L'Inde ayant maintenant enduré six mois de pandémie de coronavirus du syndrome respiratoire aigu sévère 2 (SRAS-CoV-2), il y a maintenant plus de 410 000 cas officiels et plus de 13 000 décès enregistrés. Presque tous ces décès sont survenus au cours des trois derniers mois, d'avril à juin, avec 100 décès le 4 avril 2020, soit presque 16 fois le 4 mai et 63 fois le 4 juin 2020.
Maintenant, une nouvelle étude publiée sur le serveur de préimpression medRxiv * en juin 2020 rend compte des résultats d'une étude de corrélation entre les conditions météorologiques quotidiennes et la propagation du virus du SRAS-CoV-2 en Inde.
Emplacement des villes sélectionnées en Inde ainsi que la population totale de ces villes.
Sommaire
Impact des facteurs environnementaux sur la propagation virale
De nombreux chercheurs ont étudié les facteurs environnementaux, notamment l'humidité, la température et le climat, afin de déterminer ce qui alimente la transmission rapide du virus. Certaines études montrent que ceux-ci sont liés à différents taux de propagation.
Avec les flambées de grippe antérieures, il a été démontré que la température de l'air affecte les paramètres épidémiques, principalement dans les régions tropicales. Pourtant, dans les zones tempérées, la grippe frappe surtout pendant les mois d'hiver. Même si certains chercheurs nient une telle corrélation, d'autres ont prédit une baisse de la transmission avec l'augmentation des températures, en Inde. Ces derniers scientifiques ont également prédit un impact plus important de la maladie dans les zones relativement plus chaudes.
Un autre domaine de recherche est la variation possible de la période d'incubation entre les différentes régions du monde. Alors que l'Organisation mondiale de la santé (OMS) signale une période d'incubation de 2 à 10 jours dans le monde, d'autres l'ont estimée à 10-14 jours, voire 2-14 jours. Pourtant, d'autres groupes indiquent que la période d'incubation est d'environ 20 jours.
Météo et incidence quotidiennes, avec corrélation décalée dans le temps
La présente étude vise à comprendre l'impact des conditions météorologiques quotidiennes sur la propagation du SRAS-CoV-2 en Inde et sa période d'incubation. Les chercheurs ont examiné cinq délais, le premier étant au jour zéro, puis au jour 7, 10, 12, 14 et 16 jours de maladie.
L'équipe a analysé les données de 9 villes de l'Inde, toutes comptant plus d'un million d'habitants, dont près de 80% du total des cas en Inde ont été signalés. Les conditions météorologiques ont été recueillies en termes de température maximale, minimale et moyenne, plage diurne de température, température du point de rosée, humidité relative moyenne, plage diurne d'humidité relative et vitesse du vent.
Tendance des cas confirmés quotidiennement dans certaines villes et dans tout le pays.
Facteurs de température et transmission virale
En utilisant des techniques de corrélation et une plate-forme d'apprentissage automatique appelée machine à vecteur de support (SVM), les chercheurs ont découvert tout d'abord qu'il existait des corrélations significatives mais de faible niveau entre la météo quotidienne et l'incidence quotidienne. Ils ont trouvé une corrélation négative significative entre l'humidité moyenne le jour de la transmission et l'incidence quotidienne jusqu'au dixième jour précédant la transmission, mais pour la plage diurne d'humidité, jusqu'à 12-16 jours avant. Cela suggère la nécessité d'en savoir plus sur la contribution de l'humidité à la propagation virale.
La plupart des paramètres de température, à l'exception de la plage diurne de température, sont moins bien corrélés le jour de la transmission et plus élevés le 14.e jour avant la transmission, la meilleure corrélation étant trouvée avec la température minimale. En d'autres termes, les scientifiques disent: « Les endroits où la température minimale est plus élevée sont plus susceptibles de transmettre le COVID-19 en Inde. »
La vitesse du vent est également positivement corrélée, peut-être parce que le vent transporte les particules virales plus loin. Les chercheurs estiment qu'avec la corrélation de la plupart des facteurs météorologiques avec le nombre quotidien de cas confirmés avec un décalage de 14 jours, la période d'incubation est probablement d'environ 14 jours en Inde.
Couplé à l'analyse SVM, le décalage de 12 jours et plus offre une forte corrélation avec les cas confirmés quotidiennement, ce qui signifie que la période d'incubation dans le cadre indien serait probablement de 12 à 16 jours. Cependant, il existe une gamme de paramètres météorologiques liés à une forte sensibilité à la propagation virale.
Gamme de variation
Autrement dit, environ 80% des cas confirmés ont été enregistrés dans une plage de température et de vitesse du vent limitée survenant 12 à 16 jours avant le rapport de cas. Ces limites sont:
- Température maximale – 33,6-41,3 ° C,
- Température moyenne – 29,8-36,5 ° C,
- Température minimale – 24,8-30,4 ° C,
- Plage de température – 7,5-15,2 ° C,
- Température du point de rosée – 18,7-23,6 ° C,
- Vitesse du vent – 4,2-5,75 m / s
Les zones relevant de cette combinaison de paramètres auraient donc été les plus vulnérables à une telle propagation. L'avantage de l'utilisation de SVM est évident en ce qu'il clarifie l'association entre les variables de température avec la transmission quotidienne. L'étude révèle que les zones densément peuplées en Inde avaient une transmission plus élevée pendant les chaudes journées d'été, comme le montre la corrélation positive entre la transmission quotidienne, la température de l'air et la vitesse du vent.
La période d'incubation semble être clairement de 12 à 16 jours, ce qui implique qu'avec les conditions météorologiques dominantes de la période d'étude, le virus pourrait continuer à se propager pendant deux semaines après son acquisition. Ainsi, malgré l'impossibilité d'incorporer des données de toutes les grandes villes à taux de transmission élevés et l'exclusion des migrants qui ont été mis en quarantaine avec la maladie, l'étude montre que «la transmission des coronavirus ne peut pas être bien corrélée linéairement avec des paramètres météorologiques uniques, plutôt une approche non linéaire multivariée doit être utilisée. » Cette approche a produit d'excellentes associations, et l'utilisation de délais pouvant aller jusqu'à 14 jours montre que la période d'incubation est en moyenne de 14 jours en Inde.
*Avis important
medRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, orienter la pratique clinique / les comportements liés à la santé, ou traités comme des informations établies.
