Pour mieux identifier et prévenir les futures pandémies, l’Université de Washington est devenue partenaire d’un accord de collaboration mondial de cinq ans avec l’Agence américaine pour le développement international. Le nouveau projet Discovery & Exploration of Emerging Pathogens – Viral Zoonoses, ou DEEP VZN, dispose d’un financement prévu d’environ 125 millions de dollars et sera dirigé par la Washington State University.
L’effort renforcera les capacités scientifiques des pays partenaires pour détecter et caractériser en toute sécurité les virus susceptibles de se propager de la faune sauvage et des animaux domestiques aux populations humaines.
« Le projet DEEP VZN offre une chance passionnante de mieux comprendre pourquoi le monde connaît des épidémies plus fréquentes et plus graves de maladies infectieuses zoonotiques transmises entre les animaux et les humains », a déclaré le Dr Peter Rabinowitz, co-chercheur principal de l’USAID DEEP VZN et professeur des sciences de l’environnement et de la santé au travail à l’UW School of Public Health et professeur de médecine familiale à l’UW School of Medicine.
« Cela signifie acquérir des connaissances sur les nouveaux virus qui pourraient causer des problèmes à l’avenir et les changements de l’écosystème qui semblent être à l’origine du processus de saut de virus entre les espèces », a ajouté Rabinowitz. « L’espoir est que cette meilleure compréhension conduira à la prévention de futures pandémies et à des écosystèmes plus résilients. »
Rabinowitz est également directeur du UW Center for One Health Research et codirecteur de l’UW Alliance for Pandemic Preparedness.
Le projet prévoit initialement de s’associer à cinq pays d’Afrique, d’Asie et d’Amérique latine pour aider les organisations locales à mener des programmes de surveillance animale à grande échelle dans leur propre pays en toute sécurité et à tester des échantillons de virus en utilisant leurs propres installations de laboratoire. Cela évitera d’avoir à expédier des échantillons dans d’autres pays pour des tests et créera un réseau international de laboratoires capables de répondre rapidement aux épidémies.
Parce que la grande majorité des virus qui déclenchent des pandémies ont leur origine dans des animaux non humains, il est essentiel que nous découvrions lesquels des nombreux nouveaux virus zoonotiques que nous identifions actuellement sont les plus susceptibles de se propager d’une espèce à l’autre, se propageant facilement d’une personne à l’autre. et provoquer une maladie grave ou la mort.
Dre Judith Wasserheit, co-chercheuse principale et présidente, Département de santé mondiale, Université de Washington
« L’UW Alliance for Pandemic Preparedness se concentre sur une approche systémique proactive et intégrée de la préparation à une pandémie qui a réuni des leaders internationalement reconnus dans les types de méthodes de laboratoire qui permettront à l’équipe DEEP VZN de séquencer et de caractériser complètement de nouveaux virus dans des conditions sans précédent. largeur et en profondeur », a déclaré Wasserheit, codirecteur de l’Alliance. « En outre, l’approche de l’Alliance a catalysé des collaborations entre ces scientifiques de laboratoire ; les dirigeants de One Health travaillant à l’interface de la santé humaine, animale et environnementale ; et les dirigeants de la santé mondiale qui travailleront avec des collègues dans les pays cibles pour identifier les emplacements à haut risque et des sous-populations à l’interface homme-animal. »
Le projet DEEP VZN se concentrera sur la recherche d’agents pathogènes auparavant inconnus de trois familles virales qui ont un grand potentiel de propagation virale des animaux aux humains : les coronavirus, la famille qui comprend le SARS-CoV-2, le virus qui cause le COVID-19 ; les filovirus, comme le virus Ebola ; et les paramyxovirus, tels que le virus Nipah. Avec 70 % des nouvelles épidémies virales chez l’homme d’origine animale, comprendre les menaces futures permet de protéger les États-Unis ainsi que les pays partenaires.
Les objectifs sont ambitieux : collecter plus de 800 000 échantillons au cours des cinq années du projet, dont la plupart proviendront de la faune sauvage ; puis pour détecter si des virus connus et nouveaux des familles cibles sont présents dans les échantillons. Lorsque ceux-ci seront trouvés, les chercheurs détermineront leur potentiel zoonotique, ou la capacité de se transmettre entre les animaux et les humains.
Ce processus devrait produire 8 000 à 12 000 nouveaux virus, que les chercheurs sélectionneront ensuite et effectueront le séquençage du génome pour ceux qui présentent le plus de risques pour la santé animale et humaine.
L’effort du laboratoire UW Medicine, dirigé par le Dr Alex Greninger, professeur adjoint de médecine de laboratoire et de pathologie à la faculté de médecine de l’Université de Washington, utilisera l’expertise de recherche de pointe de cinq laboratoires UW Medicine reconnus internationalement pour développer des techniques innovantes et fournir activités de référence et de soutien pour la détection et la caractérisation des virus par les laboratoires participants en Afrique, en Asie et en Amérique du Sud.
« Il est temps de se mettre au travail et de trouver de nouveaux virus », a déclaré Greninger. « Nous renforcerons les capacités dans d’autres pays pour pouvoir trouver de nouveaux virus et les caractériser dans l’espoir de mieux comprendre les coronavirus et autres virus circulant dans le monde. »
Les rôles des laboratoires UW Medicine dans ce projet sont les suivants :
- Le laboratoire Greninger du Département de médecine de laboratoire et de pathologie coordonnera la qRT-PCR et le développement de tests sérologiques à grande échelle et la formation dans le pays, la récupération du génome viral et la caractérisation des glycoprotéines virales.
- Le David Baker Lab de l’Institute for Protein Design modélisera de nouvelles glycoprotéines virales afin de déterminer le potentiel de risque sur la base de criblages in silico pour une affinité potentielle avec les récepteurs humains.
- Le laboratoire David Veesler du département de biochimie a détaillé les mécanismes d’attachement et d’entrée virale pour les nouveaux paramyxovirus et coronavirus et étendra ces études biochimiques aux nouvelles glycoprotéines virales découvertes dans les virus zoonotiques identifiés dans le projet.
- Le laboratoire Michael Gale Jr. du département d’immunologie déterminera le degré et les mécanismes de l’évasion de l’immunité innée dans les cellules humaines par de nouveaux virus.
- Le laboratoire Wes Van Voorhis du Département de médecine, Division des allergies et des maladies infectieuses, produira des protéines recombinantes pour l’analyse sérologique dans le pays, comme il l’a fait pour le SRAS-CoV-2.
Le Département de la santé mondiale de l’UW appliquera son expérience dans plus de 145 pays et son expertise en renforcement des capacités par le biais du Centre international de formation et d’éducation pour la santé, ou I-TECH, pour soutenir l’échantillonnage durable et renforcer les programmes de laboratoire dans le pays.
Outre UW et WSU, USAID DEEP VZN comprend l’expertise en virologie de l’Université de Washington à St. Louis, ainsi que la gestion des données et l’expertise dans le pays des organisations à but non lucratif de santé publique PATH, basée à Seattle, et FHI 360, basée en Caroline du Nord. . Ces partenaires ont une présence et des partenaires bien établis dans les pays des régions cibles.
« Pour nous assurer que le monde est mieux préparé à ces événements de maladies infectieuses, qui sont susceptibles de se produire plus fréquemment à mesure que les zones sauvages deviennent de plus en plus fragmentées, nous devons être prêts », a déclaré Felix Lankester, chercheur principal de l’USAID DEEP VZN et professeur agrégé. avec l’école Paul G. Allen de WSU pour la santé mondiale. « Nous travaillerons non seulement pour détecter les virus, mais également pour renforcer les capacités dans d’autres pays, afin que les États-Unis puissent collaborer avec eux dans la réalisation de ce travail important. »
