Dans une récente étude publiée sur medRxiv* serveur de préimpression, les chercheurs ont utilisé un modèle compartimental stochastique de la transmission du coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS-CoV-2) pour examiner divers indicateurs de surveillance sentinelle et déterminer l’effort d’échantillonnage minimal requis pour une alerte fiable indiquant une augmentation en une étape du taux de transmission .
Sommaire
Arrière plan
Aux premiers stades de la pandémie de maladie à coronavirus 2019 (COVID-19), avant que les vaccins contre le SRAS-CoV-2 ne soient largement disponibles, les gouvernements ont eu recours à des stratégies non pharmaceutiques d’atténuation des maladies telles que le confinement et les restrictions imposées aux entreprises pour limiter la transmission du virus. et alléger le fardeau du système de santé public. Bien que des interventions opportunes pour « aplanir la courbe » soient nécessaires, l’application prématurée des restrictions pourrait avoir de graves répercussions économiques, et des réponses tardives peuvent provoquer des infections généralisées et plus difficiles à contrôler.
Les politiques d’atténuation sont souvent basées sur des indicateurs de santé couramment utilisés tels que les admissions à l’hôpital et le nombre de cas signalés. Les admissions à l’hôpital surviennent souvent deux semaines après l’infection, et les cas signalés dépendent des installations de tests de diagnostic, ce qui rend ces indicateurs inadaptés à une évaluation précise et rapide de la transmission de la maladie.
La surveillance sentinelle comprend des données enregistrées sur l’apparition des symptômes, l’état et la date du test pour chaque cas ambulatoire récemment symptomatique. Les cas sentinelles peuvent fournir une alerte plus rapide pour augmenter les taux de transmission que les admissions à l’hôpital, car le délai de détection de l’infection est considérablement plus court, en particulier pour les cas moins graves qui ne nécessitent pas d’hospitalisation mais peuvent transmettre le virus dans une population.
À propos de l’étude
Dans la présente étude, les chercheurs ont utilisé un modèle compartimental stochastique susceptible exposé infecté récupéré (SEIR) pour évaluer l’efficacité des indicateurs de surveillance tels que les admissions à l’hôpital, l’occupation de l’hôpital et les cas sentinelles pour fournir une alerte en temps opportun, mais pas prématurée, à une personne. augmentation progressive de la transmission du SRAS-CoV-2.
Le modèle comprenait des statuts de symptômes allant d’asymptomatique à sévère et considérait divers résultats de la maladie tels que les besoins en hospitalisation, les besoins en unité de soins intensifs et le décès. Plusieurs scénarios de surveillance ont été évalués pour chaque indicateur.
Des efforts d’échantillonnage de cinq, 10, 20, 50 et 100 % ont été pris en compte pour les cas sentinelles afin de déterminer l’échantillonnage minimal requis pour un avertissement fiable d’augmentation de la transmission. La performance de chaque indicateur a été calculée en fonction de l’efficacité des indicateurs à fournir une alerte en temps opportun pour que des stratégies d’atténuation soient adoptées.
L’analyse coûts-avantages pour chaque indicateur de surveillance a été effectuée en utilisant le nombre de jours supplémentaires nécessaires pour atténuer la maladie et le nombre de décès évités dans chaque simulation. L’analyse a également été réalisée pour un modèle SEIR structuré par âge, avec deux groupes d’âge, un au-dessus et un en dessous de 40 ans, ayant des taux de transmission et des probabilités d’infections symptomatiques différents.
Résultats
Les résultats ont indiqué que la surveillance sentinelle ambulatoire avec une capture de 20 % des cas bénins pouvait signaler une légère augmentation de la transmission deux à cinq jours plus tôt et une augmentation modérée à sévère de la transmission six jours plus tôt que les indicateurs basés sur les admissions à l’hôpital. De plus, selon les simulations, la surveillance sentinelle a entraîné moins de fausses alarmes et moins de décès par jour d’atténuation.
L’étude a révélé que les admissions à l’hôpital étaient plus efficaces pour surveiller les taux de transmission parmi les personnes âgées que dans la population générale, car de nombreuses hospitalisations liées au COVID-19 avaient plus de 40 ans.
L’avertissement d’augmentation de la transmission dépendait du groupe d’âge qui a connu pour la première fois la hausse de la transmission, les alarmes étant retardées lorsque l’augmentation de la transmission s’est produite pour la première fois dans le groupe d’âge des moins de 40 ans. Alors qu’un échantillonnage de 20 % des cas de surveillance sentinelle a déclenché l’alarme six jours plus tôt que les admissions à l’hôpital lorsque la hausse de la transmission était uniforme dans tous les groupes d’âge, un échantillonnage supérieur à 20 % des cas de surveillance sentinelle était nécessaire pour une alerte de sept à neuf jours plus tôt lorsque la hausse de la transmission s’est produite pour la première fois dans le groupe d’âge des moins de 40 ans.
Les auteurs pensent que l’un des défis liés à l’utilisation de la surveillance sentinelle pour développer des stratégies d’atténuation est d’atteindre les niveaux d’échantillonnage minimaux, ce qui nécessite que les sites de test ambulatoires enregistrent avec diligence les dates et l’état d’apparition des symptômes. Avec la disponibilité de kits de test antigénique rapide à domicile, la stratégie de collecte des données de surveillance sentinelle devra également être reconsidérée.
conclusion
Dans l’ensemble, les résultats suggèrent que la surveillance sentinelle avec un échantillonnage de 20 % de cas récemment symptomatiques pourrait fournir une alerte fiable et rapide aux augmentations des taux de transmission de la COVID-19, malgré l’évolution des conditions de transmission. L’élaboration de stratégies de santé publique et d’atténuation des maladies basées sur un avertissement à temps pourrait aider à éviter des infections généralisées au sein d’une population tout en contournant les graves conséquences économiques des mesures d’atténuation des maladies appliquées prématurément.
*Avis important
medRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, guider la pratique clinique/les comportements liés à la santé, ou traités comme des informations établies.
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