724 des 63 675 patients positifs au COVID-19 au moins deux mois après leur diagnostic initial de COVID-19 ou un résultat positif à la RT-PCR. Dans les trois mois suivant le diagnostic de COVID-19, l’incidence des PASC cliniquement confirmés variait entre 0,18 % et 1,8 %. Le deuxième pic de personnes positives au COVID-19 chez MM a coïncidé avec le plus grand nombre trimestriel d’infections PASC enregistrées au quatrième trimestre 2021.
L’équipe a également constaté que par rapport aux témoins, les cas PASC avaient des périodes légèrement plus longues couvertes dans les DSE pré-test que les témoins et avaient plus de chances d’être plus âgés, de sexe féminin et de recevoir des soins primaires au MM au cours des deux années précédentes.
Près de 34,3 % des personnes ont signalé un essoufflement, 30,6 % de l’anxiété, 28,5 % de la fatigue et des malaises, 27,2 % de la dépression, 25,4 % des troubles du sommeil, 23,6 % de l’asthme, 21,4 % des maux de tête, 13,8 % de la migraine, 13,0 % avaient de la toux et 12,6 % avaient des douleurs articulaires. Tous les 29 symptômes PASC qui ont été examinés ont été enrichis, 27 d’entre eux atteignant une signification à l’échelle du phénome et deux non. PheWAS a également suggéré l’enrichissement de plusieurs maladies, dont les problèmes musculo-squelettiques, les maladies infectieuses, ainsi que les troubles digestifs.
PheWAS a comparé 1 212 cas à 11 919 témoins appariés, en utilisant uniquement les diagnostics signalés au moins deux semaines avant d’être positifs au COVID-19. Cela a permis l’identification de symptômes putatifs pré-COVID-19 qui prédisposent les diagnostics de COVID-19 au PASC. Sur les 1 405 PheCodes examinés, une pertinence à l’échelle du phénome a été démontrée pour le syndrome du côlon irritable (IBS), les nausées et les vomissements, les commotions cérébrales, les anomalies respiratoires, les allergies alimentaires et les maladies circulatoires générales.
Les fréquences et les signaux correspondants dans les trois PheWAS ont été utilisés pour déterminer si les phénotypes associés au PASC associés aux périodes pré- et aiguë-COVID-19 ont entraîné de nouveaux symptômes PASC ou s’ils deviennent eux-mêmes des symptômes PASC à long terme.
Conclusion
Dans l’ensemble, l’étude a démontré un dépistage agnostique des données horodatées du DSE qui a révélé un large éventail de diagnostics liés au PASC dans plusieurs catégories. L’étude a également noté un arrangement complexe de facteurs prédisposants possibles qui peuvent être utilisés pour développer des stratégies de stratification des risques. Cependant, des recherches approfondies seront nécessaires pour caractériser adéquatement le PASC et ses variantes, notamment en ce qui concerne les effets à long terme, et pour prendre en compte des modèles de risque plus approfondis.
*Avis important
medRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, guider la pratique clinique/les comportements liés à la santé, ou traités comme des informations établies.
