La maladie à coronavirus 2019 (COVID-19), causée par le coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS-CoV-2), continue de se propager dans le monde, et de nouvelles variantes préoccupantes continuent d’émerger.
Les scientifiques visent à surveiller de près la propagation du virus et à détecter de nouvelles variantes émergentes qui pourraient nuire aux vaccins et aux thérapies ou augmenter la transmissibilité virale. Trois variantes préoccupantes se sont activement répandues au cours des derniers mois: la variante britannique, la variante sud-africaine et la variante brésilienne.
Des chercheurs de l’Institut Bio21 et du Département de biochimie et de pharmacologie de l’Université de Melbourne ont étudié la structure d’un domaine de liaison au récepteur de pointe du SRAS-CoV-2 (RBD) avec une mutation G485R. Cette mutation est un résidu et n’est pas directement impliquée dans les interactions avec les résidus de l’enzyme de conversion de l’angiotensine 2 (ACE2) mais se trouve dans la région de la boucle «1» / «2».
La mutation G485R
Trouvé sur la protéine de pointe du virus, le domaine de liaison au récepteur (RBD) est responsable de la liaison avec le récepteur de l’enzyme de conversion de l’angiotensine 2 (ACE2) de la cellule humaine. Lorsque ces deux éléments se lient, le virus est capable de s’infiltrer dans la machinerie métabolique de la cellule hôte et commence la réplication virale.
La protéine de pointe (ou S) est une cible antigénique vitale, car c’est la partie la plus accessible de l’architecture du virus.
Les mutations des protéines structurales du coronavirus jouent un rôle central dans la détermination de la virulence et de la capacité du virus à échapper à la réponse du système immunitaire de l’hôte.
Le résidu G485 n’est pas directement impliqué dans les interactions avec les résidus ACE2, mais il se trouve dans la région de la boucle «1» / «2» du motif RBD. Son résidu voisin, E484, a suscité l’intérêt de la communauté scientifique. On a observé que la mutation E484K contribuait à la fuite antigénique.
Les virus peuvent évoluer en mutant continuellement. Il est crucial pour la communauté scientifique d’étudier la corrélation entre la mutation et les fonctions des protéines virales pour développer des vaccins et des thérapies efficaces qui peuvent suivre le rythme.
L’étude
Dans l’étude, publiée sur le serveur de pré-impression bioRxiv *, les chercheurs ont étudié la mutation G485R sur la fonction de pointe. Des études antérieures ont montré que la mutation G485R réduit la neutralisation virale dans certains plasma convalescent jusqu’à cinq fois.
Maintenant, l’équipe visait à déterminer la structure du pic G485R RBD sur ACE2 complexe. Ils ont observé la mutation dans de nombreux isolats du virus, le résidu adjacent E484 à la lysine étant connu pour influencer la fuite antigénique.
Pour arriver aux résultats de l’étude, l’équipe a cristallisé le domaine de liaison au récepteur de pointe du SRAS-CoV-2 avec une mutation G485R dans l’ACE2 humaine.
L’équipe a découvert que bien que le résidu G485 n’interagisse pas directement avec l’ACE2 humaine, sa mutation affecte la structure en boucle 480-488 du motif de liaison au récepteur.
Cela pourrait conduire à des perturbations dans d’autres résidus avec ACE2, avec des implications possibles pour une fuite antigénique des anticorps monoclonaux contre le pic de SARS-CoV-2.
Les preuves ont également montré que le G485R joue également un rôle essentiel dans l’élimination des anticorps neutralisants du système immunitaire isolés de patients convalescents du SRAS-CoV-2. Cela pourrait aider les scientifiques à développer des vaccins qui pourraient cibler toutes les mutations pour fournir une protection complète et polyvalente contre le COVID-19.
À ce jour, les déploiements de vaccins ont commencé dans la plupart des pays. La distribution de vaccins dans autant de pays que possible dans les plus brefs délais est cruciale pour lutter contre la propagation du virus.
Actuellement, il y a eu plus de 121,37 millions de cas de COVID-19 dans le monde depuis l’apparition de la pandémie. Parmi ceux-ci, 2,68 millions de personnes sont décédées.
*Avis important
bioRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, orienter la pratique clinique / les comportements liés à la santé ou être traités comme des informations établies.
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