Cradle, la plateforme qui aide les scientifiques à concevoir et programmer des protéines, a publié aujourd’hui les résultats de sa première enquête BioDeveloper, explorant les méthodes et les priorités des biodéveloppeurs pour dresser un tableau des tendances au sein du secteur de la biologie synthétique. L’enquête a interrogé plus de 150 biodéveloppeurs et a été menée en partenariat avec Bits in Bio, une communauté mondiale axée sur la création de logiciels pour la science.
Les principales conclusions de l’enquête comprennent :
Le codage est désormais une compétence essentielle pour les biologistes – et la plupart du temps, il est autodidacte
- Le codage est désormais une compétence essentielle pour ceux qui travaillent dans les biotechnologies. Plus de 8 répondants scientifiques de laboratoire humide sur 10 (87 %) écrivent désormais du code – avec 55 % des répondants écrivant des scripts pour automatiser les flux de travail sur une base hebdomadaire et 39 % programmant l’ingénierie des données ou des pipelines sur une base hebdomadaire.
- Une majorité rapporte que leurs compétences en codage sont autodidactes. Les trois quarts (74 %) de tous les répondants ont appris en faisant le travail, 63 % ayant appris à l’école ou dans le cadre de l’éducation
- Python était le langage de codage le plus courant 97 % des répondants l’ont utilisé au cours des 12 derniers mois pour effectuer des analyses de données. Shell (Bash/Powershell) était le deuxième langage de codage le plus courant (utilisé par 62 %), suivi de R (53 %), SQL (41 %) et HTML/CSS (13 %).
Une majorité de biodéveloppeurs utilisent déjà le Machine Learning
- L’apprentissage automatique est maintenant un outil établi en biologie. Près des trois quarts (73 %) des biodéveloppeurs ont déclaré utiliser actuellement l’apprentissage automatique dans leur travail. 26 % de ceux qui utilisent l’apprentissage automatique le font sur une base hebdomadaire, et 20 % le font sur une base mensuelle.
- 4 personnes sur 10 travaillant dans un rôle in silico utilisent actuellement le ML (80 %), 68 % des scientifiques des laboratoires humides utilisant actuellement le ML.
- L’adoption de l’apprentissage automatique devrait encore augmenter. 82 % de ceux qui n’utilisent pas encore l’apprentissage automatique dans leur travail déclarent qu’ils souhaitent le faire à l’avenir.
L’ingénierie des protéines est une priorité pour les biodéveloppeurs
- Les protéines sont un domaine d’intérêt majeur pour les biodéveloppeurs. L’enquête a révélé que 71 % des personnes interrogées travaillent déjà sur l’ingénierie des protéines ou sont curieuses de l’explorer à l’avenir.
- L’ingénierie des protéines offre une gamme variée d’applications. Les enzymes, les anticorps, les peptides courts et les protéines régulatrices des gènes étaient tous des domaines d’intérêt. 53% des personnes sont intéressées par les enzymes et 44% veulent travailler sur les protéines régulatrices des gènes dans les 12 prochains mois.
En tant qu’entreprise fondée pour faciliter la conception et la fabrication de protéines par les biologistes, nous voulions comprendre comment les biologistes utilisent la technologie dans leur travail et à quoi ils l’utilisent. Il est fascinant de voir le rôle croissant que jouent le codage et l’apprentissage automatique dans la biologie et il est clair que les scientifiques de laboratoire adoptent ces outils pour poursuivre leur travail. Avec la période rapide de croissance et de maturation des technologies d’IA, cela semble être la norme pour la façon dont les biologistes travaillent à l’avenir.
Nous avons également été frappés par l’accent mis sur la conception des protéines. Les protéines ont le potentiel d’être un outil central pour relever les grands défis du futur ; de la lutte contre le changement climatique et la pollution, à la guérison des maladies et à la génération de ressources alternatives respectueuses de l’environnement pour la nourriture, les vêtements, les matériaux et les produits chimiques. C’est fantastique de voir autant d’intérêt de la part des biodéveloppeurs pour ce secteur, car cela montre une prise de conscience croissante du potentiel des protéines pour résoudre tant de problèmes parmi les plus importants au monde.
Stef van Grieken, PDG et co-fondateur, Cradle
Bits in Bio a été créé pour fournir un espace aux personnes qui construisent à l’intersection du logiciel et de la science. Une partie importante de notre travail consiste à recueillir les commentaires de la communauté sur les outils et les technologies qu’ils utilisent au quotidien. En partageant largement ces résultats, nous espérons encourager une plus grande communication entre les biodéveloppeurs sur les meilleures pratiques. Il est clair que les logiciels deviennent de plus en plus importants pour la découverte scientifique et nous nous engageons à aider les scientifiques et les développeurs à naviguer dans cette intersection passionnante.
Nicholas Larus-Stone, créateur de Bits in Bio et PDG, Sphinx Bio
Le Etat de la Tech-Bio rapport est basé sur une enquête auprès de 157 répondants de 18 pays à travers le monde. L’enquête a été menée du 28 novembre 2022 au 5 janvier 2023
