Des chercheurs britanniques ont mené une étude montrant qu'une proportion élevée de patients admis dans les unités de soins intensifs (USI) atteints de la maladie à coronavirus 2019 (COVID-19) contractent une co-infection bactérienne secondaire pendant leur séjour à l'hôpital.
L'étude de cohorte rétrospective de patients admis dans sept USI en Angleterre jusqu'au 18 maie, 2020 a constaté que plus le séjour en USI était long, plus la proportion de patients ayant développé des infections nosocomiales (nosocomiales) était importante.
Alors que la co-infection bactérienne dans les 48 heures suivant l'admission aux soins intensifs était rare, la proportion d'agents pathogènes détectés a commencé à augmenter après 48 heures. Les agents pathogènes étaient principalement constitués de bactéries Gram-négatives, en particulier Klebsiella pneumoniae et Escherichia coli.
Les patients qui ont développé ces infections étaient significativement plus susceptibles de mourir en USI que ceux sans co-infections.
«Cette étude multicentrique pragmatique fournit de nouvelles données sur la co-infection acquise dans la communauté et nosocomiale chez les patients atteints de COVID-19 nécessitant des soins en USI en Angleterre», écrit Vadsala Baskaran Nottingham University Hospital NHS Trust et ses collègues.
Les chercheurs disent que la découverte selon laquelle la co-infection chez les patients COVID-19 est rare au début de l'hospitalisation confirme les recommandations selon lesquelles les antibiotiques empiriques ne devraient pas être utilisés au moment de l'admission à moins qu'une infection bactérienne ne soit suspectée.
Il est possible que la réduction de l'exposition inutile à de tels antibiotiques puisse réduire le risque que les patients contractent plus tard des infections à Gram négatif potentiellement résistantes aux antibiotiques, ajoutent-ils.
Les bactéries Gram-positives sont plus sensibles au traitement avec des antibiotiques que les bactéries Gram-négatives car elles ont une paroi cellulaire à une seule couche qui est plus facilement pénétrée que la paroi cellulaire à double couche des bactéries à Gram négatif.
L'équipe recommande de maintenir un niveau élevé de vigilance microbiologique lors de la prise en charge des patients hospitalisés avec COVID-19
Une version pré-imprimée du papier est disponible sur le serveur medRxiv*, tandis que l'article fait l'objet d'un examen par les pairs.
Sommaire
La contribution des co-pathogènes à la maladie pendant une pandémie virale n'est pas bien comprise
Une co-infection avec d'autres agents pathogènes lors de pandémies virales a déjà été signalée.
Au cours de la pandémie de grippe de 1918, par exemple, les rapports estimaient que presque toutes (95%) des infections graves et des décès avaient été compliqués par une co-infection bactérienne, principalement une co-infection par Streptococcus pneumoniae et Staphylococcus aureus.
Suite à une infection par le SRAS-CoV-2, la réponse immunitaire comprend une augmentation de l'interleukine 6 cytokine pro-inflammatoire et de la protéine C-réactive marqueur de l'inflammation, les taux augmentant d'autant plus la maladie est grave.
Cependant, le rôle que jouent les co-pathogènes pendant l'infection par le SRAS-CoV-2 n'est pas bien compris, disent Baskaran et ses collègues.
De plus, le manque de traitements antiviraux efficaces contre le SRAS-CoV-2, ainsi que la difficulté de distinguer entre la co-infection bactérienne secondaire et le COVID-19 sévère seul, a conduit à l'utilisation généralisée d'antibiotiques empiriques comme approche de traitement de première intention. pour les patients hospitalisés COVID-19.
«Au cours de la vague printanière de la pandémie, 83,1% des patients hospitalisés au Royaume-Uni ont reçu un traitement antibiotique empirique», affirment les chercheurs. «Une meilleure compréhension de l'incidence de la co-infection chez les patients infectés par le COVID-19 et des agents pathogènes impliqués est nécessaire pour une gestion efficace des antimicrobiens.»
Enquête sur la co-infection bactérienne chez les patients gravement malades du COVID-19
Pour déterminer l'incidence et la nature de la co-infection chez les patients atteints de COVID-19 gravement malades en Angleterre, l'équipe a mené une étude rétrospective de 254 patients qui avaient effectué des séjours aux soins intensifs dans sept hôpitaux de courte durée à travers l'Angleterre.
Patients (âgés de 16 ans ou plus) atteints de pneumonie à COVID-19 qui avaient reçu un traitement depuis le point d'apparition de la maladie jusqu'au 18 maie, 2020, était décédée alors qu'elle était aux soins intensifs ou était sortie de l'hôpital.
La proportion de co-infection a été déterminée à trois moments: à l'admission en USI, dans les 48 heures suivant l'admission et au-delà de 48 heures après l'admission, pour faire la distinction entre les patients atteints de co-infection communautaire et hospitalière.
Les chercheurs ont identifié 139 pathogènes cliniquement significatifs parmi 83 (32,7%) des 254 patients étudiés.
La co-infection bactérienne dans les 48 heures suivant l'admission à l'hôpital était rare, survenant chez 4 (1,6%) des patients à l'admission et 14 (5,5%) des patients dans les 48 heures suivant l'admission.
Les agents pathogènes les plus couramment identifiés dans les 48 premières heures suivant l'admission étaient les bactéries Gram-positives Staphylococcus aureus et Streptococcus pneumoniae.
La proportion de co-pathogènes a commencé à augmenter après 48 heures en USI
Au-delà de 48 heures d'admission aux soins intensifs, la proportion de co-pathogènes détectés a augmenté jusqu'à la fin du séjour (décès ou sortie de l'hôpital).
Hormis deux organismes fongiques, tous les co-pathogènes identifiés étaient des bactéries Gram-négatives, principalement Klebsiella pneumoniae, et Escherichia coli.
«Ces agents pathogènes sont couramment associés à la pneumonie nosocomiale et respiratoire et ont été signalés comme co-pathogènes communs dans les infections à COVID-19, en particulier dans les cohortes de soins intensifs», expliquent Baskaran et ses collègues.
«La prédominance des bactéries à Gram négatif dans ces études reflète probablement une infection nosocomiale suite à un séjour prolongé à l'USI et à l'utilisation empirique d'antibiotiques», écrivent-ils.
Des analyses univariées ont montré que les patients âgés de 50 à 64 ans étaient plus susceptibles d'avoir une co-infection bactérienne que ceux âgés de 18 à 49 ans.
Les patients atteints de ces co-infections présentaient également une probabilité significativement supérieure de 78% de mourir en USI que les patients qui n'avaient pas de co-infection bactérienne.
Des précautions doivent être prises lors de l'administration d'antibiotiques
«Nos données indiquent qu'au début de l'hospitalisation, la co-infection bactérienne dans le COVID-19 est très rare et soutiennent les recommandations selon lesquelles les antibiotiques empiriques ne devraient pas être administrés systématiquement en soins primaires ou au moment de l'admission à l'hôpital sans suspicion clinique d'infection bactérienne». disent les chercheurs.
Le taux élevé de co-infection à un stade ultérieur de l'hospitalisation et impliquant des agents pathogènes nosocomiaux est préoccupant, ajoutent-ils.
«Il est plausible que la réduction de l'exposition précoce inutile aux antibiotiques chez les patients atteints de COVID-19 pourrait réduire leur risque d'infections tardives, Gram-négatives, potentiellement résistantes aux antibiotiques», écrivent Baskaran et ses collègues.
«Dans le cadre des changements saisonniers des pathogènes respiratoires, une surveillance continue des co-infections chez les patients hospitalisés avec COVID-19, idéalement par le biais d'études prospectives avec des protocoles d'échantillonnage standardisés, est conseillée», concluent-ils.
*Avis important
medRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas examinés par des pairs et, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, orienter la pratique clinique / les comportements liés à la santé, ou traités comme des informations établies.