Dans une récente étude publiée dans le dernier numéro du Épidémiesles chercheurs ont évalué les risques de transmission du coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS-CoV-2) dans différents contextes de contact pour donner la priorité au contrôle de la maladie par les super-diffuseurs potentiels et leurs contacts.
Sommaire
Contexte
La recherche des contacts est un excellent outil pour évaluer la transmissibilité relative du SRAS-CoV-2 dans différents contextes, y compris les ménages, les soins de santé et les voyages en avion. Lorsqu’il est combiné à une évaluation précise de l’hétérogénéité de l’infectiosité du SRAS-CoV-2 pour différentes durées d’exposition au niveau individuel, il pourrait prédire tôt la possibilité d’événements de super-propagation pour concevoir une stratégie d’intervention appropriée.
Étudier le design
Dans la présente étude, les chercheurs ont appliqué un modèle de transmission bayésien individuel aux données de recherche des contacts de la première vague pandémique de la maladie à coronavirus 2019 (COVID-19) dans la province du Shandong, en Chine. Ils ont estimé les taux d’attaque secondaire (SAR) dans différents contextes de contact et évalué les facteurs de risque potentiels d’infection et de transmission. Le SAR reflète la transmissibilité d’un agent pathogène en mesurant sa susceptibilité à contracter une infection virale, y compris le COVID-19 d’une personne infectieuse par contact étroit.
Ils ont recueilli des données démographiques, cliniques et de laboratoire sur les infections SARS-CoV-2 symptomatiques et asymptomatiques (cas index) des centres municipaux de contrôle et de prévention des maladies (CDC) des villes de Jinan, Jining et Qingdao dans la province du Shandong, en Chine. Ils ont récupéré rétrospectivement la base de données de surveillance de l’étude entre le 22 janviernd et le 30 maie, 2020.
Au cours de la période d’étude, ils ont identifié des cas de COVID-19 confirmés par transcription inverse-amplification en chaîne par polymérase (RT-PCR) et ont retrouvé leurs contacts étroits qui ont été mis en quarantaine pendant 14 jours. De plus, l’équipe a recueilli ses échantillons d’écouvillonnage nasopharyngé les jours 1, 4, 7 et 14 pour les tests RT-PCR.
Selon les définitions de cas de l’étude, les contacts étroits étaient des personnes qui avaient eu un contact non protégé à moins d’un mètre avec un cas suspect ou confirmé de SRAS-CoV-2 dans les deux jours précédant l’apparition des symptômes ou, s’il était asymptomatique, la date de collecte du premier RT- Échantillon positif à la PCR. Un groupe de contacts étroits peut avoir plusieurs cas primaires, appelés cas co-primaires.
Premièrement, les chercheurs ont calculé un SAR brut, la moyenne des cas secondaires parmi les contacts étroits dans tous les groupes de contacts étroits avec un seul cas primaire. En supposant que tous les cas secondaires étaient infectés par leur cas primaire, ils l’ont appelé le SAR basé sur les données. Cependant, tous les cas secondaires de COVID-19 n’ont pas été infectés par un seul cas primaire, car il pourrait également y avoir des transmissions tertiaires, ou l’infection pourrait être acquise à partir d’un groupe extérieur. Heureusement, le modèle bayésien a pris en compte et supprimé cet écart tout en prédisant la dynamique de transmission quotidienne.
Les covariables de l’étude comprenaient l’âge, le sexe, la ville et la profession de chaque contact étroit, ainsi que la gravité de la maladie de chaque cas et l’état des symptômes pendant l’incubation et la maladie. Les principaux résultats de l’étude ont considéré une période d’incubation moyenne de cinq jours et une période infectieuse maximale de 21 jours.
Résultats de l’étude
Parmi les 97 cas index confirmés en laboratoire inclus dans l’analyse de modélisation de la transmission, il y avait huit grappes avec un seul cas primaire et deux cas co-primaires ; en outre, il y avait 3158 contacts étroits dans les 81 clusters restants. La taille moyenne de ces 89 groupes de contacts étroits était de 23. Dans l’ensemble, en moyenne, un cas primaire a généré 1,05 cas secondaires dans la province du Shandong.
Le ratio femmes/hommes parmi les cas primaires et les cas secondaires était de 65 % contre 35 % et de 59 % contre 41 %, respectivement. Comparativement aux cas secondaires, les cas primaires étaient plus susceptibles d’être graves (14 % contre 5 %) et moins susceptibles d’être asymptomatiques (6 % contre 10 %).
Le DAS global basé sur les données était de 3,53 % ; de plus, il était le plus élevé (8,64 %) parmi les contacts étroits de plus de 60 ans. Parmi les paramètres de contact examinés au cours de l’étude, le ménage était associé au DAS basé sur les données le plus élevé de 10,1 %, tandis que le transport aérien était associé au DAS le plus bas, soit 0,43 %.
La probabilité de transmission quotidienne estimée des personnes infectées de transmettre l’infection à des contacts étroits pendant leur période d’incubation était de 0,044 au sein des ménages, de 0,032 dans les établissements de santé, de 0,023 sur les lieux de travail, de 0,004 pendant les voyages en avion et de 0,002 dans tous les autres contextes. Elle était légèrement inférieure pendant la période de maladie, et l’infectiosité relative estimée était la plus élevée lorsque l’incubation et la période infectieuse étaient plus longues.
De plus, l’analyse multivariée a révélé que :
i) les contacts étroits de moins de 60 ans avaient un risque d’infection de 36 à 49 % inférieur à ceux de plus de 60 ans ;
ii) les professionnels de la santé étaient 65 % moins susceptibles d’être infectés que les contacts non médicaux ;
iii) le risque d’infection était beaucoup plus faible pendant les voyages en avion, rapport de cotes (RC) de 0,08 par rapport à l’intérieur des ménages ; et
iv) le risque d’infection sur les lieux de travail et dans les établissements de santé était légèrement inférieur, avec des OR de 0,52 et 0,73, respectivement.
Le modèle d’étude a prédit la possibilité d’événements de super-propagation dans deux ménages et un établissement de santé (trois groupes de contacts étroits), chacun avec un seul cas primaire.
conclusion
Pour résumer, les SAR estimés des ménages dans le Shandong, calculés pour toute la période infectieuse de 22 jours, étaient plus élevés que la plupart des études de transmission des ménages en Chine. Le SRAS-CoV-2 était plus transmissible dans les foyers que dans les lieux de travail et les établissements de santé, et le risque de transmission était bien moindre pendant les voyages en avion ou dans d’autres contextes de contact. En plus du SAR le plus élevé, les paramètres des ménages ont favorisé le plus grand nombre de cas secondaires par cas primaire. De plus, l’âge, la profession médicale et la ville étaient des modificateurs de risque.
La simulation de la dynamique de transmission parmi les contacts étroits des cas primaires, en supposant une incubation moyenne de cinq jours et une période infectieuse maximale de 22 jours, a montré que 64 % des cas n’ont pas généré de transmissions secondaires et que 20 % des cas ont entraîné 80 % de transmissions secondaires.
Pour conclure, l’étude souligne que la vaccination et les interventions non pharmaceutiques doivent être prioritaires pour les grands groupes de contacts étroits dans les foyers. Alors que le risque de transmission était plus faible pendant les voyages en avion, la prise en compte de l’exposition virale chez un si grand nombre de passagers aériens et l’implication de la dissémination à longue distance justifient également des efforts de prévention dans ce contexte.
