Dans une étude récente publiée dans le Viruss journal, les chercheurs ont évalué la stabilité du coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS-CoV-2) parmi les fluides biologiques trouvés chez les animaux.
Depuis l’émergence du SARS-CoV-2 en 2019, le virus n’a cessé d’évoluer génétiquement, a sauté les barrières des espèces et a encore élargi sa gamme d’hôtes. De plus, des études récentes ont détecté une transmission interspécifique, telle que l’infection d’animaux domestiques ainsi que la circulation virale parmi la faune. Cependant, comprendre la stabilité du SRAS-CoV-2 dans les fluides biologiques animaux et leur fonction dans la transmission virale est limité puisque les études antérieures ont principalement évalué les fluides biologiques humains.
Étude: Stabilité du SRAS-CoV-2 dans les fluides biologiques des animaux. Crédit d’image : KDdesignphoto/Shutterstock
À propos de l’étude
Dans la présente étude, des chercheurs de la Kansas State University ont déterminé la stabilité du SRAS-CoV-2 dans les fluides biologiques obtenus à partir de trois espèces animales, à savoir les moutons, les chats et les cerfs de Virginie (WTD).
L’équipe a recueilli des échantillons salivaires, fécaux et urinaires de moutons, de chats et de WTD. Les impacts cytopathiques ont été évalués quatre jours après l’inoculation du SRAS-CoV-2, suivis de l’estimation du titre viral. La stabilité présentée par les variantes préoccupantes (COV) du SRAS-CoV-2, telle qu’examinée dans les suspensions fécales WTD à l’aide des COV SARS-CoV-2 Alpha, Delta et Omicron, qui ont été cultivées dans des cellules Vero-transmembrane sérine protéase 2 (TMPRSS2). Chaque stock viral a également subi un séquençage. La souche WA-1 a été cultivée dans des cellules Vero-TMPRSS2 pour créer des inoculums de virus dans des conditions comparables. L’équipe a estimé le taux de décomposition virale du SRAS-CoV-2 en examinant si les échantillons associés étaient positifs pour le virus pendant au moins deux points dans le temps.
Résultats
Les résultats de l’étude ont montré qu’après incubation du SRAS-CoV-2 dans les fluides biologiques du chat, l’équipe a noté de faibles niveaux de virus infectieux entre 100,767 et 101.633 TCID50 isolé jusqu’à un jour après la contamination (dpc) dans des échantillons de salive de chat regroupés, quelles que soient les conditions environnementales. Des échantillons d’excréments de chats regroupés ont également révélé des titres viraux entre 100,767 et 102.412 TCID50 à une heure post-contamination (hpc), alors que le virus infectieux n’a pas pu être détecté par 7 hpc.
Dans la suspension fécale à 10 % de chat mise en commun, le SRAS-CoV-2 a survécu jusqu’à un jour en hiver et dans des environnements intérieurs, avec des valeurs de demi-vie de 9,16 heures et 5,99 heures, respectivement. D’autre part, l’équipe a noté une survie virale plus longue dans les échantillons d’urine de chat. De plus, en ce qui concerne les conditions d’automne ou de printemps, le SRAS-CoV-2 a affiché une stabilité jusqu’à trois à sept jours en groupe seul avec deux échantillons d’urine de chat individuels. Notamment, les valeurs de demi-vie observées dans des conditions hivernales étaient considérablement plus courtes par rapport à celles observées dans des conditions automnales ou printanières pour les trois tests d’échantillons d’urine de chat.
Stabilité du SRAS-CoV-2 dans la salive de chat mise en commun (UN), excréments de chat mis en commun (B), chat mis en commun 10% suspension fécale (C), la salive de mouton mise en commun (D), de la salive de cerf de Virginie mise en commun (E) et les excréments de cerfs de Virginie mis en commun (F). Chaque fluide biologique a été dopé avec 5 × 104 TCID50 du SARS-CoV-2 et incubés dans des conditions intérieures (gris), estivales (rouge), printanières/automne (vertes) et hivernales (bleues). A chaque instant, le virus a été récupéré et titré sur cellules Vero E6. La régression linéaire simple a été estimée lorsque le virus infectieux était au moins présent à deux moments différents. Le titre viral est représenté par la moyenne et l’écart type du TCID transformé en log50 titres (cercle de couleur), tandis que les cercles de couleur vides représentent les négatifs en triple exemplaire. Les lignes colorées et leurs zones ombrées représentent une ligne de meilleur ajustement et un intervalle de confiance à 95 % de la régression linéaire simple. Sur l’axe des abscisses, 0,04 et 0,29 jours sont respectivement égaux à 1 et 7 h. En raison d’un volume insuffisant de salive de mouton regroupée (D), la stabilité du virus a été observée à deux moments. La ligne la mieux ajustée n’a pas été montrée dans la salive de chat regroupée dans des conditions printanières / automnales et hivernales (UN), et les excréments de cerfs de Virginie mis en commun dans des conditions estivales (F) parce que la pente de la régression linéaire simple n’était pas significativement différente de zéro.
L’incubation virale dans les fluides biologiques des moutons a montré qu’un titre viral de 102,301 TCID50 a été récupéré à 1 HPC dans des échantillons de salive de mouton regroupés dans un environnement intérieur, alors qu’aucun virus n’a été détecté dans des conditions estivales. De plus, le SRAS-CoV-2 a affiché une stabilité jusqu’à 1 dpc dans des échantillons de salive de mouton regroupés, en tenant compte des environnements de printemps/automne et d’hiver, avec des valeurs de demi-vie de 9,04 heures et 7,34 heures, respectivement. Pourtant, l’équipe n’a récupéré aucun virus infectieux à partir d’échantillons fécaux de moutons regroupés ou de suspensions fécales à 10% à aucun moment testé.
L’incubation du virus dans les fluides biologiques WTD a montré que le SRAS-CoV-2 a survécu pendant 1 dpc dans des échantillons de salive regroupés WTD, révélant des valeurs de demi-vie de 1,23 heures pour l’environnement intérieur, 1,08 heures pour l’environnement estival et 4,52 heures pour l’environnement hivernal . Le SRAS-CoV-2 a affiché une grande stabilité jusqu’à 6 dpc dans les échantillons fécaux groupés WTD, présentant une demi-vie de 6,28 heures dans des environnements intérieurs, de six heures dans des environnements d’automne/printemps et de 24,44 heures dans des environnements hivernaux. Cette découverte était en contraste évident avec les résultats des échantillons fécaux de moutons, de chats et d’humains.
Le SRAS-CoV-2 a également affiché une stabilité dans les échantillons urinaires regroupés WTD jusqu’à 21 jours par jour et a révélé une tendance à la stabilité saisonnière. D’autre part, l’échantillon d’urine d’un WTD qui a été obtenu à partir de la vessie lors de la nécroscopie a montré que le SRAS-CoV-2 n’était stable que jusqu’à 7 hpc dans les environnements d’été et d’intérieur et 1 dpc dans les environnements d’hiver et d’automne/printemps. Cela indiquait les taux différentiels de décomposition virale dans les échantillons d’urine obtenus du même sujet en utilisant différentes techniques.
Conclusion
Les résultats de l’étude ont montré que le SRAS-CoV-2 pouvait survivre jusqu’à un jour après l’inoculation dans les échantillons salivaires de moutons, de chats et de WTD. L’équipe a pu isoler le virus jusqu’à six jours dans des échantillons fécaux WTD et jusqu’à 15 jours dans des suspensions fécales WTD. Cependant, le virus était relativement instable dans les échantillons et les suspensions de matières fécales de moutons et de voitures. Bien que la fonction exacte des excrétions et des sécrétions biologiques dans la transmission virale ne soit pas claire, les chercheurs pensent que l’étude a fourni de nouvelles informations sur leur rôle dans la transmission du SRAS-CoV-2.
